挑战7天光速完成一篇NHANES,Day 2!

挑战的第二天,我们的主要任务是深入了解NHANES数据库的结构并进行数据提取。无论是NHANES、MIMIC还是eICU,掌握数据库的存储结构是利用这些公开数据库的第一步。 NHANES数据库的特点:1. 数据获取简单:在“数据为王”的时代,NHANES数据库的这一特点显得尤为重要。一旦了解了数据结构,数据清洗也会变得更加容易。2. 数据周期性:NHANES数据库每两年进行一次调查并上传数据,每个周期包括人口统计学、饮食数据、体格检查、实验室数据、问卷调查和Limited Access Data。其中,Limited Access Data需要申请使用,但前五个板块的数据已经足够我们发表相关的SCI文章。3. 数据文件:每个周期的数据集都包含Doc File和Data File。Doc File提供了数据集的基本介绍,如每一列指标的含义、测量方法及数据中的编码说明。Data File则是实际的数据文件,可以通过R或SPSS等工具打开。数据提取示例:以我关注的TyG指标为例,TyG是一个复合指标,计算公式为\[ \text{TyG} = \ln(\text{TG (mg/dL)} \times \text{FBG (mg/dL)} / 2) \]。我需要从实验室数据中下载TG(甘油三酯)和FBG(空腹血糖)数据,然后通过上述公式进行计算。 数据提取策略:1. 下载Doc…

今天给大家分享一篇在 2024年1月发表在《Environ Health》(1区,IF=5.3)的文章

今天给大家分享一篇在 2024年1月发表在《Environ Health》(1区,IF=5.3)的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查(NHANES)2007–2016年的数据,探讨了镉(Cd)和铅(Pb)对糖尿病肾病(DKD)之间的关系。暴露:本研究的暴露变量是参与者体内的铅(Pb)和镉(Cd)水平,这些数据是通过血液和尿液样本中的测量得到的。具体来说,研究考察了血铅(BPb)、血镉(BCd)、尿铅(UPb)和尿镉(UCd)的水平。铅和镉主要来自环境污染源,如工业排放、烟草烟雾和污染的饮食。在糖尿病患者中,这些重金属的积累可能因代谢变化而增加其对肾脏的毒性作用。结局:研究的主要结局是糖尿病肾病(DKD),这是一种糖尿病并发症,表现为肾功能衰退,通常通过尿白蛋白排泄率和/或估算肾小球滤过率(eGFR)来诊断。

NHANES高分指标推荐:MMA!

文章题目:Associations of methylmalonic acid and depressive symptoms with mortality: a population-based study DOI:10.1038/s41398-024-03015-6 中文标题:甲基丙二酸和抑郁症状与死亡率的关系:一项基于人群的研究 发表杂志:Transl Psychiatry 影响因子:1区,IF=5.8 发表时间:2024年7月 今天给大家分享一篇在 2024年7月发表在《Transl Psychiatry》(1区,IF=5.8)的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查(NHANES)2011–2014年的数据,探讨了MMA 与普通人群的抑郁症状和死亡率之间的关联程度,并评估抑郁症状是否介导 MMA 与死亡率之间的关系。 暴露:本研究的暴露变量是甲基丙二酸(MMA)的血清水平,甲基丙二酸是一种可以通过液相色谱-串联质谱法测定的线粒体毒性物质。在本研究中,甲基丙二酸用作评估线粒体功能障碍的生物标志物。…

JAMA子刊!GBD数据库挖掘!

文章题目:Worldwide Prevalence and Disability From Mental Disorders Across Childhood and Adolescence: Evidence From the Global Burden of Disease Study DOI:10.1001/jamapsychiatry.2023.5051 中文标题:儿童和青少年时期精神障碍的全球患病率和致残率:全球疾病负担研究的证据 发表杂志:JAMA Psychiatry 影响因子:1区,IF=22.5 发表时间:2024年4月…

倒计时三天|帮助所有医学生无痛搞定科研

由光速科研发起的《光速科研SCI写作投稿训练营-30天成稿第一篇|光速攥写任意类型Sci系统方法论|GBD数据库挖掘|孟德尔随机化|Nhanes | Meta分析|case report|Letter速成班》第11期还有3天就要开课啦,本月重磅更新GBD数据库挖掘全部成文方案,助力师妹师弟冲击IF10+,前10期好评如潮,平均成稿2-3篇~适用对象:所有年级(本科、硕士、博士)、所有阶段(医生、护士、基础、预防、公卫医学科研人员)的医学相关人员

挑战7天光速完成一篇NHANES,Day 1!

作为一名医学生,我最近被安排前往西藏的科室。在漫长的旅途中,我不禁思考:临床实践和科学研究,究竟哪个更为重要?尽管我暂时没有答案,但我清楚一点,那就是发表文章的脚步不能停歇。因此,在拉萨,我决定发起一项新挑战——在七天内完成一篇基于NHANES数据库的SCI论文。 挑战第一天:明确目标期刊并进行初步检索NHANES数据库是一个宝库,包含了丰富的横断面调查数据,如人口统计学、饮食数据、体格检查和实验室数据等。利用这类公开数据库进行研究的难点在于选题的时效性。一旦有了想法,就必须迅速行动。只要确认了研究的可行性,数据提取和分析便只是体力活。 选题策略:1. 确定目标期刊:我首先需要确定目标期刊,并深入阅读该期刊的文献。例如,Cardiovascular Diabetology杂志对TyG(甘油三酯-葡萄糖指数)这一指标表现出浓厚的兴趣,这也是我此次挑战想要研究的指标。 2. 初步检索:我使用“NHANES and Triglyceride-glucose index”作为关键词进行了初步检索,发现已有132篇相关文献,且大多为高分文章。 3. 深入分析:作为心内科的一员,我进一步提取了这些文献中的X和Y变量,发现我关注的Y变量尚未有研究涉及。因此,我决定将Cardiovascular Diabetology作为目标期刊,并深入了解该杂志的风格。 4. 目标期刊研究:Cardiovascular Diabetology不仅是一个高影响力的杂志,其最新的影响因子达到了1区8.5分。这进一步坚定了我选择该期刊的决心。 挑战内容:我将挑战研究TyG与一个心血管指标Y的相关性。为此,我下载了几篇类似的文献,深入学习目标期刊的风格和要求。通过这种方式,我希望能够更深入地理解NHANES数据库,并探索其在心血管疾病研究中的潜力。让我们一起踏上这段探索NHANES数据库的旅程吧!

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