挑战7天完成NHANES,Day 1!

今天发起一个全新的挑战,挑战7天完成一篇NHANES数据库SCI!今天的主要任务就是初步检索+确定目标期刊。NHANES数据库全名叫National Health and Nutrition Examination SiUrvey,是一项基于人群的横断面调查,旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。项目每年调查一个全国代表性的样本,约5000人。NHANES访谈部分包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题。体检部分包括生理测量、实验室检查等内容。数据量特别的大,涉及的相关指标很多,可以适合各个不同的科室的朋友来挖掘写作,所以近些年非常多的火热,我也来试试水,嘿嘿我首先就用简单的“NHANES”进行了初步的检索,发现目前文章非常多,高分文章不少,仔细看了看,基本集中在5分-10分居多,而且基本都是1区2区,还是可以的。因为我最近对抑郁症恰好比较感兴趣,就打算做关于抑郁症文章,又去检索了“NHANES and depression”,发文数目和文章的质量都还是不错的,那就真么定啦刚好出现在第一个文章是复旦大学最新的抑郁文章,后面全是我们之前调整的Journal of Affective Disorders,那我们就换一个目标杂志,我的目标文献就是这篇啦(DOI: 10.1080/07853890.2024.2314235),目标期刊就是Annals of Medicine。随后去深入了解了这个杂志,不是水刊,发文量和被引数都还可以,那就他啦然后有检索了我之前就有点关注的血液指标,发现他和抑郁的关系没有被写过,所以,嘿嘿,就他啦好啦,让我们一起探索NHANES数据库

双样本MR不好发?另辟蹊径

文章题目:Genetic evidence of the causal relationship between chronic liver diseases and musculoskeletal disorders 中文标题:慢性肝病与肌肉骨骼疾病之间病因关系的遗传学证据 论文亮点:本研究通过双向孟德尔随机化(MR)方法深入探讨了慢性肝病与肌肉骨骼疾病之间的因果关系。研究发现,原发性硬化性胆管炎(PSC)与前臂骨密度降低和整体骨关节炎风险增加具有因果关联,而肝细胞癌(HCC)与握力减弱有因果影响。反向MR分析未发现肌肉骨骼疾病对慢性肝病有显著因果效应。这些发现强调了对PSC和HCC患者实施全面预防措施的重要性,以降低肌肉骨骼疾病的风险,改善患者的生活质量。研究的优势在于系统地评估了慢性肝病与多种肌肉骨骼疾病的关系,并采用多种MR分析方法和敏感性分析,提高了结果的稳健性。然而,研究也存在局限性,如缺乏相关GWAS数据以分析慢性肝病严重程度与肌肉骨骼疾病的关系,以及芬兰人群的独特遗传组成可能影响IV的有效性和研究结果的普遍性。

医学探索者的日常,7天挑战完成一篇NHANES研究报告,第五天的进展来啦!

Table和Figure的数据已经准备就绪!在动手制作表格和图形之前,我深入研究了相关文献,跟着前人的脚步一步步学习。标准的NHANES文章通常包含以下几个部分,当然,我也会注意到一些文章中加入了机器学习等先进技术,但核心思路是相同的,只是在暴露选择和分析方法上有所差异。万事开头难,我们先从最基础的思路学起,然后再慢慢探索更高级的方法。下面是我今天完成的几个关键部分:– **Figure 1**:研究人群——数据来源过程。这部分简要说明了筛选数据的流程,比如我从2013-2014年的数据中筛选出了符合条件的1900人。这本质上是对数据处理过程的一个可视化展示。– **Table 1**:基线资料表——人群基本信息描述。这里我比较了抑郁组和非抑郁组之间的基线资料差异,使用了t-检验或卡方检验等统计方法。– **Table 2**:回归分析——X与Y之间有无关系。我构建了三个不同模型来评估暴露和结局之间的关系是否稳健,包括Crude Model、Model I和Model II。– **Figure 2**:限制性回归样条——X与Y的剂量效应关系。这部分展示了X和Y之间的具体关系,是直线、L型、N型还是J型?通过RCS曲线可以直观地看到,并且会检验线性和非线性关系。– **Table 3**:亚组分析——敏感性分析。这里我探讨了X与Y的关系在不同亚组中是否存在差异,比如性别、年龄、疾病状态等。🌟 完成这些主要结果后,我发现分析过程其实很简单,最耗时的是选题和数据整理。但只要方向正确,耐心和坚持总会带来成果。今天的挑战成功完成,继续保持这股劲头,向着最终目标前进!

环境因素也能做MR?北京大学团队新思路环境因素与神经退行性变的关联

文章题目:Associations of environmental factors with neurodegeneration: An exposome-wide Mendelian randomization investigation DOI:10.1016/j.arr.2024.102254 中文标题:环境因素与神经退行性变的关联:全暴露组孟德尔随机化研究 发表杂志:Ageing Research Reviews 影响因子:13.1 发表时间:2024-03 环境因素也能做MR?今天给大家分享一篇北京大学研究文章,系统探究环境因素与退行性病变的关系,非常值得模仿。 暴露:总计51种环境相关的暴露,被系统地分为四大类环境因素,包括社会经济因素、行为因素、代谢因素和身体测量。 结局:阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化症。 别人已经做过MR怎么有新意?该文章就是标准版范文,暴露关注51种环境相关的暴露,so,换结局就是一篇新文章。和NHANES一样,选题就是换指标、换疾病、换人群…… 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀!

新!强大阵容学术团队怎么做11+分双样本MR

近期,一篇2024年3月份上线的题目为“The three-dimensional porous mesh structure of Cu-based metal-organic-framework – aramid cellulose separator enhances the electrochemical performance of lithium metal anode batteries”的文章发生了非常有趣的事情。这篇文章发表在材料学1区Surfaces and Interfaces(IF 6.2),这篇文章的通讯作者是来自中国地质大学Yangai Liu…

一周科研速递:揭秘数据背后的故事

想象一下,用7天时间将枯燥的数据转化为一篇引人注目的科研文章。这不仅是一个挑战,更是一次激动人心的探险。跟随我的步伐,一起探索第三天和第四天的进展,揭开科研的神秘面纱!📊 第二天的成就:我已经将NHANES数据库的数据一网打尽,这就像是找到了一座数据宝库。现在,是时候让这些数据讲述它们的故事了。🌊 数据清洗:科研的精细艺术:数据清洗是科研过程中的一门精细艺术,它要求我们对每一个细节都精益求精。我选择了R语言作为我的得力助手,经过两天的努力,我已经将杂乱无章的数据转化为清晰、有序的信息宝库。🎯 精选变量,构筑研究的骨架:挑选恰当的变量就像是在星空中找到那颗指引方向的北斗七星。我细致筛选了年龄、性别、种族等关键协变量,以及抑郁这一核心疾病指标。这些变量将成为我们研究的坚实框架。🩺 高血压的多面性:高血压的判断远不止是非黑即白的问题。它是一个多维度的挑战,要求我们深入探索和理解。这不仅是对数据的挑战,更是对洞察力的考验。🎨 选题与数据提取:科研成功的秘诀:在这场科研探险的起点,我投入了大量时间进行文献回顾和选题规划。这就像是在茫茫大海中寻找那一条通往成功的航线。现在,数据清洗的艰巨任务已经圆满完成,接下来的分析和研究将变得轻松而有趣。如果你对这个过程感兴趣,或者渴望学习如何从公开数据库中提取有价值的数据,那就赶紧加入我们吧!留下你的评论,分享你的想法,让我们一起探索科研的奇妙世界!

老生常谈竟然发顶刊!浙江大学探究吸烟与肠道菌菌群紊乱

文章题目:Cross-talks between gut microbiota and tobacco smoking: a two-sample Mendelian randomization study DOI:10.1186/s12916-023-02863-1 中文标题:肠道微生物群与吸烟之间的串扰:两样本孟德尔随机化研究 发表杂志:BMC Medicine 影响因子:9.3 发表时间:2024-05 今天给大家分享一篇浙江大学研究团队双样本文章,该研究利用常规公开数据库,采用双样本MR,证明了吸烟与倡导菌群紊乱之间的密切关联。同时,探索神经递质在微生物群吸烟的生物学途径中的潜在作用。 暴露:吸烟相关,包括:开始吸烟的年龄(连续表型)、吸烟开始年龄(二元、曾经是一名经常吸烟者)、每天吸烟量(吸烟严重程度的连续指标)和戒烟(二元,对比当前吸烟者和以前吸烟者),终生吸烟。 结局:肠道微生物群 MR的暴露怎么找,选题怎么选?这篇文章给了我们充分的启示,吸烟是个老生长谈的话题,但是这篇文章就能发顶刊,与多个吸烟相关的暴露以及结合目前火热的肠道菌群有关系。我是否可以换结局依旧研究吸烟与XX热门结局之间的关系呢。广泛阅读文献,广泛获取信息,日读文献一百篇。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀!

医学生都来学!挑战7天一篇药靶MR,Day1!

医学生一起来学习,挑战7天完成一篇药物靶向MR,Day 1!上次我们挑战成功NHANES已经成功投稿啦,但是meta的PROSPERO还没下来,只有继续等等了,这次我们发起7天药物靶向MR挑战! Day 1:老规矩,还是设定目标期刊药物靶向MR发的文章分都很高啊,检索一下就发现基本是顶刊文章,确实这个概念比较火热,发文数量也在疯狂增长,同样的思路移植到我自己的关注的领域就是一篇新的顶刊paper所以我也来尝试挑战挑战自己! 我初步检索了一下选了个心内科的疾病,花了一些时间来选题,发现确实没有被写过,所以就开干啦,选了个并且近期发表过药靶MR的期刊作为我的目标期刊我选定了Cell and Bioscience作为我的目标期刊 选定了来自温州医科大学2024年刚发表的文章‘降糖药物靶点与胃肠癌风险的关联:孟德尔随机研究’作为我的目标文献检索了一下这可不是什么水刊,发文量和影响因子都可以这是一个生物学的综合期刊药物靶向MR投这种杂志妥妥的啊 定下目标,冲锋冲锋!

5天一篇Meta分析挑战 🌟 学术研究新技能快速掌握:Day 2!

🎓 学生的学术技能提升:五天时间,挑战完成一篇Meta分析,流程规范化,操作简单!Meta分析的步骤遵循PRISMA Checklist的标准化流程,一步接一步,成功在望!今天,我们的首要任务是在PROSPERO平台上完成注册,获取至关重要的注册编号(QS:这个编号对于投稿高分杂志非常关键,虽然不是强制要求)。通过个人邮箱注册,认真填写并提交“提问”和40个“正式答题”,审查周期可能从10天到3个月不等。注册成功后,我们就可以安心地继续后续的研究步骤。📈 PRISMA清单,学术规范的核心:PRISMA2020条目清单是撰写Meta分析的权威指南,涵盖了标题、摘要、背景、方法、结果、讨论和其他信息等关键部分。它为我们提供了撰写规范性文章的明确框架。初步的文献检索增强了我的信心,因为我发现尽管已有一些相关报道,但还没有进行过系统的Meta分析。此外,初步筛选出的9篇文章均为高质量文献,这进一步证实了我关于心衰研究方向的正确性(暗自欣喜,嘻嘻)。🔍 深入学习,准备充分:我精选了两篇顶级期刊文章进行深入学习和观摩,这让思路更加清晰,操作更加得心应手。记住,Meta分析的难度并不高,关键在于选题的创新性。一般的Meta分析可能发表在中等影响因子的期刊,但一些特殊类型的Meta分析有机会发表在高分期刊(具体是哪些?保持点神秘感,我将在后续的挑战中揭晓)。💪 大家一起行动起来:师弟师妹们,现在是时候深入思考如何选择高分Meta分析的选题了。明天,我们将开始检索、下载和筛选文献。让我们一起学习、一起进步,迎接学术挑战的第三天!

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