挑战7天完成一篇肠道菌群MR,Day 1!哈喽医学生们!Ready to challenge?这次我们发起7天肠道菌群孟德尔随机化挑战!一起加油呀! 第一天: 确定目标,初步检索!肠道菌群的MR研究非常火热,搜索“gut microbiota and Mendelian randomization”,发现高分杂志上的文章比比皆是,影响因子不差,不乏有很多一区高影响因子文章,发文数量也蹭蹭蹭,我也来发起挑战!所以我初步检索了肠道菌群,似乎在我的研究领域来说还是一篇蓝海,然后我挑选了一个比较友好的目标期刊,Journal of Affective Disorders,这个杂志是我们的老朋友啦,这可不是水刊哦,一区TOP而且进入杂志官网可以看到他的杂志目前中了61篇MR,妥妥的61篇MR,包括还有一些其他公开数据库的,说明杂志对MR文章还是比较友好的!可以冲锋所以,定下目标,我的目标期刊就是他啦!好啦,让我们一起探索肠道菌群MR,一起冲锋呀
今天分享一篇来自首都医科大学团队的双样本MR,暴露是IL-6极其受体(6个IL-6信号基因和34个sIL-6R受体基因),结局是肺动脉高压。炎症,尤其是白细胞介素-6(IL-6),已被认为是肺动脉高压发病的关键因素。因此,经典的IL-6信号传导可能是PAH颇具前景的治疗靶点。这是这篇文章能发高分的核心原因。我们完全可以进行模仿思路,换个炎症因子或者换个疾病。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Mendelian randomization study on causal association of IL-6 signaling with pulmonary arterial hypertension DOI: 10.1080/10641963.2023.2183963 中文标题:基于孟德尔随机化探究IL-6信号与肺动脉高压的因果关系 发表杂志:Clin Exp Hypertens 影响因子:12.3 发表时间:2023年12月 论文亮点…
今天分享一篇来自Journal of the American Heart Association的文章。英国格拉斯哥大学健康与福利学院的Shinya Nakada教授团队纳入超过百万人群数据进行双样本MR,提高了对精神分裂症患者早期心脏评估和治疗的认识。 暴露精神分裂症:GWAS数据来自精神病基因组学联盟(PCG); 结局动脉粥样硬化性卒中和栓塞性卒中:GWAS数据来自MEGASTROKE联盟。一个暴露与一类结局的双样本MR文章的套路操作。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目: Schizophrenia and Types of Stroke: A Mendelian Randomization Study DOI: 10.1161/JAHA.123.032011 中文标题:精神分裂症和中风类型:孟德尔随机化研究…
今天分享一篇来自武汉大学人民医院的NHANES联合的文章,通过使用 NHANES 2017-2018 的数据,应用加权多变量调整逻辑回归来评估高血压与 NAFLD 风险之间的关系。随后,使用GWAS 汇总数据进行双样本 MR 研究,以确定高血压、收缩压、舒张压和 NAFLD 之间的因果关系。 这是常规两个数据库联合文章,NHANES数据只涉及一个周期,MR是使用IEU在线数据进行分析,代码实操简单,但是文章中不仅仅是只探究了高血压,分分成了收缩压、舒张压和NAFLD的关系,这是值得学习和借鉴的。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Hypertension and NAFLD risk: Insights from the NHANES 2017-2018 and Mendelian randomization…
今天分享一篇来自北京大学第一医院的MR文章,关注肠道菌群和虚弱,使用连锁不平衡评分回归和MR评估遗传预测的肠道微生物组与虚弱之间的遗传相关性和因果关系。肠道菌群目前很火热,联合另一个研究热点虚弱,这是一个与衰老相关的临床综合症,与多种疾病的死亡风险密切相关。 但是因为数据量的很大,实操起来对于设备略有要求,找一个热点结局,就是10+分!课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目:Gut microbiome and frailty: insight from genetic correlation and mendelian randomization DOI: 10.1080/19490976.2023.2282795 中文标题:肠道微生物组和虚弱:来自遗传相关性和孟德尔随机化的见解 发表杂志:Gut Microbes 影响因子:12.2 发表时间:2023年11月 论文亮点 本研究利用基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过连锁不平衡得分回归(LDSC)和Mendelian随机化(MR)方法,探讨了肠道微生物组与虚弱(frailty)之间的遗传相关性和因果关系。研究发现,Christensenellaceae R-7与虚弱之间存在遗传相关性的提示性证据,并且通过至少两种MR方法发现12种属级的肠道微生物对虚弱具有提示性的因果效应。研究未发现水平多效性或异质性的证据。这些发现为若干遗传预测的肠道微生物与虚弱之间潜在的遗传相关性和因果关联提供了提示性证据,为未来探索肠道微生物在衰老过程中的作用及其作为干预和治疗虚弱的潜在靶点提供了参考。研究强调了需要更多的基于人群的观察性研究和动物实验来阐明这种关联及其背后的机制。 摘要 观察性研究表明,肠道微生物组与虚弱有关。然而,这些关联是否是因果关系的基础仍然未知。因此,本研究旨在使用连锁不平衡评分回归 (LDSC)…