每一种“组学”代表着对生命系统不同维度的深入探讨，并通过多角度、多时间点、多空间层次的数据获取与整合，反映生物体内复杂的分子调控网络与生理状态。 还不知道多组学概念的同学，建议收藏保存噢，一文get！拒绝晦涩！✅ ✨基因组学 ：是组学研究基础，揭示生物体全基因组DNA的组成、结构、功能、变异与进化规律，涵盖基因结构解析、染色体变异识别、全基因组关联分析、群体与比较基因组研究及单细胞基因组学应用。 ✨转录组学 ：从基因表达角度研究细胞全RNA分子（含 mRNA、lncRNA等）表达情况，揭示基因活跃程度、转录机制，借单细胞 / 时序 / 空间转录组技术剖析组织器官中不同细胞表达特征及动态变化。 ✨蛋白质组学 ：研究细胞 / 组织 / 机体中蛋白质的种类、表达水平、修饰、定位及互作网络，揭示其在不同生理 / 病理状态下的功能变化，是连接基因与表型的桥梁。 ✨代谢组学 ：研究小分子代谢物种类与含量，反映细胞生理状态，通过靶向 / 非靶向分析、代谢流追踪等，可筛选疾病标志物并揭示代谢调控机制。 ✨微生物组学 ：借助16S…
生物信息学（Bioinformatics）是研究生物信息的采集、处理、存储、传播、分析和解释等各方面的学科，以信息技术及其相关的手段对生物问题进行探索研究。 生物信息学，信息是手段，生物是核心。 也就是说我们学习的核心在于解决生物问题，信息技术则是实现目标的重要工具。因此需要我们掌握基础的编程和数据处理能力，一点不会会学得很痛苦。 🟦 1 基础编程语言 学习渠道很多，这里就不赘述啦。注意不要学成了程序员，以目标导向来制定学习计划，够用即可。 🟦 2 打好统计学基础 生信分析离不开统计学支持，尤其是在数据分析和结果验证环节涉及到大量的数据处理与可视化操作，完全没有统计学基础，那就很难进行了。 不过也建议以自己的目标（文章）为导向，学习有用的。就像学英语，学习英语的目的是为了帮助我们更好交流，而不是专门研究语言学，也不会将每个单词的来龙去脉都搞清楚。 🟦 3 文章套路，数据复现 所谓文章套路，即理解文章时应从宏观思维出发，能理解文章的逻辑思维。 而数据复现，则是对文章结构有所了解后，能进行模块化拆解还原，可以复现出所有模块的数据。 理解了生信文章套路，复现出文章数据，才在一定程度上掌握了文章的技能。 生信分析研究最主要的思想可概括为4大模块： 表达差异、功能聚类、交互网络、临床意义。 下面我结合实际案例讲解，更方便大家理解： （HOXD10为多形性胶质母细胞瘤预后不良的标志物） 上图是国内学者2021年发表于期刊 OncoTargets and…
第一段–文章基本信息 文章题目：Adjunctive effect of systemic antimicrobials in periodontitis therapy: A systematic review and meta-analysis 中文标题：全身性抗菌药物在牙周炎治疗中的辅助作用：系统评价和荟萃分析 发表杂志：J Clin Periodontol 影响因子：1区，IF=5.8 发表时间：2020年4月 第二段–本文创新点和科研启发 本文创新点和科研启发 系统性评估抗菌药物的辅助效果： 本研究通过系统综述和荟萃分析，全面评估了系统抗菌药物在牙周炎治疗中的辅助效果。研究整合了多项临床试验的数据，涵盖了不同的抗菌药物种类和治疗方案，为临床医生提供了关于抗菌药物在牙周炎治疗中应用的全面科学依据。 揭示抗菌药物的显著疗效： 研究发现，系统抗菌药物在牙周炎治疗中具有显著的辅助效果。特别是阿莫西林和克拉维酸的联合使用，显著提高了牙周炎治疗的成功率，减少了牙周袋深度和炎症标志物水平。此外，研究还发现某些抗菌药物组合在特定患者群体中表现出更好的疗效，为个性化治疗方案提供了重要参考。 为临床实践提供指导建议： 本研究的结论强调了系统抗菌药物在牙周炎治疗中的重要性，并为临床医生提供了具体的指导建议。研究建议在牙周炎治疗中，特别是在中重度病例中，考虑使用系统抗菌药物作为辅助治疗手段。此外，研究还指出了未来研究的方向，包括进一步探索不同抗菌药物组合的长期效果及其在不同牙周炎亚型中的适用性。…
MIMIC数据库 数据特点： 包含5万+ICU患者的生命体征、用药记录、实验室指标等时序数据。 💡研究思路： 预后预测模型： 综合患者的生命体征、实验室检查、用药和治疗，对患者的不良预后发生风险（死亡、并发症等）进行预测。例如，构建随机森林、XGBoost、支持向量机等机器学习模型对败血症相关急性肾损伤患者7、14、28天的全因死亡风险急性预测，并结合本地医院数据进行外部验证（PMID: 37349774）。 时间序列预测模型： 多数预后预测模型的构建仅基于患者各项指标的基线水平，这可能忽略了患者住院期间因病情进展或治疗带来的波动对于预后的影响。因此有一些利用MIMIC监测数据构建基于时间序列数据的预测模型，更精准地对患者预后进行预测。例如，使用时间序列的生命体征、实验室检查等数据，构建RNN、GRU、LSTM深度学习预测模型对ICU患者院内死亡进行预测（PMID: 36250092）。 NHANES数据库 数据特点： 涵盖美国人群健康、营养、代谢等多维度数据，支持横断面研究和死亡结局的前瞻性研究。 💡研究思路： 诊断模型： 结合基本信息、生活习惯、体检结果等多维度数据，预测疾病的发生。例如，利用肥胖和营养相关的多个综合指数（ABSI、AIP、BARD、BFP、BRI、FLI、PNI）构建机器学习模型评估老年糖尿病和高血压患者的心力衰竭风险（PMID: 40036490）。 预后预测模型： 结合NDI的死亡随访数据，构建机器学习模型对全因或特异性死亡风险进行预测。例如，结合TyG相关指标及其他潜在预测因子，构建机器学习模型预测高血压患者全因死亡风险和心血管死亡风险（PMID: 39881352）。 GBD数据库 数据特点： 整合全球204个国家/地区的疾病发病率、死亡率及伤残数据。 💡研究思路： 疾病负担预测：…
1.第一段–文章基本信息 文章题目：Investigating the associations between weekend catch-up sleep and insulin resistance: NHANES cross-sectional study 中文标题：调查周末补觉与胰岛素抵抗之间的关联：NHANES 横断面研究 发表杂志：BMC Medicine 影响因子：1区，IF=7.0 发表时间：2025年5月 2.第二段–研究思路 本研究思路 本文通过分析美国国家健康与营养调查（NHANES）2017–2020的数据，研究周末补觉（WCS）与胰岛素抵抗（IR）风险之间的关系。研究纳入了1903名成人，使用稳态模型评估胰岛素抵抗（HOMA-IR）和代谢评分评估胰岛素抵抗（METS-IR）来衡量IR，并将严重IR定义为最高四分位数。通过计算周末与工作日睡眠时长之差来确定WCS，并分为五组。研究采用加权逻辑回归和限制性立方样条分析，探讨WCS模式与严重IR风险之间的关系。结果显示，WCS时长与严重IR风险呈U型关系，约0.7–1.0小时的WCS与最低风险相关。短时WCS（0 < WCS ≤…
文章题目：The impact of carbohydrate quality index on menopausal symptoms and quality of life in postmenopausal women 中文标题：碳水化合物质量指数对绝经后妇女更年期症状和生活质量的影响 发表杂志：BMC Womens Health 影响因子：2区，IF=2.4 发表时间：2025年5月 今天给大家分享一篇在2025年5月发表在《BMC Womens Health》（2区，IF=2.4）的文章。本研究旨在探讨绝经后妇女碳水化合物质量指数与更年期症状和生活质量之间的关系。…
1.第一段–文章基本信息 文章题目：Biomaterial-based drug delivery: evaluating the safety profiles of liposomal Vyxeos 中文标题：基于生物材料的药物递送：评估脂质体Vyxeos 的安全性 发表杂志：Drug Delivery 影响因子：1区，IF=6.5 发表时间：2025年5月 2.第二段–研究思路 本研究思路 本文旨在评估Vyxeos（一种用于治疗高危急性髓系白血病的脂质体药物组合）在真实世界中的安全性。研究使用美国FDA不良事件报告系统（FAERS）数据库，收集2017年1月至2024年6月间将Vyxeos列为首要嫌疑药物的不良事件报告。通过提取患者人口统计学信息、不良事件细节等数据，利用MedDRA系统对不良事件进行分类，并采用报告比值比（ROR）、比例报告比（PRR）等统计方法进行信号检测分析，以评估Vyxeos与不良事件的关联强度。此外，还进行了亚组分析，考察不同性别、年龄和地理区域患者的不良事件特征，并分析不良事件的发生时间及结果。研究发现，Vyxeos与血液系统、感染和心脏不良事件显著相关，建议在临床使用中密切监测并采取预防措施。 3.第三段-Introdction 背景 Vyxeos（也称为CPX-351）是一种由柔红霉素和阿糖胞苷组成的脂质体药物，被批准用于治疗高危急性髓系白血病（AML），特别是治疗相关性AML（t-AML）和具有骨髓增生异常相关变化的AML（AML-MRC）。这种药物于2017年8月获得FDA批准，并在2018年获得欧洲药品管理局（EMA）的积极评价。Vyxeos在一项三期临床试验中显示出比传统“7+3”方案（7天阿糖胞苷加3天柔红霉素）显著改善总生存期的效果，中位总生存期为9.6个月，而传统方案为5.9个月。其脂质体设计旨在将两种药物以5:1的摩尔比共包载，优化协同细胞毒性并减少毒性。尽管Vyxeos在治疗某些白血病方面表现出显著的疗效，但其毒性特征与传统“7+3”方案相似，包括延长的中性粒细胞减少症和血小板减少症等副作用。 4.第四段-Methods 方法 数据来源：…
第一段–文章基本信息 文章题目：Virtual reality technology improves the gait and balance function of the elderly: a meta-analysis of randomized controlled trials 中文标题：虚拟现实技术改善老年人的步态和平衡功能：随机对照试验的荟萃分析 发表杂志：Arch Med Sci 影响因子：1区，IF=3.0 发表时间：2024年6月…
第一段–文章基本信息 文章题目：Diagnostic accuracy of the faecal immunochemical test and volatile organic compound analysis in detecting colorectal polyps: meta-analysis 中文标题：粪便免疫化学检测和挥发性有机化合物分析检测结直肠息肉的诊断准确性：meta 分析 发表杂志：BJS Open 影响因子：1区，IF=3.5 发表时间：2024年12月 第二段–本文创新点和科研启发 本文创新点和科研启发…