今天分享一篇来自广西中医药大学的双样本,结果为阴性竟然也发了一区,暴露为吸烟,结局为静脉血栓栓塞,文章提供了吸烟不影响静脉血栓栓塞风险的遗传学证据。Thrombosis and Haemostasis是一本关注静脉血栓的杂志,然后发现期刊出版了类似研究探究暴露(糖尿病、循环细胞因子)与结局(静脉血栓栓塞)的双样本MR、双向MR。So?换个暴露,这就是我的目标期刊。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:No Genetic Causality between Tobacco Smoking and Venous Thromboembolism: A Two-Sample Mendelian Randomization Study DOI:10.1055/s-0044-1781425 中文标题:吸烟与静脉血栓栓塞之间没有遗传因果关系:一项双样本孟德尔随机化研究 发表杂志:Thrombosis and Haemostasis 影响因子:6.7 发表时间:2024年2月…
今天分享一篇来自首都医科大学团队的双样本MR,暴露是IL-6极其受体(6个IL-6信号基因和34个sIL-6R受体基因),结局是肺动脉高压。炎症,尤其是白细胞介素-6(IL-6),已被认为是肺动脉高压发病的关键因素。因此,经典的IL-6信号传导可能是PAH颇具前景的治疗靶点。这是这篇文章能发高分的核心原因。我们完全可以进行模仿思路,换个炎症因子或者换个疾病。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Mendelian randomization study on causal association of IL-6 signaling with pulmonary arterial hypertension DOI: 10.1080/10641963.2023.2183963 中文标题:基于孟德尔随机化探究IL-6信号与肺动脉高压的因果关系 发表杂志:Clin Exp Hypertens 影响因子:12.3 发表时间:2023年12月 论文亮点…
今天分享一篇来自Journal of the American Heart Association的文章。英国格拉斯哥大学健康与福利学院的Shinya Nakada教授团队纳入超过百万人群数据进行双样本MR,提高了对精神分裂症患者早期心脏评估和治疗的认识。 暴露精神分裂症:GWAS数据来自精神病基因组学联盟(PCG); 结局动脉粥样硬化性卒中和栓塞性卒中:GWAS数据来自MEGASTROKE联盟。一个暴露与一类结局的双样本MR文章的套路操作。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目: Schizophrenia and Types of Stroke: A Mendelian Randomization Study DOI: 10.1161/JAHA.123.032011 中文标题:精神分裂症和中风类型:孟德尔随机化研究…
今天分享一篇来自武汉大学人民医院的NHANES联合的文章,通过使用 NHANES 2017-2018 的数据,应用加权多变量调整逻辑回归来评估高血压与 NAFLD 风险之间的关系。随后,使用GWAS 汇总数据进行双样本 MR 研究,以确定高血压、收缩压、舒张压和 NAFLD 之间的因果关系。 这是常规两个数据库联合文章,NHANES数据只涉及一个周期,MR是使用IEU在线数据进行分析,代码实操简单,但是文章中不仅仅是只探究了高血压,分分成了收缩压、舒张压和NAFLD的关系,这是值得学习和借鉴的。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Hypertension and NAFLD risk: Insights from the NHANES 2017-2018 and Mendelian randomization…
今天分享一篇来自北京大学第一医院的MR文章,关注肠道菌群和虚弱,使用连锁不平衡评分回归和MR评估遗传预测的肠道微生物组与虚弱之间的遗传相关性和因果关系。肠道菌群目前很火热,联合另一个研究热点虚弱,这是一个与衰老相关的临床综合症,与多种疾病的死亡风险密切相关。 但是因为数据量的很大,实操起来对于设备略有要求,找一个热点结局,就是10+分!课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目:Gut microbiome and frailty: insight from genetic correlation and mendelian randomization DOI: 10.1080/19490976.2023.2282795 中文标题:肠道微生物组和虚弱:来自遗传相关性和孟德尔随机化的见解 发表杂志:Gut Microbes 影响因子:12.2 发表时间:2023年11月 论文亮点 本研究利用基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过连锁不平衡得分回归(LDSC)和Mendelian随机化(MR)方法,探讨了肠道微生物组与虚弱(frailty)之间的遗传相关性和因果关系。研究发现,Christensenellaceae R-7与虚弱之间存在遗传相关性的提示性证据,并且通过至少两种MR方法发现12种属级的肠道微生物对虚弱具有提示性的因果效应。研究未发现水平多效性或异质性的证据。这些发现为若干遗传预测的肠道微生物与虚弱之间潜在的遗传相关性和因果关联提供了提示性证据,为未来探索肠道微生物在衰老过程中的作用及其作为干预和治疗虚弱的潜在靶点提供了参考。研究强调了需要更多的基于人群的观察性研究和动物实验来阐明这种关联及其背后的机制。 摘要 观察性研究表明,肠道微生物组与虚弱有关。然而,这些关联是否是因果关系的基础仍然未知。因此,本研究旨在使用连锁不平衡评分回归 (LDSC)…
NHANES数据库和MR的强强联合总是可以发高分文章,今天分享是来自重庆医科大学附属医院团队使用这两个公开数据库发文探究内脏脂肪组织(暴露)和牙周病(结局)的风险。首先通过使用2011-2014两个周期的全国健康和营养检查调查(NHANES)的数据来分析暴露和结局之间的关联。再通过双样本MR分析两者之间的因果性。结果表明:内脏脂肪组织与牙周病之间存在显著关联,内脏脂肪组织可能是牙周病风险的潜在致病因素。 联合多个数据库是我们常用的让自己双样本出彩出众的方法。文章解读完,Idea 这不就来了嘛。 文章题目:Visceral adipose tissue increases the risk of periodontal disease: Results from the 2011-2014 National Health and Nutrition Examination Survey and Mendelian randomization…
今天分享一篇2023年发表的顶刊孟德尔文章,通过作者机构就足以看出阵容十分豪华。本研究的目的是使用双样本MR来评估20种已确定氨基酸的母体血清水平对多达406,063名具有母体和/或胎儿基因型效应估计值的个体的后代出生体重的潜在因果效应。 看完过后,课题思路这不就来了么?实操数据量很大,不过万层高楼平地起,思路正确就能搞出好的结果。 研究暴露:氨基酸遗传关联的汇总数据来自最近进行的174种血浆代谢物的跨平台GWAS,其中包括20种循环氨基酸的水平。 研究结局:从出生体重GWAS中提取,使用了母体遗传变异对后代出生体重的关联的汇总数据。 文章题目:Causal effects of maternal circulating amino acids on offspring birthweight: a Mendelian randomisation study DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104441 中文标题:使用双样本MR来评估20种已确定氨基酸的母体血清水平对个体的后代出生体重的潜在因果效应 发表杂志:EBioMedicine 影响因子:11.1 发表时间:2023年2月 论文亮点 本研究通过Mendelian随机化方法,探讨了母亲血液中氨基酸对胎儿出生体重的影响。研究利用两个独立的样本集——一个包含86,507人的血清氨基酸水平的全基因组关联研究(GWAS),以及一个包含406,063人的英国生物库和早期生长遗传学联盟的胎儿出生体重的母体GWAS——来评估19种氨基酸对胎儿生长的潜在因果效应。研究发现,母亲血液中的谷氨酰胺和丝氨酸水平与胎儿出生体重增加有关,而亮氨酸和苯丙氨酸水平则与出生体重降低有关。这些发现通过一系列敏感性分析得到了支持。研究结果为母亲血液中氨基酸在健康胎儿生长中的关键作用提供了证据,并为未来优化胎儿生长的潜在干预措施(例如,孕期氨基酸补充)奠定了基础。…
今天给大家分享一篇阴性结果的MR,协和医学院乳腺肿瘤外科Jing Wang团队探究一个暴露(特应性皮炎)与多个结局(14种癌症)的关系。本质是14个双样本分析。研究结果:我们的MR研究不支持AD对癌症风险的因果关系。这一发现对AD和癌症的预防和管理都具有重要意义,因为它减少了对AD对癌症结局的潜在不利影响的担忧。将“特应性皮炎”替换成自己研究中的暴露,不就又是一篇新文章? 文章题目:Atopic dermatitis and risk of 14 site-specific cancers: A Mendelian randomization study DOI:10.1111/JDv.19380 中文标题:特应性皮炎和 14 种特异性癌症的风险:孟德尔随机化研究 发表杂志:Journal of the European Academy of Dermatology…
今天给大家分享一篇近期发表武汉大学Liaobin Chen团队文章,可借鉴选题。本文探究一类暴露(慢性肝病:病毒性肝炎、原发性胆汁性胆管炎、原发性硬化性胆管炎、肝硬化和肝细胞癌)与一类结局(肌肉骨骼疾病:骨质疏松症、骨关节炎和肌肉减少症)之间的关系,本质就是最常使用双样本,做了5*3=15次双样本。研究结论:原发性硬化性胆管炎对骨质疏松症和骨关节炎的因果关系,以及肝细胞癌对肌肉减少症的因果影响。 文章题目:Genetic evidence of the causal relationship between chronic liver diseases and musculoskeletal disorders DOI:10.1186/s12967-024-04941-1 中文标题:慢性肝病与肌肉骨骼疾病之间因果关系的遗传证据 发表杂志:Journal of Translational Medicine 影响因子:7.4 发表时间:2024年2月 论文亮点 本研究通过双向孟德尔随机化(MR)方法深入探讨了慢性肝病与肌肉骨骼疾病之间的因果关系。研究发现,原发性硬化性胆管炎(PSC)与前臂骨密度降低和整体骨关节炎风险增加具有因果关联,而肝细胞癌(HCC)与握力减弱有因果影响。反向MR分析未发现肌肉骨骼疾病对慢性肝病有显著因果效应。这些发现强调了对PSC和HCC患者实施全面预防措施的重要性,以降低肌肉骨骼疾病的风险,改善患者的生活质量。研究的优势在于系统地评估了慢性肝病与多种肌肉骨骼疾病的关系,并采用多种MR分析方法和敏感性分析,提高了结果的稳健性。然而,研究也存在局限性,如缺乏相关GWAS数据以分析慢性肝病严重程度与肌肉骨骼疾病的关系,以及芬兰人群的独特遗传组成可能影响IV的有效性和研究结果的普遍性。…
今天给大家分享一篇近期的肠道菌群MR的研究。通过采用双样本MR方法,探究了肠道微生物群和大脑皮质厚度之间的关系。 文章题目:Association of gut microbiota with cerebral cortical thickness: A Mendelian randomization study 中文标题:肠道微生物群与大脑皮质厚度的关联:孟德尔随机化研究 发表杂志:Journal of Affective Disorders 影响因子:6.6/Q1 发表时间:2024年2月20日 论文亮点 本研究通过双向两样本孟德尔随机化(MR)分析,探讨了肠道微生物群与结核病(TB)之间的因果关系。研究利用MiBioGen联盟的肠道微生物群基因组关联研究(GWAS)数据,以及UK Biobank和FinnGen联盟的结核病GWAS数据,分析了195个细菌分类群与结核病及其特定表型(呼吸道结核病RTB和肺外结核病EPTB)之间的关联。研究发现,特定肠道微生物群与结核病风险之间存在单向因果关系,其中肠道微生物群对结核病有因果效应。研究结果为肠道微生物群作为结核病预防、诊断和治疗工具的潜在应用提供了科学依据。此外,研究还强调了特定肠道微生物群在不同类型结核病发展和进展中的潜在作用。尽管存在一些局限性,如潜在的混杂因素和IV选择的不够严格控制,但研究利用公开可用的GWAS数据,减少了混杂因素的干扰,确保了因果推断的可靠性。 摘要 背景:肠道微生物群与大脑皮层发育之间的因果关系尚不清楚。我们旨在通过孟德尔随机化…