挑战7天完成一篇多变量孟德尔随机化SCI论文!经历了两轮成功挑战,我完成了两篇孟德尔随机化研究——一篇双样本分析和一篇针对药物靶点的研究。从选题、编码、绘图、写作到准备附件和表格,我一手包办。一篇已投至二区杂志,另一篇今晚将投稿。现在,我准备迎接新的挑战——多变量孟德尔随机化分析。原本打算挑战中介孟德尔随机化,但鉴于中介分析建立在多变量基础之上,我决定从简到难,循序渐进,为未来写作中介孟德尔随机化研究打下坚实基础。今天是新挑战的第一天:我开始收集资料,检索关键词:“Multivariable Mendelian Randomization”。大多数相关论文都发表在二区杂志(影响因子5-10分),如《International Journal of Cancer》(中科院一区,影响因子6.4)和《Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine》(中科院二区,影响因子5.4)。最新的一篇则发表在《Journal of Affective Disorders》(中科院二区,影响因子6.6)。虽然这类论文在7600多篇孟德尔随机化文献中只占1015篇,但几乎所有的单因素/双样本研究都可以转化为多变量研究,这意味着这是一个潜在的研究蓝海。 除了检索信息,我还下载了近十篇最新文献进行深入研究。今天,正式开始挑战!❤注:挑战将在非工作时间进行,所有步骤都是即兴构思(大家可以借鉴我的科研方法,按照提供的思路完成SCI论文创作),从零开始,主打原创!欢迎大家围观和支持!
非OA期刊|仅用7天写完的论文被中科院二区期刊接收!最令人兴奋的是,我没有花一分钱的版面费,而且是在一个质量上乘的二区非水刊,短短2个月就获得了接收。这也证明了我的快速写作框架是有效且可靠的。
七天孟德尔SCI挑战圆满结束!实际上,很多准备工作我已经在前几天完成了。分享一个小技巧:阅读文献时,我会把有价值的句子或观点保存到我的微信对话框里。写讨论部分前,我就会回顾这些笔记,有时稍微调整下语序就能使用。来聊聊我的药靶孟德尔随机化写作思路吧:首先,选定一个疾病(查看gwasieu是否有对应的Gwasid→如果有,就可以考虑作为候选→然后提取对应蛋白的所有SNP→用这些工具变量(蛋白)与结局变量进行MR分析→筛选出有正面效应的蛋白→在相关网站查询对应的基因和药物→之后可以进一步做SMR和共定位分析→最后整合成论文。(这个过程非常复杂,一次循环错误可能意味着两天努力白费,建议新手从简单的两样本分析开始,我教学也是逐步深入的。)先来谈谈第7天的进展:制作了机制图(figure1)、增加了引用(Endnote20)、完善了结构性语句(包括伦理声明、致谢、作者贡献及利益冲突声明)以及对论文进行了最后的润色。分享一下心得体会:一篇高质量的研究论文应包括以下统计分析和结果描述:➢ 利用TwoSampleMR软件包进行统计分析。➢ 从GWAS summary数据库中提取SNP及其统计数值作为工具变量。➢ 运用如Steiger过滤法等手段筛选工具变量。➢ 使用phenoscanner消除混杂因素。➢ 主要采用IVW方法。➢ 加权中位数和MR-Egger回归用于敏感性分析。➢ 通过Cochran Q测试评估异质性。➢ 利用MR-Egger回归的截距来评估多效性和应用MRPRESSO。这些就构成了孟德尔随机化分析的核心步骤。 💖注:接下来我会继续挑战更多孟德尔相关的研究,可能会适当延长挑战时间(因为实在太忙了!)
【7天药靶孟德尔随机化SCI挑战:第4~5天总结】🔬💻🌟 挑战进展:– 经历了设备升级的挑战,我转移到配备有双3070显卡的设备(酒店)继续跑代码,这显著提高了工作效率。 – 药靶孟德尔随机化分析的主要挑战在于处理大量数据和筛选蛋白质,这是一个时间密集型的过程。 📈 今日成果:– 成功提取了4500+个工具蛋白和50000+SNP,完成了药靶孟德尔随机化分析,并生成了森林图。– 文章的主体部分(包括效应基因的分析)已基本完成,剩余的工作主要是补充SMR和共定位分析,以及最终的论文润色。 🤔 思考与建议:– 在科研和论文写作中,重要的是明确目标和需求。如果目标是顺利毕业或快速发表文章,那么学习系统化的SCI论文写作可能比深入研究复杂的方法学更为重要。– 对于想要顺利毕业的研究生来说,掌握如何快速撰写SCI论文的技巧至关重要,而不必过分深入复杂的方法学,如高级孟德尔随机化分析。– 我准备的课程将覆盖从文献阅读到论文写作的全过程,以及孟德尔随机化、meta分析、AIGC、NHANES数据库等方法学。 ❤️ 资源分享:– 图五包含了用于GWAS数据提取的网址,这是一个宝贵的资源,希望对大家有所帮助。🎯 接下来的计划:– 完成论文的最后润色和准备投稿工作。感谢大家的关注,希望我的分享能够帮助到正在科研路上努力的你们!祝大家早日发表SCI论文!
🔬💡🌟 挑战进展: – 在药靶孟德尔随机化的研究中,我主要考虑了两种思路:验证药物靶点(旧药新用途)和筛选药物靶点。由于我对药物及其机制的了解有限,我选择了后者作为研究方向。– 参考了相关范文,如DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2021.0005和DOI: 10.1093/brain/awad070,以获取更多灵感和方法论。 🚀 当前困境:– 由于电脑配置限制,运行蛋白质相关的工具变量分析速度较慢,这对进度造成了影响。如果明天早上仍未完成,可能需要更换设备或调整挑战计划。– 尽管如此,今天阅读了大量关于药靶的文献,发现文章难度并不大。一旦数据和图表准备就绪,就可以开始撰写论文。 📖 药靶孟德尔随机化的核心:– 药物靶向MR的关键在于使用mRNA、蛋白质或其他生物标志物作为暴露因素。这些因素在因果链中更接近结局,因此分析结果通常更为稳健。 – 在常规双样本孟德尔随机化的基础上,结合SMR(Summary-data-based Mendelian Randomization)和共定位分析,可以有效进行研究。当然,还有更多的探索空间,但首先需要掌握双样本孟德尔随机化的基本方法。❤ 思考题:– 我想问小红薯的朋友们:你们进行科研、写论文的目的是什么?欢迎在评论区分享你们的想法和动机。期待大家的回答和对这个挑战的关注!
🤡施一公老师在一次演讲中告诫年轻学者: “不要花时间去拉关系,尽全力做研究,以实力取胜!其实,一个人的尊严、学术地位、以及别人发自内心的尊重,永远不可能靠拉关系获得,只能来源 于自己真正的学术修养和贡献。” 😥有人的地方就有江湖,医院同样如此,上班后更能体会到施一公老师告诫的含金量。 刚进医院时,主任跟我说,一个新人医生刚到科室,要站稳脚跟挺难的,积极搞好关系,不要只是埋头干活。 🤷♂️这话很直接,但对我实在不受用,不愿去交际。 在医院要立足,用实力证明自己,搞科研是绕不过去的砍,有条件就收集数据,没有条件就去挖掘数据库,平时工作就会留意很多好的选题,有点子就冲,现在是科室科研成果最多的,实力摆在那里,真的无需过度去巴结任何人! 🟡一些写论文的小技巧:1️⃣坚持输入要写好科研论文,必须先养成读英文文章的习惯,争取每天30-60分钟。刚开始可以选择以读英文报纸、英文新闻为主,逐渐转为读专业杂志。2️⃣逻辑为王写科研论文,最重要的是逻辑。逻辑的形成来自对实验数据的总体分析。必须先讨论出一套清晰的思路,然后按照思路来做图(Figures),最后才能执笔。3️⃣最短时间拿出初稿写作时,全力以赴,尽可能不受外界事情干扰(关闭手机),争取在最短时间内拿出第一稿。4️⃣从模仿开始学会照葫芦画瓢。没有人天生会写优秀的科研论文,都是从别人那里学来的。科研文章里的一些话是定式。5️⃣好文章都是改出来的第一稿写完后,给自己不要超过一天的休息时间,开始修改第二稿。修改时,还是以逻辑为主。6️⃣不要在不重要的地方绣花第二稿以后的修改,主要注重具体的字句,不会改变整体逻辑了。 🚩还有一点,如果是没有发过SCI,初学者建议先学习meta分析,因为它是文献的二次检索,学会后对文献检索、文献筛选、统计分析、SCI写作能力都能提升。 并且能够在短时间内得到正向反馈(快速发表一篇SCI) 让人更容易坚持,入门科研必学,能为以后科研打下基础! 🉑留下方向,~欢迎联系我。