众所周知生信分析可以应用于基因组学、蛋白质组学、微生物学等不同领域,可以帮助咱们更好地理解基因和蛋白质的功能,以及微生物群落的结构和功能,还可以用于临床研究,正是因为应用这么广泛,生信才会一直爆火。 但随着生信分析井喷式增长,现在的生信分析已经没有往些年好发了,不少人抱怨辛苦写的生信分析又烂手里了! 今天特地为大家搜集了7个生信研究热点,学会跟热点,找准生信分析风口,发表机会才更大哦! 由于字数原因,上图每个方向都给大家做了解释,总结了研究套路,还找了值得学习的文献,就不再此赘述啦(一定要看!纯干货!) 省流版7大热点方向: 1️⃣巨噬细胞 2️⃣中性粒细胞外诱捕网(NETs) 3️⃣瘤内菌群 4️⃣共病 5️⃣双硫死亡 6️⃣血管生成拟态 7️⃣mG7修饰 —— 很多医学生还在观望,要不要花精力去学习生信分析,不管身边人怎么说,你只需要记住,无论什么时候,生信分析都值得医学生去学。 生信分析不仅仅是能满足医学生持续发文的需求,而且是像英语一样的必学技能,可以帮你懂得如何利用大数据,如何分析自己的数据,如何利用别人的数据为自己研究添砖加瓦。 就这么说吧,虽然生信分析难啃,但啃下来,对医学生终身受益!(亲身体会) 生信分析的广泛应用 生信分析可以应用于基因组学、蛋白质组学、微生物学等不同领域,可以帮助更好地理解基因和蛋白质的功能,以及微生物群落的结构和功能。近年来,生信在临床研究中应用广泛,其热度一直不减。 然而,随着生信分析的广泛使用,竞争愈加激烈。想在这个领域发表高质量文章,必须抓住当前的研究热点。 今天特别为大家搜集了7个生信研究热点,学会跟热点,找准生信分析风口,发表机会才更大哦! 1. 巨噬细胞 巨噬细胞拥有两种亚型(促炎作用的M1和抗炎作用的M2),它们在多种疾病或肿瘤的发生和治疗中有重要影响。同时,巨噬细胞与免疫调控组的复合研究近几年涌现不少高分佳作。 相关生信研究思路 比较经典的思路是联合单细胞转录组和bulk转录组分析巨噬细胞的相关标记物。…
今天要给大家推荐一本公共数据库友好的SCI期刊——Frontiers in Public Health ⭕️接收文章方向:老龄化与公共卫生、儿童与健康、临床糖尿病、数字公共卫生、灾害和急救医学、环境健康与暴露组学、卫生经济学、传染病:流行病学和预防、伤害预防和控制、生命历程流行病学和健康方面的社会不平等、职业健康与安全、行星健康、公众健康教育及推广、公共卫生政策、公共卫生和营养、公共精神卫生、辐射与健康、物质使用障碍和行为成瘾。 ⭕️接收文章类型:Meta、临床研究、原始研究、孟德尔都可以。没有明确的公共卫生相关性,不适合在本期刊上发表。此外,与公共卫生实践或政策无关的纯预测或预后模型的研究将不予考虑。该杂志不接受有关简单文献计量学研究的论文,也不鼓励发表横断面研究,但有例外。 ⭕️投稿小tips:系统评价类文章必须遵守 PRISMA 指南并得出与公共卫生相关的结论。孟德尔随机化研究结果的手稿需要附有完整的 STROBE-MR 检查表。 今天的学员案例就是投递的这个期刊,一起来看看吧~ 接收期刊:Frontiers in Public Health 📉IF=3;中科院3区SCI 📍发文方法:挖掘NHANES数据库 🔬研究方向:【儿科方向】
文章题目:High-density lipoprotein cholesterol level and risk of muscle strength decline and sarcopenia in older adults DOI:10.1016/j.clnu.2024.08.017 中文标题:老年人高密度脂蛋白胆固醇水平与肌肉力量下降及肌肉减少症风险 发表杂志:Clin Nutr 影响因子:1区,IF=6.6 发表时间:2024年10月 今天给大家分享一篇在 2024年10月发表在《Clin Nutr》(1区,IF=6.6)的文章。本研究旨在研究 HDL-C…
文章题目:Associations of C-reactive protein-albumin-lymphocyte (CALLY) index with cardiorenal syndrome: Insights from a population-based study DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37197 中文标题:C 反应蛋白-白蛋白-淋巴细胞 (CALLY) 指数与心肾综合征的关联:基于人群的研究得出的见解 发表杂志:Heliyon 影响因子:1区,IF=3.4 发表时间:2024年9月 今天给大家分享一篇在 2024年9月发表在《Heliyon》(1区,IF=3.4)的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查(NHANES)1999–2010年的数据,探讨C反应蛋白-白蛋白-淋巴细胞 (CALLY)…
文章题目:Comparing caloric restriction regimens for effective weight management in adults: a systematic review and network meta-analysis DOI:10.1186/s12966-024-01657-9 中文标题:比较热量限制方案对成人有效体重管理的效果:系统评价和网络荟萃分析 发表杂志:Int J Behav Nutr Phys Act 影响因子:1区,IF=5.6…
文章题目:Cardiometabolic index and the risk of new-onset chronic diseases: results of a national prospective longitudinal study DOI:10.3389/fendo.2024.1446276 中文标题:心脏代谢指数与新发慢性病风险:全国前瞻性纵向研究结果 杂志:Front Endocrinol 影响因子: 2区,IF=3.9 发表时间: 2024年10月 今天给大家分享一篇在2024年10月发表在《Front…
文章题目:Association between DNA methylation predicted growth differentiation factor 15 and mortality: results from NHANES 1999-2002 DOI:10.1007/s40520-024-02896-3 中文标题:DNA 甲基化预测生长分化因子 15 与死亡率之间的关联:1999-2002 年 NHANES 的结果 发表杂志:Aging Clin…
文章题目:A real-world pharmacovigilance study of FDA Adverse Event Reporting System events for pralsetinib DOI:10.3389/fonc.2024.1491167 中文标题:针对 pralsetinib的FDA不良事件报告系统事件的真实世界药物警戒研究 发表杂志:Front Oncol 影响因子:2区,IF=3.5 发表时间:2024年11月 今天给大家分享一篇在2024年11月发表在《Front Oncol》(2区,IF=3.5)的文章。本研究旨在根据美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)分析普拉塞替尼的上市后不良事件(AE)信号,为临床实践提供指导。 研究方法:所有AE报告均从FAERS数据库中获取,时间为2020年第一季度(Q3)至2024年第二季度(Q2)。分析时采用了各种信号量化技术,包括报告比值比、比例报告比、贝叶斯置信传播神经网络和基于多项伽马泊松收缩器(MGPS)的经验贝叶斯几何平均值。 Table&Figure 结果解读:在FAERS数据库中的8,341,673份病例报告中,记录了1,064份pralsetinib作为“主要疑似(PS)”AE的报告,涵盖26个系统器官类别和256个首选术语。在这些报告中,62.5%来自消费者而非医疗保健专业人员。最常见的系统是全身性疾病和给药部位状况(n…
进度汇报:处理结果+跑出图表+完成前期写作 这么快已经到第四天啦! 前两天我已经把数据都跑完了, 汇总表格以及结果图都也已经出来啦~ 接下来就是根据我们的要求进行数据筛选, 然后根据筛选的结果, 选出相应的留一法图、森林图、散点图、漏斗图, 并整理在一起就好啦! 现在数据要求越来越高了, 我设的矫正P值小于0.05, 这种筛选标准也比较符合目前审稿人的要求~ 根据目标文献, 我还需要根据我的结果做出森林图以及相关热图, 拿出准备好的代码, 将数据替换成自己的, 就可以完美的跑出结果啦~ 今天科室里不忙, 结果跑完还有一定的时间富余, 那就开始写作的部分吧~ 模仿把方法和结果部分写了, 就回去休息咯~ 今日份挑战成功~大家都跟上我们的节奏了吗~
1. 如果一个检索词没有在PubMed中找到主题词,可以直接用自由词检索吗? 可以的。如果Mesh主题词表里面没有检索到主题词,那么可以直接根据自由词检索。 一般而言,没有检索到对应主题词的主要原因是疾病名词为复合名词,例如“晚期乳腺癌”,本质是“晚期”+“乳腺癌”的复合词。 因此,检索主题词时最好的方法是拆分为两步:第一步检索“晚期”主题词,第二步检索“乳腺癌”主题词。这样操作可以有效找到所有相关的主题词。 2. 找不到英文文献全文是否可以删除? 不可以。对于Meta分析而言,文献和数据是最重要的,纳入的文献越全越好,直接删除英文文献显然不是一个好选择。 对于下载全文需要付费的文献,可以利用以下方法获取: 论坛求助:如香园、求助板块、小木虫等。 文献求助平台:全国图书馆参考咨询、谷歌学术。 直接联系作者:通过邮件询问是否可以提供全文。 如果尝试后仍未找到全文,可以在Meta分析中标注为“未找到全文”,但不建议轻易删除相关文献。 3. 文献搜索范围是否需要加入CNKI等国内数据库? 是否需要纳入国内期刊,主要取决于审稿人。按照Meta分析的要求,要全面检索,应该检索国内数据库。但放到具体的投稿来看,不同的期刊审稿人的要求和偏好也不同: 如果目标是投SCI,则不推荐检索中文数据库,中医等学科除外。 这类学科必须要检索国内数据库,以满足学术需求。 4. 检索到的文献经筛选只有四篇符合的,可以做Meta分析吗?如果不可以最少需要纳入多少篇文献? 这个问题没有标准答案,一般来说: 一篇Meta分析的要求可合并的数量和结果≥2即可以分析。 但我们常看到的高级别Meta分析,最少需要5篇,质量略低一点的中等文Meta分析偶尔会出现3篇的情况。 如下图所示,为3篇文献Meta分析的例子: 5.…