新颖选题1区6分!哈尔滨医科大学探究支链氨基酸和癌症关系

文章题目:Association of plasma branched-chain amino acid with multiple cancers: A mendelian randomization analysis DOI: 10.1016/j.clnu.2023.10.019 中文标题:血浆支链氨基酸与多种癌症的关联:孟德尔随机分析 发表杂志:Clinical Nutrition 影响因子:6.3 发表时间:2023年10月 今天给大家分享一篇来自哈尔滨医科大学李颖团队一区TOP 6.3分文章,探究支链氨基酸和多种癌症之间的关系,最后表明循环总支链氨基酸水平、亮氨酸水平、异亮氨酸水平和缬氨酸水平升高,患鳞状细胞肺癌的风险更高。 暴露:来自UKB(22个评估中心招募了50多万名年龄在37岁至70岁之间的参与者,并收集了2007年至2010年的基线血液样本) 结局:国际肺癌联盟、FinnGen生物银行、胰腺癌队列联盟1、乳腺癌协会联盟、EBI数据库和卵巢癌国家联盟。 同样,本研究数据量巨大,毕竟是使用了UKB的数据,并且包括了多个癌症结局,本质是双样本,思路完全可以借鉴。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀!

用心的教学就是会吸引参与进来的每一个小伙伴都不知不觉间自觉专注起来,沉浸在一点点解开问题,一步步构建完成自己的paper,回过头来发现原来自己可以这么快速的成稿,之前的诸多困扰已经不复存在。

医学生都来学!挑战五天一篇Meta分析,Day 2!

Meta分析的操作是流程是模板化的,根据PRISMA Checklist要求一步一步逐渐操作就好啦!!Meta分析的挑战相对来说是比较简单的,Meta分析的流程是固定的,只要按照标准操作来,一定可以挑战成功! 在具体实操之前,我先去PROSPERO上面进行注册,获得注册编号(QS:这个编号很重要哦,一些高分杂志投稿时基本都要提供这个编号,但不一定是必须的)。用自己的邮箱进行注册,依次完成里面的一些“提问”和40个“正式答题”,答题完毕并确认无误后,提交注册,审查时间为10天~3个月。注册完毕,安心等待就好啦,等待过程中就可以抓紧进行后面的步骤.文章不规范,拒稿两行泪,PRISMA是行业规范,必须要读!PRISMA2020条目清单主要包括了:标题、摘要、背景、方法、结果、讨论、其他信息等。实际上就是指导规范的写文章。文章的初步检索让我倍感信心,因为有一些文章有报道,但是没有文章做过相关的meta分析,而且初步来看,这9篇文章都是高分文献,说明我关于心衰的选题方向没有问题(偷着笑了,嘻嘻)工欲善其事、必先利其器,找了2篇顶刊文献进行观摩、学习,思路清晰,操作简单。 注释:任何类型的Meta都不存在难度,所以Meta分析的发文量每年都很巨大,但是Meta的选题确是核心,一般的Meta分析可能在3分左右,但是一些特殊类型的Meta可以发高分文章(有哪些呢?卖个关子,我后面继续发起挑战)。大家一起学起来、动起来,师弟师妹们可以多花些时间思考高分meta,明天我们就检索、下载、筛选文献啦!

肠道菌群再冲一区6.6分,值得借鉴!

文章题目:Causal relationship between gut microbiota and tuberculosis: a bidirectional two-sample Mendelian randomization analysis中文标题:肠道菌群与结核病的因果关系:双向双样本孟德尔随机化分析论文亮点:本研究通过双向两样本孟德尔随机化(MR)分析,探讨了肠道微生物群与结核病(TB)之间的因果关系。研究利用MiBioGen联盟的肠道微生物群基因组关联研究(GWAS)数据,以及UK Biobank和FinnGen联盟的结核病GWAS数据,分析了195个细菌分类群与结核病及其特定表型(呼吸道结核病RTB和肺外结核病EPTB)之间的关联。研究发现,特定肠道微生物群与结核病风险之间存在单向因果关系,其中肠道微生物群对结核病有因果效应。研究结果为肠道微生物群作为结核病预防、诊断和治疗工具的潜在应用提供了科学依据。此外,研究还强调了特定肠道微生物群在不同类型结核病发展和进展中的潜在作用。尽管存在一些局限性,如潜在的混杂因素和IV选择的不够严格控制,但研究利用公开可用的GWAS数据,减少了混杂因素的干扰,确保了因果推断的可靠性。

JAMA子刊百万例MR分析探究噻嗪类利尿剂能否预防肾结石?

文章题目:Mendelian Randomization Analysis of Genetic Proxies of Thiazide Diuretics and the Reduction of Kidney Stone Risk DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2023.43290 中文标题:噻嗪类利尿剂遗传代理与降低肾结石患病风险的孟德尔随机化分析 发表杂志:JAMA Network Open 影响因子:13.8 发表时间:2023年11月 今天给大家分享一篇JAMA子刊MR探究噻嗪类利尿剂能否预防肾结石,最后结局表明噻嗪类利尿剂的遗传代理与肾结石风险降低有关。数据来源于:百万退伍军人计划、英国生物银行和 FinnGen…

挑战7天光速完成一篇NHANES,Day 2!

第2天主要任务:数据库的认识NHANES数据库听名字就知道和我们的MIMIC、eICU 一样是一个公开数据库,但是这个数据库的比较特别的点在于数据获取相对来说比较的简单,也就是说能非常方便的就下载到原始数据,这对我们这些“临床牛马”来说是非常利好的。之前也尝试过搞MIMIC,数据量太大了,本地安装数据库装了很久都没装上,NHANES就没有这个烦恼,可以疯狂冲锋冲锋 利用公开数据库发文章,最重要的就是要知道数据库的数据组成,他有那些数据,才能知道我可以利用些什么样子的数据进行idea构思。NHANES是关于营养调查的健康和营养的信息,是一个横断面的调查。从网站上我们可以看到,数据内容是非常丰富的。里面有不同的年份,比如“2013-2014”,我们叫一个周期,因为NHANES每2年上传一次相关数据。每一个周期里面有很多数据,但是我们主要利用的是(Data, Documentation, Codebooks),里面是包括了人口统计学、饮食数据、体格检查、实验室数据、问卷调查和Limited Access Data,我们最常用的是前5个,Limited Access Data数据需要申请,需要的批准候才行。 点击进去后就可以看到Doc File和Data File,我们可以通过Doc File刊这个数据集的一些基本介绍,点击Data File就能下载数据,然后利用R或者SPPS就能打开这个XPT的数据集文件因为后面也会用得到NHANES里面的数据, 所以我花了一些时间把所有的周期的所有数据全部下载完了哈哈哈,这个工作量还是很大的好啦,今天的分享就到这里啦!

医学生都来学!挑战5天Meta分析速成记,Day 1

医学生都来学!挑战5天Meta分析速成记,Day 1!做了很多孟德尔随机化相关的挑战,关注我们,跟着我们学习的人,都取得了不小的成绩,发表了属于自己的SCI。随着孟德尔随机化投稿难度加大,我们开始一些新的类型挑战,提高大家论文接收率!今天开始新的挑战!医学生学起来,尤其是还没有文章的。 第1天:收集信息。检索关键词:“Meta”,发文量、发表的杂志影响因子和分区都还不错,Human Vaccines & Immunotherapeutics(Q1,4.8),Journal of Environmental Sciences(Q1,6.9),仔细留意一下,把sort by调整成:publication date,最近出版的就是类似于Gene这样的分区可以的3-5分文章。说明Meta分析还是很有市场,都冲起来!总文章362662篇,每年都在增加,相当于每年都有4-5万篇的见刊量今年才见刊1万篇,还有30000篇的空间给大家发挥。就我看来和实际投稿,Meta分析的投稿难度是低于孟德尔随机化。尤其综述可以毕业的学校,Meta分析的性价比就比较高了,本科生有一篇二区以上Meta基本保研get。由于临床研究生时间紧迫,在有限的时间里阅读了大量的文献,却没有时间写一份质量上乘又会得到关注的综述性文章。现在跟着我的思路写起来吧除了检索信息,我还下载了10+近期Meta的范文,先精读,今天挑战就算开始啦! ❤注释:挑战时间为非工作、考试/原定学习计划时间,所有步骤都是现想(大家可以模仿我的思路),非已有课题主打从0开始!好了,第一天的挑战就这样愉快地结束了!明天我们将进入更加精彩的环节!敬请期待哦!🎉

高性价比的Science子刊!双向MR探究抑郁和虚弱关系

顶刊怎么做MR?? 武汉精神卫生中心、武汉大学团队使用双向MR探究抑郁和虚弱之间的关联,研究从遗传学的角度提供了虚弱和抑郁症之间双向因果关系的证据。 咋一看,双向MR就能Science子刊?? 仔细读文章发现本研究暗藏玄机。原来数据来源:英国生物样本库和TwinGen荟萃分析中获得了虚弱的GWAS数据,从精神病学基因组学联盟和FinnGen获得了抑郁症GWAS数据。 但是文章思路清晰,易于模仿,完全可借鉴,顶刊不是梦。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Association between frailty and depression: A bidirectional Mendelian randomization study DOI: 10.1126/sciadv.adi3902 中文标题:虚弱与抑郁症之间的关联:一项双向孟德尔随机化研究 发表杂志:Science Advances 影响因子:13.6 发表时间:2023年9月 论文亮点 本研究采用孟德尔随机化(MR)方法,探讨了虚弱与抑郁之间的双向因果关系。通过分析来自UK Biobank和TwinGen的虚弱基因组关联研究(GWAS)数据,以及来自Psychiatric…

医学生极限挑战之7天完成NHANES,Day 1!

今天发起一个全新的挑战,挑战7天完成一篇NHANES数据库SCI! 今天的主要任务就是初步检索+确定目标期刊。NHANES数据库全名叫National Health and Nutrition Examination SiUrvey,是一项基于人群的横断面调查,旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。项目每年调查一个全国代表性的样本,约5000人。NHANES访谈部分包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题。体检部分包括生理测量、实验室检查等内容。数据量特别的大,涉及的相关指标很多,可以适合各个不同的科室的朋友来挖掘写作,所以近些年非常多的火热,我也来试试水,嘿嘿 我首先就用简单的“NHANES”进行了初步的检索,发现目前文章非常多,高分文章不少,仔细看了看,基本集中在5分-10分居多,而且基本都是1区2区,还是可以的。因为我最近对抑郁症恰好比较感兴趣,就打算做关于抑郁症文章,又去检索了“NHANES and depression”,发文数目和文章的质量都还是不错的,那就真么定啦刚好出现在第一个文章是复旦大学最新的抑郁文章,后面全是我们之前调整的Journal of Affective Disorders,那我们就换一个目标杂志,我的目标文献就是这篇啦(DOI: 10.1080/07853890.2024.2314235),目标期刊就是Annals of Medicine。随后去深入了解了这个杂志,不是水刊,发文量和被引数都还可以,那就他啦,然后有检索了我之前就有点关注的血液指标,发现他和抑郁的关系没有被写过,所以,嘿嘿,就他啦好啦,也欢迎大家围观和我一起探索NHANES数据库,也可以留下自己的研究方向一起评论区讨论哦

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