NAHNES和MR联合拿下1区TOP!武汉大学团队探究高血压和NAFLD的关系

今天分享一篇来自武汉大学人民医院的NHANES联合的文章,通过使用 NHANES 2017-2018 的数据,应用加权多变量调整逻辑回归来评估高血压与 NAFLD 风险之间的关系。随后,使用GWAS 汇总数据进行双样本 MR 研究,以确定高血压、收缩压、舒张压和 NAFLD 之间的因果关系。 这是常规两个数据库联合文章,NHANES数据只涉及一个周期,MR是使用IEU在线数据进行分析,代码实操简单,但是文章中不仅仅是只探究了高血压,分分成了收缩压、舒张压和NAFLD的关系,这是值得学习和借鉴的。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Hypertension and NAFLD risk: Insights from the NHANES 2017-2018 and Mendelian randomization…

热点+热点,双样本也能发顶刊12.2分!肠道菌群和虚弱的关系

今天分享一篇来自北京大学第一医院的MR文章,关注肠道菌群和虚弱,使用连锁不平衡评分回归和MR评估遗传预测的肠道微生物组与虚弱之间的遗传相关性和因果关系。肠道菌群目前很火热,联合另一个研究热点虚弱,这是一个与衰老相关的临床综合症,与多种疾病的死亡风险密切相关。 但是因为数据量的很大,实操起来对于设备略有要求,找一个热点结局,就是10+分!课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目:Gut microbiome and frailty: insight from genetic correlation and mendelian randomization DOI: 10.1080/19490976.2023.2282795 中文标题:肠道微生物组和虚弱:来自遗传相关性和孟德尔随机化的见解 发表杂志:Gut Microbes 影响因子:12.2 发表时间:2023年11月 论文亮点 本研究利用基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过连锁不平衡得分回归(LDSC)和Mendelian随机化(MR)方法,探讨了肠道微生物组与虚弱(frailty)之间的遗传相关性和因果关系。研究发现,Christensenellaceae R-7与虚弱之间存在遗传相关性的提示性证据,并且通过至少两种MR方法发现12种属级的肠道微生物对虚弱具有提示性的因果效应。研究未发现水平多效性或异质性的证据。这些发现为若干遗传预测的肠道微生物与虚弱之间潜在的遗传相关性和因果关联提供了提示性证据,为未来探索肠道微生物在衰老过程中的作用及其作为干预和治疗虚弱的潜在靶点提供了参考。研究强调了需要更多的基于人群的观察性研究和动物实验来阐明这种关联及其背后的机制。 摘要 观察性研究表明,肠道微生物组与虚弱有关。然而,这些关联是否是因果关系的基础仍然未知。因此,本研究旨在使用连锁不平衡评分回归 (LDSC)…

挑战7天完成药靶孟德尔随机化SCI第4~5天

在7天完成药靶孟德尔随机化SCI论文挑战的第4和第5天,分析工作变得异常艰难。由于设备性能不足,我在一家酒店找到了配备高性能显卡的电脑来运行代码,虽然这增加了成本,但也提高了工作效率,使我能同时处理多个任务,如帮助学员选题和设计课程海报。药靶孟德尔随机化的挑战已接近尾声。通过大量数据分析,我成功识别了效应基因,并发现撰写文章相对简单,主要是基于双样本方法。为了提高论文的发表概率,我计划补充SMR和共定位分析,尽管这需要额外的时间。我注意到,许多人在学习孟德尔随机化时感到迷茫,寻求资源,但当大家都在学习时,你可能已经落后。投入时间和金钱学习可能并不能保证你能够成功发表论文。因此,重要的是明确你的目标:是为了毕业还是其他目的?如果只是为了毕业,那么学习SCI写作技巧可能更为关键。我建议,对于想要快速发表论文的人来说,系统化地学习SCI论文写作比掌握各种方法学更为重要。我计划开设的课程将涵盖从文献阅读到论文写作的全过程,并包括孟德尔随机化、meta分析等多种方法学。在这两天内,我完成了蛋白提取工作,处理了4500多个工具蛋白和50000多个SNP,并成功进行了药靶孟德尔随机化分析,生成了森林图。大家在追求科研成就时,一定要保持清晰的目标和方法,以实现高效和成功。

NHANES+双样本MR=一区6.7分!重庆医科大学探究内脏脂肪组织增加牙周病的风险

NHANES数据库和MR的强强联合总是可以发高分文章,今天分享是来自重庆医科大学附属医院团队使用这两个公开数据库发文探究内脏脂肪组织(暴露)和牙周病(结局)的风险。首先通过使用2011-2014两个周期的全国健康和营养检查调查(NHANES)的数据来分析暴露和结局之间的关联。再通过双样本MR分析两者之间的因果性。结果表明:内脏脂肪组织与牙周病之间存在显著关联,内脏脂肪组织可能是牙周病风险的潜在致病因素。 联合多个数据库是我们常用的让自己双样本出彩出众的方法。文章解读完,Idea 这不就来了嘛。 文章题目:Visceral adipose tissue increases the risk of periodontal disease: Results from the 2011-2014 National Health and Nutrition Examination Survey and Mendelian randomization…

挑战5天完成Meta分析,第5天,圆满收官!🎉

挑战5天完成Meta分析,第5天,圆满收官!🎉 先来汇报一下今天的成果吧!我今天完成了Introduction部分的写作,添加了规范的引用(用的是EndnoteX9哦,最近似乎Endnote出现了小Bug,需要认证,当然2块钱就能解决,哈哈哈哈哈),还搞定了模块化部分的写作(包括伦理、致谢、利益冲突声明、作者贡献等),最后对整个文章进行了润色。看着自己的劳动成果,满满的成就感涌上心头! 回顾一下这次挑战,其实一篇经典的Meta分析操作流程可以概括为以下几个步骤:1️⃣ 确定选题:这一步非常关键,需要初步检索相关文献,明确PICOS(研究对象、干预措施、对照措施、结局指标、研究类型)选择,从而确定检索策略。2️⃣ 文献筛选:在三个不同的数据库中进行检索,下载并筛选出符合目标的研究文献。这一步需要耐心和细心,因为文献的质量直接影响到后续的分析结果。3️⃣ 数据分析与图片制作:提取筛选出的文献中的数据,使用R语言进行数据分析,并评价文献的质量。然后,根据分析结果制作出相关的图片,直观地展示研究结果。4️⃣ 报告撰写:最后,就是根据PRISMA写作指导来完成Meta分析报告的撰写了。这一步需要按照一定的结构和格式来组织内容,确保报告的完整性和可读性。 以上步骤就是一篇Meta分析的基础流程啦!大家可以对照着我这几天分享的Meta研究思路去完成自己的论文哦!相信只要按照这个流程来操作,一定能够顺利完成一篇高质量的Meta分析论文! 因为注册PROSPERO的注册需要一些,所以我暂时还没有投稿,希望审核可以搞快点。最后,我想说的是,这次挑战虽然结束了,但学习Meta分析的路还很长。希望大家都能够保持对知识的热情和好奇心,不断探索和学习新的方法和技能。加油哦

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