1区7+ 单基因生信文章解析~

今天给大家分享一篇2023年2月发表在《Computers in Biology and Medicine》(1区,IF= 7.0)的文章。研究的背景:肺腺癌是肺癌中最常见的组织学类型,也是全球主要的癌症死亡原因之一。由于缺乏早期诊断和治疗效果不佳,治疗肺腺癌仍然是一个重大挑战。近年来,包括免疫检查点阻断在内的肿瘤免疫疗法的临床应用已经改变了肿瘤治疗的模式。研究的目的:本研究旨在探讨Rac/Cdc42鸟苷核苷酸交换因子6(ARHGEF6)在肺腺癌中的潜在生物学作用,并评估其作为预后和免疫学生物标志物的可能性。研究方法:1.利用多个生物信息学工具和统计方法分析ARHGEF6在肺腺癌中的mRNA和蛋白表达水平。2..通过cBioPortal数据库分析ARHGEF6的遗传变异特征。3.使用ROC分析评估ARHGEF6在肺腺癌诊断中的价值。4.通过体外实验验证ARHGEF6的生物学功能。5.分析ARHGEF6表达与免疫细胞浸润和免疫检查点的关联。6.进行基因-基因和蛋白-蛋白相互作用网络分析,以及差异表达基因(DEGs)的功能富集分析。

医学生挑战7天完成一篇GBD数据库挖掘Day4~5

Day 4-5:跑出核心Table和FigureDay 4-5的任务实际就是做分析要跑出图片和表格首先需要下载数据GBD的数据因为最近使用数据库的人比较多了起来所以下载等待时间会大大延长但是下载数据的方式是非常简单的下载得到的数据源也是标准化的不需要特别的处理目前数据已经更新到2021根据自己的研究目标下载(发病率、患病率、DALYs)下载得到的数据就可以直接用来分析接下来就是可视化呈现、Jionpoint分析、年龄、时期和队列效应分析通过前面的准备工作已经整理好了这篇文献需要做哪些分析也提取了文章的框架结构为后续的写作做准备所以一步一步分析就好了有的师弟师妹会问:操作很简单,但是我该怎么选题?这个问题很好解决和我们做meta分析、NHANES挖掘的时候的选题是一样的“拉郎配”方法学的东西可以平移到任何一个数据库的挖掘换地区、换人群、换时间、换研究方法通过不断变换研究的视角和方法可以持续产出新的研究成果今天的所有表格和图片就完成了明天就要开始写作啦!欢迎大家围观留下自己独到的想法和经验,我们下一篇进度汇报见!

NHANES指标推荐:LCD!

文章题目:Association of low-carbohydrate-diet score and cognitive performance in older adults: National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES)  DOI:10.1186/s12877-022-03607-1 中文标题:低碳水化合物饮食评分与老年人认知能力的关系:国家健康和营养检查调查 (NHANES) 发表杂志:BMC Geriatr 影响因子:2区,IF=3.4 发表时间:2022年12月 今天给大家分享一篇在…

1区12.5分文献解锁科研新视角:运动与认知

今天给大家分享一篇在 2023 年 11 月发表在《Ageing Research Reviews》(1区,IF=12.5)的文章。研究的背景:随着世界人口老龄化的加剧,伴随老龄化而出现的认知功能下降问题越来越受到关注。运动作为一种非药物疗法,被认为可能对改善不同人群的认知功能具有积极作用。然而,很少有元分析评估了所有 FITT-VP 变量(运动频率、强度、每次运动持续时间、类型、总运动量或总干预长度以及进展)对健康人群按年龄划分的认知功能的影响。研究的目的: 本系统综述和元分析的目的是评估慢性运动干预对健康儿童、成人和老年人群认知功能的影响,并根据 FITT-VP 运动变量进行调节分析。研究方法:检索方法:研究遵循 PRISMA 指南,使用 PubMed 和 Web of Science 数据库从 2003 年 1 月至 2022…

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