医学科研er们,现在生信分析热点方向,2025可能还会持续是热点: 肠道菌群分析:健康研究的热点之一 肠道菌群作为人体微生态系统的重要组成部分,近年来成为了健康研究的热门话题。 肠道菌群失衡与多种疾病的发生密切相关,生信技术可以帮助我们深入分析肠道菌群的结构与功能,揭示其在代谢、免疫、神经等多方面的影响。通过肠道菌群的研究,或许能为疾病的早期诊断与个性化治疗提供新的方向。 分析思路:①研究菌群与疾病的关联性:找出健康对照组和疾病组,通过临床检测和组学分析,寻找疾病与健康组的差异菌群。考虑生活方式、饮食习惯、运动、生活环境等因素对肠道菌群的影响。 ②研究菌群与疾病因果关系:通过比较疾病不同进展期肠道菌群的构成变化,确定与疾病进展高度一致或相反的一种或几种目标菌,推测其促进或抑制了疾病的发生。 ③验证菌群与疾病因果关系:将患者和健康人群的类菌移植到无菌小鼠中,观察患者菌群是否能促进小鼠疾病的发生和发展,研究小鼠菌群的改变以及菌群对其疾病的作用。 ④验证致病菌或有益菌的功能及疾病机制研究:利用动物实验对关键菌进行验证,综合分析临床指标结合组学结果,探讨该菌影响肠道菌群致病或改善疾病的机制。 ⑤疾病干预、诊断、分型研究:通过比较健康对照组、疾病组及疾病干预组菌群和代谢物组成的差异,验证干预手段是否是通过改变菌群来提高疗效。通过生信和统计分析方法建立疾病预测模型,研究预测模型和传统疾病诊断方法对疾病的诊断效果,确定最佳诊断疾病的菌群/代谢物标志物。 DNA甲基化是表观遗传学的重要一环,涉及到基因的开启和关闭。近年来,甲基化研究迅速崛起,发表文献数量取得了显著进展,帮助研究人员揭示了疾病发生的分子机制。 甲基化研究不仅为疾病早期诊断提供了可能,还为靶向治疗的研发带来了新的机遇。 不同患者的疾病亚型可能会表现出不同的临床特征和预后情况。通过分型预后分析,结合基因组学、转录组学等数据,研究者可以根据患者的特定分型,为其提供更加个性化的治疗方案。这一方向在癌症、心血管疾病等多个领域得到了广泛应用。 推荐文献生信分析+机器学习文献: 文章亮点:① 本研究首次综合运用生物信息学分析和机器学习技术,系统性揭示了昼夜节律基因(CRGs)在黑色素瘤中的作用,并探讨了这些基因与黑色素瘤的诊断和预后关系,为黑色素瘤的早期识别和个性化治疗提供了新的视角。 ② 研究团队通过分析公开数据库中的黑色素瘤和正常皮肤数据,结合差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)和功能富集分析,筛选出了与黑色素瘤密切相关的125个昼夜节律基因,并从多个维度评估了其在黑色素瘤发生中的潜在机制。 ③ 基于关键CRGs,研究构建了一个精准的预后风险评估模型和列线图,能够有效预测黑色素瘤患者的生存期,为临床个性化预后评估提供了新的工具和参考。 乳酸化作为一种新的表观修饰,在细胞代谢、应激反应等过程中起着重要作用。与之相关的双硫死亡(ferroptosis)是一种新发现的细胞死亡方式,正在成为癌症研究的热点。 通过研究乳酸化和双硫死亡机制,科研人员不仅能加深对细胞死亡过程的理解,还能为癌症、神经退行性疾病等的治疗提供新的靶点。 铜死亡(cuproptosis)是近年来发现的一种新型细胞死亡方式,其机制涉及铜离子调节导致细胞内蛋白质聚集,与多种疾病的发生,包括肿瘤和神经系统疾病息息相关。 这个新兴的研究方向为我们提供了更多的疾病治疗靶点,可能会成为未来生物医学研究的重要课题。 线粒体不仅是细胞的能量工厂,它的功能障碍与多种疾病密切相关。近年来,研究者越来越关注线粒体在肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病等中的作用。通过深入分析线粒体的功能和调控机制,或许能为这些疾病提供新的治疗思路。 免疫系统的失调与多种疾病密切相关,尤其是在癌症、感染、免疫性疾病等方面。生信技术在免疫组学中的应用,帮助研究人员揭示免疫反应的机制,探索新的免疫靶点。免疫检查点抑制剂、CAR-T细胞治疗等新型免疫疗法正在改变疾病治疗的格局。…
1️⃣365天没有假期,反人性工作时间 朋友入职了某三甲医院呼吸内科,每天必须去医院,每周组织一次学习讨论会,会议都是凌晨1点结束,还要求必须每天参加院内晨会,科室每周两次学术会议,院内时不时还有其他会议。😱 2️⃣拿绩效压人的领导 值夜班的时候被患者说眼睛小,与患者理论了几句,就这样你一句我一句吵了会,也没惹出什么事。 科里的副主任知道了直接扣20%的月绩效。😥 3️⃣被人推出去当出头鸟 领导在说某项工作时,大家都没人出面,你的同事却在领导面前一个劲儿夸赞你,说你在某方面的能力是科室蕞强的,这项工作也只有你能做好。这时你骑虎难下,只有被迫接受棘手的工作。 4️⃣拖欠各种文书,最后疯狂加班 像门诊病历、入院病历、首次病程、上级医师查房记录、医患沟通、授权书、危重通知书,出院记录等等文书,当天当时有事耽搁没有完成,就堆到了第二天,关键是第二天也没有处理完,就这样日积月累。 5️⃣职场小白,揽下科室所有工作 刚进科室的时候,还是一个小白,基本成为了科室医生们的“助理”,大病历确认以及医患沟通签字,贴全科化验单、通知病人到办公室…… 6️⃣所有时间精力都耗在临床上,无暇顾及科研 经常有临床医生诉苦,感觉工作压力很大,但是工资却一直在“原地打转”。 坦白说,临床80%的工作都是重复的,就算你再干十年,也不会有质的提升,因为你能接触的病人有限。 要想进一步提升临床技能,你得先取得能做高难度手术的入场资格,有了资格,才能有练手的平台。 对没背景的普通医生而言,能帮助你获得入场资格的垫脚石无疑是科研! 道理很多医生都明白,但是人要工作要领工资,不是靠光合作用活着的,科研对临床小医生来说确实是要牺牲自己的休息时间来专研。 都是这么过来的,也能理解大家的处境,所以我们得去找适合临床医生发文章的方法。 比如有个前辈给我推荐的挖掘临床公共数据库! 🚩SEER,适合癌症; 🚩NHANES,适合全科; 🚩MIMIC,适合重症; 🚩GBD,适合全科 数据库的数据海量,有的还在不断更新,给我们医学生/医生提供了很多的发文机会。 但是每个数据库有它自己的花期,一旦过了热度,可能审稿人就没那么青睐了!所以想要学习的伙伴,直接冲,犹犹豫豫耽搁了最佳时机,就又错过了发表的机会,毕竟学还要时间对吧!…
我们课题组对助理助教的要求:达标要求:帮助师妹师弟完成第一篇SCI及帮助师妹师弟掌握光速攥写SCI的能力优秀标准:帮助师妹师弟完成不少于2篇SCI及帮助师妹师弟掌握光速攥写SCI的能力1.01日开课,12.31日第十六期报名截止,已经陆续成立课题组,沟通师妹师弟第一篇Sci方向~(选题、数据清洗、统计分析、写作指导、润色投稿、返修全流程服务)光速科研线上师门 持续更新优质课程~(半年六篇) 12.29课题组师妹师弟反馈: 已经结课的师弟第一个达到毕业要求~ 按照现在市面上训练营或者多对一服务来讲,以及目前师妹师弟们的产出来看,我们定价应该在5w,我们后面陆续恢复到定价上~第十六期倒计时2天啦~早期报名自动加入#光速科研线上师门名额有限,先到先得现在报名,提前做好课前准备轻松搞定SCI~
文章题目:The association between post-lunch napping duration and social participation among the Chinese older adults: a cross-sectional study DOI:10.1186/s12877-024-05593-y 中文标题:中国老年人午睡时长与社会参与的关系:一项横断面研究 发表杂志:BMC Geriatr 影响因子:2区,IF=3.4 发表时间:2024年12月今天给大家分享一篇在 2024年12月发表在《BMC Geriatr》(2区,IF=3.4)的文章。本研究旨在探讨中国老年人午睡时长与社会参与 (SP)的关系。 研究方法:我们使用中国健康与养老纵向研究 (CHARLS) 的数据进行了一项横断面研究,重点关注 60 岁及以上的参与者。SP 是通过参与者自我报告的活动数量和频率来衡量的。午睡时间也是自我报告的。我们使用逻辑回归、亚组分析和限制性立方样条 (RCS) 分析探讨了午睡时间与 SP 之间的关联。…
文章题目:Association between oxidative balance score and serum cobalt level in population with metal implants: a cross-sectional study from NHANES 2015-2020 DOI:10.3389/fnut.2024.1485428 中文标题:金属植入人群氧化平衡评分与血清钴水平之间的关联:2015-2020 年 NHANES 的一项横断面研究 发表杂志:Front Nutr 影响因子:2区,IF=4.0…
文章题目:Global, regional, and national epidemiology of childhood neuroblastoma (1990-2021): a statistical analysis of incidence, mortality, and DALYs DOI:10.1016/j.eclinm.2024.102964 中文标题:全球、地区和国家儿童神经母细胞瘤流行病学(1990-2021):发病率、死亡率和 DALY 的统计分析 发表杂志:EClinicalMedicine 影响因子:1区,IF=9.6 发表时间:2024年12月 今天给大家分享一篇在 2024年12月发表在《EClinicalMedicine》(1区,IF=9.6)的文章。本研究旨在报告 1990 年至 2021 年儿童神经母细胞瘤发病率、死亡率和伤残调整生命年 (DALY) 的全球趋势。 研究方法:本研究利用全球疾病负担 (GBD) 数据库的数据来分析 0-14 岁儿童的神经母细胞瘤发病率、死亡率和 DALY。发病率、死亡率和 DALY 率按每 100,000 人口计算,不确定区间 (UI) 为 95%。来自 204 个国家和地区的数据按年龄、性别和地点分层。使用 Joinpoint 回归模型计算年度百分比变化 (APC) 并使用对数转换线性回归模型计算估计的平均年度百分比变化 (EAPC) 来评估趋势。 Table&Figure…
今天给大家分享一篇在 2024年11月发表在《BMC Geriatr》(2区,IF=3.4)的文章。本研究旨在研究抑郁症状的变化(改善/恶化)与关节炎之间的纵向关联。 文章题目 英文: Association of improvement and worsening of depressive symptoms with arthritis 中文: 抑郁症状的改善和恶化与关节炎的关系 DOI 10.1186/s12877-024-05498-w 发表杂志 《BMC Geriatr》 影响因子 2区,IF=3.4 发表时间…
文章题目:Association Between Daily Internet Use and Intrinsic Capacity Among Middle-Aged and Older Adults in China: Large Prospective Cohort Study DOI:10.2196/54200 中文标题:中国中老年人日常互联网使用与内在能力的关系:大型前瞻性队列研究 发表杂志:J Med Internet Res…
文章题目:Albumin-bilirubin score as a predictor of all-cause mortality in patients with hepatitis B virus infection: An analysis of National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES)…
文章题目:Global burden associated with rare infectious diseases of poverty in 2021: findings from the Global Burden of Disease Study 2021 DOI:10.1186/s40249-024-01249-6 中文标题:2021 年与贫困相关的罕见传染病全球负担:2021 年全球疾病负担研究结果 发表杂志:Infect Dis Poverty…