今天分享一篇来自首都医科大学团队的双样本MR,暴露是IL-6极其受体(6个IL-6信号基因和34个sIL-6R受体基因),结局是肺动脉高压。炎症,尤其是白细胞介素-6(IL-6),已被认为是肺动脉高压发病的关键因素。因此,经典的IL-6信号传导可能是PAH颇具前景的治疗靶点。这是这篇文章能发高分的核心原因。我们完全可以进行模仿思路,换个炎症因子或者换个疾病。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Mendelian randomization study on causal association of IL-6 signaling with pulmonary arterial hypertension DOI: 10.1080/10641963.2023.2183963 中文标题:基于孟德尔随机化探究IL-6信号与肺动脉高压的因果关系 发表杂志:Clin Exp Hypertens 影响因子:12.3 发表时间:2023年12月 论文亮点…
今天分享一篇来自Journal of the American Heart Association的文章。英国格拉斯哥大学健康与福利学院的Shinya Nakada教授团队纳入超过百万人群数据进行双样本MR,提高了对精神分裂症患者早期心脏评估和治疗的认识。 暴露精神分裂症:GWAS数据来自精神病基因组学联盟(PCG); 结局动脉粥样硬化性卒中和栓塞性卒中:GWAS数据来自MEGASTROKE联盟。一个暴露与一类结局的双样本MR文章的套路操作。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目: Schizophrenia and Types of Stroke: A Mendelian Randomization Study DOI: 10.1161/JAHA.123.032011 中文标题:精神分裂症和中风类型:孟德尔随机化研究…
今天分享一篇来自武汉大学人民医院的NHANES联合的文章,通过使用 NHANES 2017-2018 的数据,应用加权多变量调整逻辑回归来评估高血压与 NAFLD 风险之间的关系。随后,使用GWAS 汇总数据进行双样本 MR 研究,以确定高血压、收缩压、舒张压和 NAFLD 之间的因果关系。 这是常规两个数据库联合文章,NHANES数据只涉及一个周期,MR是使用IEU在线数据进行分析,代码实操简单,但是文章中不仅仅是只探究了高血压,分分成了收缩压、舒张压和NAFLD的关系,这是值得学习和借鉴的。 课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油呀! 文章题目:Hypertension and NAFLD risk: Insights from the NHANES 2017-2018 and Mendelian randomization…
今天分享一篇来自北京大学第一医院的MR文章,关注肠道菌群和虚弱,使用连锁不平衡评分回归和MR评估遗传预测的肠道微生物组与虚弱之间的遗传相关性和因果关系。肠道菌群目前很火热,联合另一个研究热点虚弱,这是一个与衰老相关的临床综合症,与多种疾病的死亡风险密切相关。 但是因为数据量的很大,实操起来对于设备略有要求,找一个热点结局,就是10+分!课题思路这不就来了么?万层高楼平底起,一起加油吧! 文章题目:Gut microbiome and frailty: insight from genetic correlation and mendelian randomization DOI: 10.1080/19490976.2023.2282795 中文标题:肠道微生物组和虚弱:来自遗传相关性和孟德尔随机化的见解 发表杂志:Gut Microbes 影响因子:12.2 发表时间:2023年11月 论文亮点 本研究利用基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过连锁不平衡得分回归(LDSC)和Mendelian随机化(MR)方法,探讨了肠道微生物组与虚弱(frailty)之间的遗传相关性和因果关系。研究发现,Christensenellaceae R-7与虚弱之间存在遗传相关性的提示性证据,并且通过至少两种MR方法发现12种属级的肠道微生物对虚弱具有提示性的因果效应。研究未发现水平多效性或异质性的证据。这些发现为若干遗传预测的肠道微生物与虚弱之间潜在的遗传相关性和因果关联提供了提示性证据,为未来探索肠道微生物在衰老过程中的作用及其作为干预和治疗虚弱的潜在靶点提供了参考。研究强调了需要更多的基于人群的观察性研究和动物实验来阐明这种关联及其背后的机制。 摘要 观察性研究表明,肠道微生物组与虚弱有关。然而,这些关联是否是因果关系的基础仍然未知。因此,本研究旨在使用连锁不平衡评分回归 (LDSC)…
在7天完成药靶孟德尔随机化SCI论文挑战的第4和第5天,分析工作变得异常艰难。由于设备性能不足,我在一家酒店找到了配备高性能显卡的电脑来运行代码,虽然这增加了成本,但也提高了工作效率,使我能同时处理多个任务,如帮助学员选题和设计课程海报。药靶孟德尔随机化的挑战已接近尾声。通过大量数据分析,我成功识别了效应基因,并发现撰写文章相对简单,主要是基于双样本方法。为了提高论文的发表概率,我计划补充SMR和共定位分析,尽管这需要额外的时间。我注意到,许多人在学习孟德尔随机化时感到迷茫,寻求资源,但当大家都在学习时,你可能已经落后。投入时间和金钱学习可能并不能保证你能够成功发表论文。因此,重要的是明确你的目标:是为了毕业还是其他目的?如果只是为了毕业,那么学习SCI写作技巧可能更为关键。我建议,对于想要快速发表论文的人来说,系统化地学习SCI论文写作比掌握各种方法学更为重要。我计划开设的课程将涵盖从文献阅读到论文写作的全过程,并包括孟德尔随机化、meta分析等多种方法学。在这两天内,我完成了蛋白提取工作,处理了4500多个工具蛋白和50000多个SNP,并成功进行了药靶孟德尔随机化分析,生成了森林图。大家在追求科研成就时,一定要保持清晰的目标和方法,以实现高效和成功。