医学生一起学起来，挑战7天完成一篇趋势性分析 Day 2! 今日进展： 继昨天确定了目标期刊和文献后 我对选定的主题进行了深入的评估，判断其可行性 选题是任何一个研究中最重要的一步 选对了就是事半功倍 选错了就是一切努力都可能白费 只要确定主题有研究价值 我们就能信心满满地攻克所有方法学难题 毕竟，“所有方法学都一定会被掌握” 而且“框架写作法”会快射上手成稿 接着，我下载并精读了几篇基于GBD趋势性分析的高分经典文献 发现结果展示部分大同小异 主要区别在于研究的疾病不同 写作风格和结构也有共通之处， 那么，我该重点分析哪些具体内容呢？ 通过阅读目标期刊的相关文献，我明确了需要完成的内容： –发病率和年均百分比变化(AAPCs) –患病率和AAPCs –DALYs率和AAPCs –全球发病率地图 –新病例数量变化 –发病率、患病率和DALYs率的趋势分析…
今天给大家推荐一个生信数据库👇 TWAS数据库是整合了GWAS（全基因组关联分析）和基于共同变异的表达图谱研究结果的数据库，旨在确定与表型相关的基因表达调控区域。这类数据库通过整合和分析大量的遗传变异、基因表达和表型数据，为研究者提供了探索基因和性状之间复杂关系的宝贵资源。其中，TWAS Atlas是一个典型的TWAS数据库，它整合了广泛文献中的TWAS发现，为研究者提供了一个强大的资源平台。 ⭕TWAS数据库的数据类型 TWAS数据库中的数据类型主要包括以下几种： 遗传变异数据：这类数据通常来自GWAS研究，包括单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失（InDel）等遗传变异信息。这些数据是TWAS分析的基础，用于识别与表型相关的遗传变异。 基因表达数据：基因表达数据通常来自RNA-seq、微阵列等高通量测序技术，用于测量不同组织或细胞中基因的表达水平。这些数据在TWAS中用于构建表达量数量性状位点（eQTL）模型，进而识别与遗传变异相关的基因表达变化。 表型数据：表型数据是指可观测的生物学性状或疾病状态信息。在TWAS中，表型数据用于与遗传变异和基因表达数据进行关联分析，以识别与特定性状或疾病相关的基因。 整合分析数据：TWAS数据库还包含整合分析数据，即将遗传变异、基因表达和表型数据进行综合分析后得到的结果。这些数据通常以特定基因与表型之间的关联形式呈现，为研究者提供了直接的生物学意义。 今天要分享的学员就是挖掘TWAS数据库，没有做实验验证成功发表的，一起来看看今天的学员案例吧 接收期刊：Turkish Journal of Gastroenterology 📉IF=1.4；中科院4区SCI 📍发文方法：生信分析 🔬研究方向：【胃肠肝病方向】
2024年，NHANES数据库一共更新了三波数据： 1️⃣ 7月31日，NHANES更新DNA甲基化数据 更新的数据来源于NHANES 1999-2000年和NHANES 2001-2002年两个周期内收集的血液样本中提取的DNA样本。 研究团队通过高通量测序技术，分析了这些样本中的DNA甲基化模式，这对于理解人体的表观遗传变化至关重要。 利用此次更新的数据，我们不仅可以验证现有的假设，揭示疾病的发生发展机制，评估个体健康状况以及制定预防策略，还可以探索新的关联。此外，由于NHANES数据库可以免费下载，这意味着我们可以节省大量时间和资源，直接投入到数据分析和结果解读中，从而加速研究的步伐。 2️⃣ 10月初，数据库再次更新！ 2021-2023年的人口统计数据、检查数据、实验室数据、问卷数据重磅来袭！ 💡 人口统计数据：包括人口统计变量和样本权重。💡 检查数据：包括血压、身体测量数据、肝脏超声瞬时弹性成像数据。💡 实验室数据：包括各类体液检查数据。还增加了一些新指标，例如Alpha-1-酸性糖蛋白、全血细胞计数及5分类差异、铁蛋白等。💡 问卷数据：包括各类有关生活方式、病史以及有害物质暴露的数据。 利用这些数据，可以尝试从以下几个方面进行研究： 3️⃣ 10月31日，NHANES数据库又更新了2021.8-2023.8新冠疫情期间的饮食数据！ 此次更新的数据，来源于2021年8月~2023年8月周期，是由移动检查中心（MEC）访问期间对参与者进行电话访谈所收集的饮食回忆信息。 利用这些数据我们可以：💡 探讨疫情期间人们的饮食行为（如饮食频率、食物种类、营养素摄入等）是否发生了显著变化。💡 探讨疫情期间，慢性病患者（如糖尿病、高血压等）的饮食管理变化及其对健康的影响。💡 研究不同饮食模式对免疫系统功能的影响，探讨如何通过饮食增强免疫力，以更好地应对COVID-19等感染性疾病。 所以，新的风口又已经出现，你当前的任务就两个：1️⃣…
每个月都有师妹师弟转介绍科室的老师或者同学加入学习，这是最快乐的事情，继续认真服务，认真带科研，和咱们的师妹师弟形成良好的长期关系(持续提供价值)~为什么咱们的师妹师弟愿意转介绍？因为都能写出文章、投出文章，因为所有的数据都是整理好的，所有的代码都是验证过的（课题组还会帮忙跑出结果）写作也是手把手一句一句的教~2025.1.03课题组师妹师弟反馈: 光速科研写作训练营–学完即可光速攥写任意类型的SCI论文~选题、跑代码（分析）、写作、润色、投稿选刊、返修，全流程，手把手教学~任意选择一个/两个方向(gbd/nhanes/charls/meta/mr…)，开始做，做好投稿之后，继续做已投稿方向，或者学习新的方向~因此我们设置的热点课不是都需要学习的，选符合自己研究领域的，能快速出文章的方向去做就行啦~16期目前可插班(1.07号截止~)在课题组助教、代码助教指导下完成直播课(目前已上完一节)学习~赶上进度~
文章题目：Pain Characteristics and Progression to Sarcopenia in Chinese Middle-Aged and Older Adults: A 4-Year Longitudinal Study DOI：10.1093/gerona/glae080 中文标题：中国中老年人疼痛特征及肌肉减少症进展：一项为期 4 年的纵向研究 发表杂志：J Gerontol A Biol Sci Med Sci…
文章题目：Clustering by chemicals: A novel examination of chemical pollutants and social vulnerability in children and adolescents DOI：10.1016/j.envres.2024.118456 中文标题：按化学物质聚类：对儿童和青少年的化学污染物和社会脆弱性的新检验 发表杂志：Environ Res 影响因子：1区，IF=7.7 发表时间：2024年6月 今天给大家分享一篇在 2024年6月发表在《Environ Res》（1区，IF=7.7）的文章。本文这项研究旨在利用国家健康和营养检查调查 (NHANES) 的数据， 探索 2015-2016 年=NHANES中 6 至 19 岁青少年的空气污染聚集模式，并研究化学聚集与社会脆弱性之间的关联。…
文章题目：Disease burden of AIDS in last 30-year period and its predicted level in next 25-years based on the global burden disease 2019 DOI：10.1186/s12889-024-19934-4 中文标题：过去 30 年艾滋病疾病负担以及根据 2019 年全球疾病负担预测未来 25 年的水平 发表杂志：BMC…
文章题目：Mediating Effects of Serum Lipids and Physical Activity on Hypertension Management of Urban Elderly Residents in China DOI：10.3390/metabo14120707 中文标题：血脂与体力活动对中国城市老年居民高血压管理的中介作用 发表杂志：Metabolites 影响因子：2区，IF=3.4 发表时间：2024年12月 今天给大家分享一篇在 2024年12月发表在《Metabolites》（2区，IF=3.4）的文章。本研究旨在研究血脂生物标志物在高血压管理中的重要性和潜在的因果关系。 研究方法：我们使用 2015 年至 2020 年期间收集的 CHARLS 数据库的纵向数据调查了 3373 名城市居民。采用皮尔逊相关方法探讨数值变量之间的关系。采用逻辑回归模型识别高血压的危险因素。使用限制性三次样条 (RCS) 评估血脂与血压之间的剂量效应关系。此外，进行了分段结构方程模型 (PiecewiseSEM) 以进一步阐明个体身体指数、血脂和 PA 对不同体力活动 (PA) 水平下血压反应的直接和间接途径。 Table&Figure…
文章题目：Association of “a body shape index” with the risk of developing colorectal cancer in U.S. patients with metabolic syndrome: evidence from the NHANES 1999-2018 DOI：10.1186/s12876-024-03537-9…
文章题目：Global, regional and national burden due to retinoblastoma in children aged younger than 10 years from 1990 to 2021 DOI：10.1186/s12916-024-03827-9 中文标题：1990 年至 2021 年全球、地区和国家 10 岁以下儿童视网膜母细胞瘤负担 发表杂志：BMC Med 影响因子：1区，IF=7.0 发表时间：2024年12月…