今天我要发起一个崭新的挑战，就是在7天内完成一篇利用NHANES数据库的SCI论文！今天的主要任务是进行初步检索并确定目标期刊。 NHANES数据库，全称National Health and Nutrition Examination Survey，是一项基于人群的横断面调查，旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。每年，该项目会对一个全国代表性的样本进行调查，涵盖约5000人。NHANES的访谈部分包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题，而体检部分则包括生理测量和实验室检查等内容。数据量庞大，涉及的相关指标极多，适合各个科室的朋友来挖掘写作，因此近年来备受关注，我也想试试水，哈哈。 我首先简单使用关键词“NHANES”进行了初步检索，发现目前已有大量相关文章，其中不乏高质量的作品。仔细观察后发现，大部分高分文章集中在5分到10分之间，并且多数发表在一区和二区期刊上，这个情况还是挺不错的。由于最近我对抑郁症比较感兴趣，于是我尝试了搜索“NHANES and depression”，发现相关文章的数量和质量都令人满意，因此我决定就从这个方向入手。 第一篇文章是复旦大学最新的抑郁研究成果，后续的文章都出自我们之前调研过的《情感障碍杂志》，但考虑到新的目标，我决定换个目标期刊——我的目标文章是一篇发表在《医学年鉴》上的作品（DOI: 10.1080/07853890.2024.2314235）。 之后我对《医学年鉴》进行了更深入的了解，发现它并非水刊，发文量和被引数都相当可观，于是就决定了这个目标。 接着我检索了之前就有些关注的血液指标，发现它与抑郁症之间的关系还没有被充分研究过，这可是一个不错的研究方向，嘿嘿。 好了，让我们一起来探索NHANES数据库吧！期待未来的7天，一起迎接这个挑战！
Day 6-7：框架写作法，写作冲刺，一气呵成！ 数据分析和核心结果都已经搞定， 可有的师弟师妹却犯了难， 不知道该怎么把这些成果写成一篇出彩的文章， 感觉脑子一团乱麻，根本不知道从哪儿下笔。 其实别慌，写作真没那么可怕， 记住 “先行动，先码字，再打磨；先完成，再完美” 这句话， 就成功了一半。 咱们医学生的能力那都是杠杠的， 一篇文章多少字？8000 还是10000？ 除去摘要、参考文献、一些模块化内容写作 实际上真正让我们写的也就只有那点儿 咬咬牙、坚持坚持肯定能写完 但是如何高效的写完呢 如何写出能达到发表级别的文章内容呢 这就要用到我们独家总结的“框架写作法”了 祛魅，写多了，也就那么回事儿 在写稿的时候，多多以一个审稿人的身份进行写作 如果你是审稿人、你是编辑 那你想在文章中重点呈现什么最核心的内容 把自己的角色从作者转变为审稿人…
生信转录组学分析是研究细胞中基因转录情况及转录调控规律的学科，是功能基因组学的重要部分。以下是进行转录组分析所需的数据及研究流程： 一、所需数据 测序数据：如RNA-seq产生的短序列数据。 样本信息表：记录样本的基本信息，如样本来源、处理条件等，用于后续的数据分析和解释。 参考基因组序列：用于将测序得到的短序列比对到参考基因组上，确定每个读段的位置和来源。这些数据可以从如ensembl等可靠的数据库网站下载。 基因注释文件：提供基因的结构和功能信息，用于对测序结果进行功能注释和富集分析。同样可以从数据库网站下载。 蛋白序列文件：在某些分析中，如lncRNA靶标预测中，可能需要用到蛋白序列数据。可数据库网站下载。 二、研究流程 数据预处理：对挖掘公共数据库得到的原始数据进行质量控制和过滤，去除低质量的读段和接头序列等。 序列比对：将处理后的序列与参考基因组或转录组进行比对，确定每个读段的位置和来源。 基因表达定量：计算每个基因或转录本的表达量，常用的指标包括FPKM（Fragments Per Kilobase of exon per Million fragments mapped）和TPM（Transcripts Per Million）等。 差异表达分析：比较不同条件下（如不同组织、疾病状态、处理组等）基因的表达差异，筛选出显著差异表达的基因。 功能注释和富集分析：对差异表达基因进行功能注释，如基因本体（GO）注释、KEGG通路分析等，以了解其参与的生物学过程和通路。 实验验证：通过qRT-PCR（定量逆转录PCR）等实验方法对部分关键基因的表达进行验证，以确保转录组分析结果的可靠性。 今天要分享的学员就是挖掘数据库做转录组学分析+实验验证研究成功发表文章的…
科研新手第一关，难免卡在不知道如何寻找一个好的Idea，最近刷小红书看到一些大神分享，转载分享给大家~ 科研好想法的产生=综述阅读+research paper阅读+模仿+思考+循环！ 第一阶段：综述阅读。 什么是综述？读什么样的综述？为什么读综述？ 综述是某一领域、某一研究专题搜集大量相关资料，然后通过阅读、分析、提炼、整理当前课题、问题或研究专题的最新进展、学术见解或建议，对其他研究者起介绍和阐述的一种学术论文。例如液体方向的这些： 在选择综述上，可以侧重这两类综述进行阅读： 好期刊的综述一般都是行业内的大牛写的！阅读这样的综述就相当于你站在了行业大佬的肩膀上。除此之外，综述的时间也不能太久远，选择5年之内的综述进行阅读最好。 一篇好的文献综述能够带给我们： 那怎么去读呢？首先要清楚，我们看综述的目的有两个：1. 了解课题的背景知识，2. 专注「前景展望」。 如果对某个知识点特别感兴趣，就要把它所提到的文献也下载下来，一起给看了。 就这样读个10篇左右，你对你们这个领域的一些基础的知识就有大致了解了。 其次，文献综述中的前景展望部分就直接是大牛提出来该领域还没有研究而且具有研究价值的一些方向，你可以看一下对你的课题而言是否可取。如果OK，你就可以尝试一下。 第二阶段：研究型论文的阅读。 什么是研究型论文？读什么、怎么读？ research paper是科研工作者用来描述或呈现已有研究成果的文章。和综述不同，研究论文一般是一个专题小点研究成果的展现。 通过读研究型论文，可以增加我们对于学科背景知识的了解，知道作者通过什么方法来解决所提出的研究问题，了解到哪些实验得出了这些结果。 学习实验技术+模仿，所有学科，只要是做科研，都得经历这个阶段。 怎么读？ 要想自己能够有好的科研想法，我们就要像大佬们学习他们是怎么构思问题的，然后他们解决问题的思路是什么！ 总结下来就是： 第三阶段：模仿。…
我们提供的服务:A、师妹师弟们至少成稿一篇SCI，师妹师弟可选择任意类型论文，任意类型数据库挖掘，也可以做自己的临床课题。B、师妹师弟们掌握光速攥写任意类型SCI系统方法论(授人以渔)，今后不会在科研上花钱。C、持续不断推出热点课程，早期报名SCI训练营，自动加入#光速科研线上师门，后续热点课程免费学习，持续答疑。以上A、B、C全部包括~2025.2.14训练营反馈： 18期报名开放中…少数名额，先到先得大家科研顺利，一切顺利！
文章题目：Mediating Effects of Serum Lipids and Physical Activity on Hypertension Management of Urban Elderly Residents in China DOI：10.3390/metabo14120707 中文标题：血脂与体力活动对中国城市老年居民高血压管理的中介作用 发表杂志：Metabolites 影响因子：2区，IF=3.4 发表时间：2024年12月 今天给大家分享一篇在2024年12月发表在《Metabolites》（2区，IF=3.4）的文章。本研究旨在研究血脂生物标志物在高血压管理中的重要性和潜在的因果关系。 研究方法：我们使用2015 年至 2020 年期间收集的 CHARLS 数据库的纵向数据调查了 3373 名城市居民。采用皮尔逊相关方法探讨数值变量之间的关系。采用逻辑回归模型识别高血压的危险因素。使用限制性三次样条 (RCS) 评估血脂与血压之间的剂量效应关系。此外，进行了分段结构方程模型 (PiecewiseSEM) 以进一步阐明个体身体指数、血脂和 PA 对不同体力活动 (PA) 水平下血压反应的直接和间接途径。 Table&Figure…
文章题目：Association of “a body shape index” with the risk of developing colorectal cancer in U.S. patients with metabolic syndrome: evidence from the NHANES 1999-2018 DOI：10.1186/s12876-024-03537-9…
文章题目：Global, regional and national burden due to retinoblastoma in children aged younger than 10 years from 1990 to 2021 DOI：10.1186/s12916-024-03827-9 中文标题：1990 年至 2021 年全球、地区和国家 10 岁以下儿童视网膜母细胞瘤负担 发表杂志：BMC Med 影响因子：1区，IF=7.0 发表时间：2024年12月…
文章题目：A case for the use of deep learning algorithms for individual and population level assessments of mental health disorders: Predicting depression among China’s elderly DOI：10.1016/j.jad.2024.09.147…
文章题目：Associations between reproductive factors and the prevalence of depression: findings from the National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2005-2018 DOI：10.1186/s12889-024-20213-5 中文标题：生殖因素与抑郁症患病率之间的关联：2005-2018 年国家健康和营养检查调查 (NHANES) 的结果 发表杂志：BMC Public Health…