七天写完孟德尔SCI挑战圆满结束!

七天孟德尔SCI挑战圆满结束!
实际上,很多准备工作我已经在前几天完成了。分享一个小技巧:阅读文献时,我会把有价值的句子或观点保存到我的微信对话框里。写讨论部分前,我就会回顾这些笔记,有时稍微调整下语序就能使用。
来聊聊我的药靶孟德尔随机化写作思路吧:
首先,选定一个疾病(查看gwasieu是否有对应的Gwasid→如果有,就可以考虑作为候选→然后提取对应蛋白的所有SNP→用这些工具变量(蛋白)与结局变量进行MR分析→筛选出有正面效应的蛋白→在相关网站查询对应的基因和药物→之后可以进一步做SMR和共定位分析→最后整合成论文。
(这个过程非常复杂,一次循环错误可能意味着两天努力白费,建议新手从简单的两样本分析开始,我教学也是逐步深入的。)
先来谈谈第7天的进展:制作了机制图(figure1)、增加了引用(Endnote20)、完善了结构性语句(包括伦理声明、致谢、作者贡献及利益冲突声明)以及对论文进行了最后的润色。
分享一下心得体会:
一篇高质量的研究论文应包括以下统计分析和结果描述:
➢ 利用TwoSampleMR软件包进行统计分析。
➢ 从GWAS summary数据库中提取SNP及其统计数值作为工具变量。
➢ 运用如Steiger过滤法等手段筛选工具变量。
➢ 使用phenoscanner消除混杂因素。
➢ 主要采用IVW方法。
➢ 加权中位数和MR-Egger回归用于敏感性分析。
➢ 通过Cochran Q测试评估异质性。
➢ 利用MR-Egger回归的截距来评估多效性和应用MRPRESSO。
这些就构成了孟德尔随机化分析的核心步骤。


💖注:接下来我会继续挑战更多孟德尔相关的研究,可能会适当延长挑战时间(因为实在太忙了!)

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