7天完成肠道菌群孟德尔随机化sci挑战!第2~3天!

第2~3天!7天完成肠道菌群孟德尔随机化

这两天顺利完成了初步选题(3个)和肠道菌群数据下载(图1),初步分析期间电脑崩了一次,遂在线指导师弟分析,20分钟教会
肠道菌群孟德尔随机化非常简单,看完这篇笔记,你就掌握啦(IF+5)

第一步、下载肠道菌群数据作为暴露(MiBioGen)

第二步、根据自己研究方向,下载结局数据或使用IEU结局数据
(IEU数据加载太慢,我让师弟做的课题使用下载的数据,我继续使用在线数据库)

第三步、数据处理(过滤、协调、合并)

第四步、孟德尔随机化统计分析及结果可视化(森林图、散点图等)

需要注意的是,肠道菌群数据量比较大,常规跑循环时间太久,一报错前面的努力白费!因此建议大家通过分割肠道菌群数据,然后和结局做MR,得出结果。
总体来说,肠道菌群难度很小,师弟二十分钟掌握后告诉我,还是我的光速攥写SCI论文有意思。事实也是如此,任何方法都有过时的一天,只要会快速写论文,方法学起来很快的。

❤️注释:这样的挑战难度系数太低啦,后面让我的师弟师妹们来完成这样的挑战,选定课题,我来指导他们在规定时间内完成一篇SCI论文,你们想看吗?
不管如何,这个挑战我会做完,三个选题,让师弟做一个,我自己做两个,哪个数据好看就写哪个~
晚安~~

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