DAY9｜IF6.6孟德尔随机化论文解读

这篇文献采用Mendel随机化(Mendelian randomization, MR)的方法探究了肠道微生物组成与大抑郁障碍(major depressive disorder, MDD)之间的因果关系。
方法部分:
1. 获得了两组GWAS的数据。第一组是24个队列18340例 participates 的肠道微生物组成的GWAS数据,该数据来自国际MiBioGen consortium。第二组是29个队列480359例participates的MDD GWAS数据,主要来自精神遗传学联盟(Psychiatric Genomics Consortium)。
2. 从肠道微生物GWAS数据中筛选出p值<5e-8的SNPs作为肠道微生物的遗传工具。从MDD GWAS数据中也筛选出p值<5e-8的SNPs。这些SNPs与疾病之间符合Mendel随机分配的原则。
3. 将两组GWAS数据进行协调,删除具有中间等位基因频率的回文SNPs。使用反方差加权(inverse-variance weighted)元分析方法将暴露因素(肠道微生物)对结果(MDD)的影响效应大小进行整合。
该研究发表在Journal of Affective Disorders,这是一本关于情感障碍领域的权威杂志,影响因子6.6,出版方为Elsevier。