2024年3月1区单基因纯生信文章揭秘！

文章题目：Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas r

DOI：10.3389/fimmu.2024.1372113

中文标题：新的预后生物标志物 TBC1D1与胶质瘤的免疫治疗耐药相关

发表杂志：Front Immunol

影响因子：1 区，IF= 5.7

发表时间：2024年3月

今天给大家分享一篇 2024 年 3 月发表在《Frontiers in Immunology》（Q1 区，IF=5.7）的文章。

研究的背景： 本文研究的背景是关于胶质瘤（glioma），这是一种具有侵略性的脑肿瘤，对治疗抵抗性的机制理解存在挑战，尽管免疫疗法已显示出有希望的结果。

研究的目的： 研究的主要目的是全面调查 TBC1 Domain Family Member 1（TBC1D1）在胶质瘤免疫治疗抵抗中的作用和机制，并探索其作为预后生物标志物的潜力。

研究方法：

1.通过分析 The Cancer Genome Atlas (TCGA)、Chinese Glioma Genome Atlas (CGGA) 和 Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库，识别与免疫治疗抵抗性相关的基因。

2.使用 qRT-PCR 和 Western blot 分析分别测量 TBC1D1 信使 RNA 和蛋白水平。

3.利用 Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) 揭示相关信号通路，并通过 GEO 数据库中的单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据分析 TBC1D1 在免疫细胞中的表达。

4.使用 Tumor Immune Dysfunction and Exclusion (TIDE) 数据库评估 T 细胞功能，同时使用 Tumor Immunotherapy Gene Expression Resource (TIGER) 数据库评估与 TBC1D1 相关的免疫治疗抵抗性。

5.利用 Kaplan-Meier 图、列线图和 ROC 曲线评估分子对预后的预测性能。

结果：

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结果解读：研究结果显示 TBC1D1 的高表达与胶质瘤患者的不良预后相关联，并且可能在免疫抑制性微环境中发挥作用，影响免疫治疗的有效性。

结论：研究表明，TBC1D1 表达的增加可能促进免疫抑制性微环境的形成，并预测不良的预后。阻断 TBC1D1 可能减少胶质瘤患者的免疫治疗抵抗性。

前单基因纯生信已经很难发了，但作者另辟蹊径的思路，值得我们学习借鉴~

课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油呀！