1区8.5“数据库友好”期刊文献解读:综合多组学分析
文章题目:Identification of potential therapeutic targets for nonischemic cardiomyopathy in European ancestry: an integrated multiomics analysis
DOI:10.1186/s12933-024-02431-8
中文标题:欧洲血统非缺血性心肌病潜在治疗靶点的鉴定:综合多组学分析
发表杂志:Cardiovascular Diabetology
影响因子:1区,IF=8.5
发表时间:2024年9月
今天给大家分享一篇在2024年9月发表在《Cardiovascular Diabetology》(1区,IF=8.5)的文章。本文这项研究利用了deCODE和FinnGen数据库的数据,探讨了非缺血性心肌病(NISCM)的新治疗靶点。
研究背景: 非缺血性心肌病(NISCM)是一类与冠状动脉疾病无关的心肌疾病,包括肥厚性心肌病、扩张性心肌病、限制性心肌病、糖尿病心肌病等。这类疾病具有多种潜在原因,如遗传倾向、自身免疫反应和毒素暴露,最终可能导致心力衰竭和心律失常。尽管NISCM的发病率显著,对发病率和死亡率有重大影响,但由于有效治疗靶点有限,它仍然是一个临床挑战。目前的治疗方法通常是症状性的,并不针对疾病的根本原因,这凸显了对精确有效的治疗干预的迫切需求。
研究方法: 研究者利用来自deCODE研究的约35,559名冰岛人的数据中的顺式pQTLs(位于基因附近或基因内部的遗传位点),以及FinnGen研究中包括1,754例NISCM病例和340,815名芬兰血统对照的SNPs数据。通过门德尔随机化(MR)分析估计循环血浆蛋白水平与NISCM风险之间的因果关系。对有显著关联的蛋白进行假发现率(FDR)校正,随后进行贝叶斯共定位分析。使用各种NISCM数据集进一步分析了前两种蛋白LILRA5和NELL1的表达。利用人类蛋白图谱(HPA)验证了蛋白的表达。使用比较毒理基因组学数据库(CTD)评估了环境暴露对LILRA5的影响,分子对接识别了潜在的小分子相互作用。
结果:FIGURES & TABLES
结果解读: MR分析确定了255种与NISCM相关的循环血浆蛋白,其中16种在FDR校正后仍然显著。贝叶斯共定位分析识别了LILRA5和NELL1为显著的蛋白,PP.H4 > 0.8。LILRA5具有保护作用(OR = 0.758),而NELL1显示出风险效应(OR = 1.290)。在糖尿病心肌病、肥厚性心肌病、扩张性心肌病和炎症性心肌病中发现LILRA5表达降低,而NELL1在肥厚性心肌病中的表达增加。HPA数据显示LILRA5在正常心脏中的中性粒细胞、巨噬细胞和内皮细胞中表达较高,而NELL1的表达有限。免疫浸润分析揭示了糖尿病心肌病中性粒细胞的减少。CTD分析识别了几个影响LILRA5 mRNA表达的小分子。其中,雌二醇、雌二醇-3-苯甲酸酯、加多迪胺、拓扑替康和睾酮能够稳定地与LILRA5蛋白结合。
结论: 基于欧洲血统队列的这项研究揭示了LILRA5和NELL1作为NISCM的潜在治疗靶点,LILRA5在糖尿病心肌病中显示出特别有前景的潜力。几个小分子与LILRA5相互作用,暗示了潜在的临床应用。
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