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医学生速看挑战5天一篇蛋白组学SCI论文Day4
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今日任务清单:
1数据出结果:循环代码的好处就是拿个开着电脑让它放着跑就好,其他不需要管,去忙自己的事情,我睡前开着电脑,睡醒代码已过半,今天继续放着跑,跑完有个汇总表格已经整理好了。
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2 筛选数据:准备好了数据,接下来就是进一步筛选符合要求的数据,本质上就是进阶版的双样本孟德尔,因此筛选标准大差不差,结果分析都呈现出非常棒的效果,每个蛋白的留一法图、森林图、散点图、漏斗图都已经跑出来了,现在对于数据的要求越来越高,我设定矫正P值需要小于0.05,简直是美滋滋啊!
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3 筛选阳性蛋白进行PPI预测:把筛选的阳性蛋白进行PPI预测,放入网站几分钟出图。
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4 功能富集分析:对结果进行通路富集分析,看看有没有合适的通路。假如有实验条件的师弟师妹后面可以把这些作为自己的前期结果,进行湿实验验证一下,干湿结合,高分到手。
5 我还进行了根据自己的阳性蛋白进一步筛选进行了共定位分析,但是结果一般般,就不进行进一步展示了。
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6 高分范文模仿:拿出Day 3精读的2篇高分孟德尔分析文献,开始模仿写作。
明天就是最后的冲刺了,我们要一口气完成Introduction的写作,还要进行Abstract、文献引用、模板化写作等一系列收尾工作。然后就可以按照目标期刊的要求,投出我的稿件了。
近期有越来越多的小伙伴想要加入我们的学习大军啦!很高兴一次次的挑战分享能帮到大家,欢迎来一起梳理流程、互相加油!