新开课程!孟德尔随机化高分攻略:皮肤菌群(多数据库整合)
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最近,孟德尔随机化方法在科学界引起了广泛关注,其相关研究成果频频见诸SCI各大顶尖期刊,并屡屡斩获高分,成为科研界的新宠。
继我们之前推出的线上课程(731免疫细胞、1400代谢物、蛋白组学)受到众多师弟师妹的热烈好评后,我们决定继续推出这一线上学术盛宴《孟德尔随机化高分攻略:皮肤菌群》!让我们跟随小编一起深入了解皮肤菌群的魅力吧!
数据介绍
皮肤菌群,也称为皮肤微生物群或皮肤微生物组,指的是栖息在人体皮肤上的各种微生物的总体,包括细菌、真菌、病毒和微小的寄生虫。这些微生物分布在皮肤的不同区域,包括油脂较多的部位(如面部和背部)、湿润部位(如腋下和脚趾间)以及干燥部位(如手臂和腿)。每个区域的微生物组成具有显著差异,由个体的遗传背景、环境、年龄、性别、饮食、生活方式等多种因素共同影响。
皮肤菌群主要功能和作用:保护作用:皮肤菌群通过占据生态位、产生抗菌物质等机制,帮助抵抗病原微生物的侵袭,从而保护皮肤不受感染。免疫调节:皮肤微生物可以影响宿主的局部和全身免疫反应,通过与皮肤免疫细胞的交互作用,调节免疫系统的发展和功能。
数据来源
时间:2021年
期刊:nature communications(1区 IF=14.7)
原文DOI:10.1038/s41467-022-33906-5
数据个数:150个
数据特点:数据量大,适合各种分析
人群:欧洲的两个人群KORA FF4 + PopGen,交叉验证增加可信性数量
分类:区分了各种部位,例如手臂,肘窝等,也分了潮湿干燥的状态
适用分析:各个系统疾病,甚至可以联合多组学分析(如肠道菌群、炎症蛋白、血浆代谢物、血浆蛋白)
该数据集量大,下载后分析处理较为困难,需要一定的代码基础,普通的电脑耗时较长,且容易卡顿!
但是,我们已经为大家准备好了数据~
分析代码及步骤
阈值:1e-6,5e-8,5e-6(5e-8很难有阳性结果)
Step1:利用孟德尔联合皮肤菌群,筛选出合适的阳性菌群
Step2:根据阳性菌群,绘制森林图(个性化)
Step3:根据自己需求进行设计(联合炎症蛋白组学和肠道菌群)
Step4:联合chatgpt进行文章撰写
Step5:一对一个性化选刊
课程目录
(1)经典解读(1区)及高性价比文章解读
(2)高性价比范文复现
(3)代码演示,一对一指导代码问题
(4)结果报告与解读思路讲解
(5)一对一指导文章撰写
(6)一对一选刊
(7)一对一返修、回复审稿意见
配套资料
(1)经典范文、皮肤菌群原始文章、高性价文章
(2)MR的三大假设理论及基本概念
(3)超实用的文件编辑器
(4)完整处理好的皮肤菌群数据
(5)超好用的智能化的代码
(6)参考文献及资料
(7)选刊宝典(私藏班)
适用人群
本科生:需要发文章保研/增加考研面试分的大学生;
研究生:面临毕业、考博、找工作的研究生;
临床医生:需要文章晋升、申请课题的临床医生;
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团队介绍
光速科研自2023年9月11日开课以来,一大批信任我们的师妹师弟加入了学习,也加入了我们的线上师门,我们会不断更新优质课程以供线上师门的师妹师弟学习。
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