给大家普及一下,6个月从0写一篇SCI的强度

6个月,从小白写出一篇生信SCI,我的时间线👇

[一R]研究思路设计(大概3周)

生信虽有套路,但是没有创新性的文章也越来越难发。

前期一定要花点时间打磨研究思路设计。

[二R] 数据挖掘(大概1周)

学习生信常见数据库的挖掘,比如GEO、TCGA 等。

如果没有人带,自己要找代码、调试,解决报错的话,时间会更久。

[三R]数据清洗和整理(2个月)

将数据处理成符合特定格式的制式,并且各项信息要全面、去缺失值、去重复值。

这是生信分析的第一步很重要,决定后面的路是否顺利。

[四R]数据分析(2个月)

通常包含①差异基因筛选②功能富集分析及聚类分析 ③网络分析④生存率分析

多看文献,总结分析思路。

[五R]SCI写作 (1个月)

如果前面的分析都做好了,写作会很快。


总共耗时:6个月左右!

接下来就是选刊投稿返修啦……

刚开始学的时候,几乎所有概念都不知道,懵逼状态大概持续了1个月之久。

0基础学习生信分析,到底要经历些什么?
只有经历过,才有发言权。今天与大家分享一些学习经验:


1. R语言学习

R语言的课程视频网上到处都是。对于一个初学者来说,我们只要学会分析数据,至于更高的内容,比如编写脚本或者函数之类的我们就不用学了,学会怎么用别人的代码才是我们学习的目的

刚开始学R语言建议找一个基础的视频看,至少要把基础代码都过一遍,基本上1-4分生信相关文章简单数据,你都可以通过“拷贝教学”课程获得,编辑修改就足够用了,够用即可。


2. 下载数据

GEO的数据下载还好说,TCGA数据从官网下载是一个大坑!我们是学习一定程度以后才发现可以从自己用R语言编写一段代码来直接整合下载数据。

部分适合初学者的数据获取方式也不会太难(原始数据除外)。Pubmed上那些低影响因子的生信比较水的文章上的数据,基本都很好下载!

自己多操作几次了,这个环节不用压力太大。


3. 文献阅读

多读文献,总结生信分析套路!毕竟我们最后的目的是文章!不是炫酷的图表!

但是大家要注意,套路并不是放之四海皆可用,有很多套路可能在某类疾病中适用,换一类就完全不适用了。


在PubMed输入TCGA或者GEO等检索会弹出很多文章。
第一步是看文章的标题,知道它要讲一个什么样的故事。
第二步是关注它的摘要,可以只看背景部分,相当于把正文的introduction看了。方法和结果可以留到后面阅读正文的时候看。


4. 曲折之路

你以为的生信:酷酷分析出图一顿描述加讨论投稿稿。
实际上你接触的生信:一遍分析,找假设,做生理加化表述,写作提交去表格描述和理解程序,再突出创新点点大实际意义,全部细节!

而且生信类文章不用学几个套路就能发,套路被用多了,审稿人也会质疑,你的文章如果只有套路,那基本就是不断遭遇拒稿。

此外,我经常是以致敬勤勤恳恳,最后发现统计出来的数据完全不能用,这个就和做实验一样,不停失败,不停换方法。


千言万语一句话:一定要培养自己解决问题的能力,生信分析并不是学到极致,而是会用。


总结生信SCI写作共通的模板→进行SCI写作填空。

不同的人,有不同的学习模式,不同的时间管理,从而会有不同的答案。有的人虽然是零基础的,但他得到了别人的指导,预先规避掉了所有坑,搭载高效列车,可能半年就可以出文章;而有的人,全部东西都是自己慢慢摸索,学习能力还一般,可能一两年出文章也不奇怪。

[偷笑R]所以,如果你不想走弯路,节约时间、精力成本的方式就是找个老师指导你噢!现在教育资源丰富,不愁找不到好老师!!

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