纯生信还能发吗？试试TWAS数据库！

今天给大家推荐一个生信数据库👇

TWAS数据库是整合了GWAS（全基因组关联分析）和基于共同变异的表达图谱研究结果的数据库，旨在确定与表型相关的基因表达调控区域。这类数据库通过整合和分析大量的遗传变异、基因表达和表型数据，为研究者提供了探索基因和性状之间复杂关系的宝贵资源。其中，TWAS Atlas是一个典型的TWAS数据库，它整合了广泛文献中的TWAS发现，为研究者提供了一个强大的资源平台。

⭕TWAS数据库的数据类型

TWAS数据库中的数据类型主要包括以下几种：

遗传变异数据：这类数据通常来自GWAS研究，包括单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失（InDel）等遗传变异信息。这些数据是TWAS分析的基础，用于识别与表型相关的遗传变异。

基因表达数据：基因表达数据通常来自RNA-seq、微阵列等高通量测序技术，用于测量不同组织或细胞中基因的表达水平。这些数据在TWAS中用于构建表达量数量性状位点（eQTL）模型，进而识别与遗传变异相关的基因表达变化。

表型数据：表型数据是指可观测的生物学性状或疾病状态信息。在TWAS中，表型数据用于与遗传变异和基因表达数据进行关联分析，以识别与特定性状或疾病相关的基因。

整合分析数据：TWAS数据库还包含整合分析数据，即将遗传变异、基因表达和表型数据进行综合分析后得到的结果。这些数据通常以特定基因与表型之间的关联形式呈现，为研究者提供了直接的生物学意义。

今天要分享的学员就是挖掘TWAS数据库，没有做实验验证成功发表的，一起来看看今天的学员案例吧

接收期刊：Turkish Journal of Gastroenterology

📉IF=1.4；中科院4区SCI

📍发文方法：生信分析

🔬研究方向：【胃肠肝病方向】