一声不响发了篇生信分析🥵(附学习清单)

[向右R]这篇给卷不动医学科研的,或者急需要一篇SCI的医学生们!

虽然不是每个医学生都要成为科研型医生,但是没有点科研成果,确实寸步难行。卷不动就找野路子,做腻了Meta分析就学一学生信分析,先保障科研成果够用。(至少申博评职称不会被科研卡脖子!)

[火R][火R]从小白到生信分析高手,需要学习的内容:

[一R]基础知识学习

了解分子生物学和遗传学

熟悉高通量测序技术

学习Linux操作系统

[二R]编程语言学习

Python、R语言

[三R]统计学基础

数据预处理

差异表达分析

功能富集分析

数据可视化

[四R]实践与应用

复现文章:通过复现,初学者能够更熟练地使用常见工具和方法,提高数据分析的准确性与效率。

[五R]高级技能学习

加权基因共表达网络分析

随机森林模型

听劝,生信才是医学生的科研天堂!

这篇给卷不动医学科研的,或者急需要一篇SCI的医学生们!科研基础差,还容易焦虑 ‼️‼️‼️ 先来对号入座 ‼️‼️‼️

1️⃣ 家里第一个医学生,没背景,没资源。
2️⃣ 双非本硕,不上不下,劝儿不知道往哪里使。
3️⃣ 科研基础差,再向上根本卷不动,于是先找个班上。在医院又因为科研短板,迟迟不能晋升,越混越无希望。
4️⃣ 但人挺倔的,也爱医学,如今重拾科研与小年轻卷。

虽然不是每个医学生都要成为科研型医生,但是没有点科研成果,确实寸步难行。卷不动就找野路子,做腻了Meta分析就学一学生信分析,先保障科研成果够用。(至少申博评职称不会被科研卡脖子!)

‼️ 为什么劝医学生学习生信分析?

很多医学生接触生信分析就是为了快速“水”一篇文章。没错,随着公共数据库的发展,如GEO等数据库,提供了大量的生物数据,无需研究者亲自进行大规模的实验来收集数据,大大节省了研究时间与成本。

如果你的生信分析技巧足够熟练,生信分析可以帮助你快速完成一个项目,从课题设计到数据分析,再到论文撰写和投稿,整个过程可以在数月内就完成!

生信分析也成了不少人毕业的救命稻草!但其实,医学生学习生信分析的价值远不止发表一篇SCI,更长远的效益,没人和你说。

先说结论,生信分析其实是像英语一样的加持工具,你如果能熟练掌握,就是你的一大优势,不管是对科研还是对临床都有很大帮助!

价值如下👇👇

1. 数据驱动的医学研究

生物信息学分析为生物医学研究提供了强大的数据处理和分析工具,帮助研究人员从海量的生物数据中挖掘出有意义的信息。

通过生物信息学分析,可以对基因组、转录组、蛋白质组等多个层面的生物数据进行综合分析,揭示疾病发生发展的分子机制。

2. 精准医学和个性化治疗

生物信息学分析可以帮助医生根据患者的基因型、表型等个体特征,实现个性化治疗方案的设计和优化。

基于生物信息学分析的精准医学方法,可以提高治疗的效果和预防不良反应,为患者提供更加个性化的医疗服务。

3. 疾病诊断和预测

生物信息学分析在疾病的早期诊断和风险评估中发挥重要作用,通过分析生物标记物和遗传变异等信息,可以预测疾病的发生和发展趋势。

结合生物信息学分析的方法,可以建立疾病诊断模型和预测模型,提高疾病的诊断准确性和治疗效果。

4. 药物研发和药物再利用

生物信息学分析在药物研发过程中发挥着重要作用,可以加速药物筛选、靶点识别和药效预测等步骤。

4、疾病机制和生物标志物研究

生物信息学分析有助于揭示疾病的潜在机制和生物标志物,为疾病的预防、诊断和治疗提供理论基础和实践指导。

结合生物信息学分析的结果,可以开展系统生物学研究,深入理解疾病的发生发展过程,为新药研发和临床治疗提供有力支持。

‼️ 那么医学生如何从0开始吃透生信分析?

基础知识学习

  • 了解分子生物学和遗传学:掌握DNA、RNA、蛋白质、基因组和转录组等基础知识。
  • 熟悉高通量测序技术:了解不同测序技术的原理和应用场景。
  • 学习Linux操作系统:掌握基本命令操作,如文件管理、权限管理、Bash脚本编写等。

编程语言学习

  • Python:掌握基础语法,学习数据处理库(如pandas)和可视化库(如matplotlib、seaborn)。
  • R语言:学习基本语法,熟悉数据结构和常见操作,学习数据可视化工具(如ggplot2)。

统计学基础

  • 数据预处理:包括质量控制、过滤和规范化。
  • 差异表达分析:筛选出在不同条件下表达显著不同的基因或蛋白。
  • 功能富集分析:探索基因的生物学功能和信号通路。
  • 数据可视化:使用R语言或Python绘制图表,如火山图、热图和PCA图。

实践与应用

  • 复现文章:通过复现,初学者能够更熟练地使用常见工具和方法,提高数据分析的准确性与效率。
  • 选择优质教程与文献:优先选择评价高、反馈好的优质教程或经过验证的经典文献。

高级技能学习

  • 加权基因共表达网络分析(WGCNA):使用R包“WGCNA”分析基因模块,识别与疾病特征之间的关系。
  • 随机森林模型:评估基因的重要性,筛选出具有诊断潜力的核心基因。
  • 生存分析:评估基因表达水平与患者生存时间的关系,判断基因的预后价值。

通过以上步骤,可以系统地学习生信分析,从基础知识到高级技能,逐步掌握生信分析的核心技能。

当然生信分析有一定门槛,对于0基础的人来说,刚开始找个人带你会更容易上手,凡事都是入门难,因为新手有很多坑,大家都是踩过后才知道,但是有人提前带你规避新手坑,学起来自然高效!

就像在统计之光学习生信分析的学员,大家基本都是0基础,跟着老师学,从0将一个全新的生信分析课题落地,不仅学知识,还能学习如何完成一个项目,在这个过程中你能切实锻炼提升科研能力!

信息化时代,从来都不缺大把学习资料,生信分析的知识哪里都可以学。稀缺且珍贵的永远是定制化的、个性化的服务,统计之光为每位报名的医学生/医生打造了一个科研指导小圈,一个团队协助陪跑,科研氛围拉满!

人是会被圈子影响的,如果你周围都没有生信课题组,自己闭门造车,99%失败告终。

而在一个有学习氛围的圈子里,边学边练,把每一个生信难关突破,事半功倍!

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