
不想打击学生信分析的同学,但我真想说…
大火的生信分析是什么?对医学生真的很重要吗?很多宝宝希望能系统介绍下,今天就给大家分享一些入门生信分析前,必须要清楚的知识。
生信分析能做什么?对医学生为什么重要?
生信分析可以用来做很多事情,包括获取数据、清洗数据、分析数据、可视化数据等。可以帮助我们了解数据,发现数据中隐藏的规律,并且能够对数据进行有效的分析。
想象一下,实验室产生了成千上万的数据,例如基因序列、蛋白质结构、细胞表达数据等,单靠人工处理根本不可能。
生信分析通过计算机和算法,可以快速处理这些数据,找出其中的规律和异常,比如识别出与某些疾病相关的基因突变,预测药物靶点,或者理解不同细胞在某种疾病状态下的行为变化。
所以,学习生信分析不仅仅是为了快速发表一篇SCI,生信分析是我们科研中不可或缺的工具。
医学生如何快速入门生信分析?
不得不说科研的各种研究套路都有其相通之处,即使不是生信专业,我们从应用生信的角度入手,用对了方法,下足了功夫,也能轻松在算时间内入门生信分析。
生信学习分道和术的学习两方面。
关于道,生信分析的模块概括成4部分:
①表达差异
②聚类分析
③交互网络
④临床意义
至于术的学习,主要是掌握生信分析的基本操作方法。生信分析包括数据库和软件编程。
大火的生信分析是什么?对医学生真的很重要吗?
很多宝宝希望能系统介绍下,今天就给大家分享一些入门生信分析前,必须要清楚的知识。
① 何为生信分析?
生信分析是科学家们利用生物信息学技术定位和研究基因组中的生物标志物,并对其进行功能分析的一门学科。
生信分析的主要任务是利用生物信息学方法对生物数据进行分析,以提取有用的信息,帮助人们理解生物体的结构和功能。
生信分析包括对 DNA、RNA 和蛋白质序列 的分析,以及对 各种生物数据(如基因组、蛋白组、代谢组等)的分析。
常见的生信分析方法有:
- 序列比对
- 序列 assembly
- 序列注释
- 基因组全排序
- 蛋白组全排序
- 代谢组全排序
- 转录组分析
- 基因组进化分析
- 蛋白组进化分析
② 生信分析能做什么?对医学生为什么重要?
生信分析可以用来做很多事情,包括:
获取数据、清洗数据、分析数据、可视化数据 等。
可以帮助我们了解数据,发现数据中隐藏的规律,并且能够对数据进行有效的分析。
实验室会产生大量数据,如基因序列、蛋白质结构、细胞表达数据等,单靠人工处理几乎不可能。
通过计算机和算法,生信分析可快速处理这些数据,找出规律和异常,例如:
- 识别基因突变
- 预测药物靶点
- 理解细胞在不同疾病状态下的行为变化
➡ 学习生信分析不是仅为了发 SCI,更是科研中不可或缺的工具,在临床上也能帮助我们发现新的治疗方法。
③ 医学生如何快速入门生信分析?
即使不是生信专业,也能从应用角度入手,掌握方法并通过实践快速入门。
从哪里入手?
生信学习分为 道 和 术 两方面。
道:构建生信知识体系的顶层架构,掌握模块化的逻辑方法,分辨处理数据模块组合方式,形成套路化文章。
生信分析的模块概括为 4 部分:
① 表达差异
分析 正常样本与疾病样本、不同演进阶段样本、不同组织样本之间的 差异表达。
也是研究具有意义的前提。
通过此步骤筛选出 差异表达的基因列表。
② 聚类分析
聚类分析有两大作用:
- 检验样本质量:判断样本之间是否聚类清晰,有无混淆,检查数据质量。
- 表达和功能聚类:将相似功能的基因聚在一起,关联生物学模型,预测通路机制。
③ 交互网络
交互网络分两类:
- 化合物与分子的调控关系
- 预测药物靶点、耐药靶标
- 反推靶标的潜在小分子药物
- 分子之间的调控关系
- 预测蛋白-DNA结合位点
- 预测转录因子结合位点等
④ 临床意义
临床意义包括“三表一图”的统计性分析,也包括构建临床预测模型+的预测性分析。
“三表一图”包括:
- 基线资料表
- 单因素分析
- 多因素分析
- 生存曲线图
临床预测分析主要用于:
- 预后分析
- 诊断分析
- 复发风险预测
至于“术”的学习,主要是掌握生信分析的基本操作方法。
生信分析包括:
- 数据库
- 软件编程
网上有很多教程,这里就不赘述啦~
📌 医学生学习生信分析的 重点是要解决问题,不是为了成为生信专家。
所以不需要学到极致,而是学有用的!