小学生都能懂的生信分析文章类型🤐

生信文章包含哪些类型

生信文章包含哪些，我用一句话来总结：

凡是基于测序数据进行分析的文章，都是生信文章，如果按照这个观点来看的话，单细胞测序与孟德尔随机化研究，毫无疑问也是属于生信。

🌞 传统的生信，主要分为这四步：

1️⃣ 第一步是针对测序数据进行差异分析，找出不同分组样本当中，差异表达的基因🧬。

2️⃣ 第二步是针对差异表达的基因，进行功能聚类，将差异基因按照不同的信号通路或者相关功能进行富集分析。

3️⃣ 第三步就是构建分子互作网络，也就是找到这些差异表达基因之间的一些内在联系。

4️⃣ 第四步，回归到我们研究科学问题本身，上述这些基因表达差异、信号通路或者功能的差异，以及分子之间相互联系，具体反馈到我们实际研究的科学问题上，会得到怎样的结论？

🌞 单细胞测序，其实就是针对不同细胞亚群的研究，主要用于三个方面的研究：

1️⃣ 第一个是图谱类研究，主要就是回答一个问题，你的研究样本，具体包含哪些细胞亚群，这些细胞亚群，有哪些特异性的分子，以及有哪些特异性的生物学功能。

2️⃣ 第二就是用于研究的发现阶段，主要发现与疾病相关的细胞亚群。

3️⃣ 第三个就是验证类研究，比如你通过其他手段，发现了一个关键分子与疾病的关系，那么你可以通过单细胞测序，看看这个关键分子在哪些细胞中表达，进而知道相关的细胞亚群与疾病的关系。后续再针对这个细胞亚群进行深入的研究。

🌞 而孟德尔随机化，用一句话来概括，就是利用自然界中，随机分配的基因型对表型的影响，进一步推断表型对疾病的影响。

主要是用于推导因果关系，比如，你通过调查发现，肥胖的人，患二型糖尿病的比例要比体重正常的人高，那么你要去弄懂，到底是肥胖导致的二型糖尿病，还是二型糖尿病导致的肥胖，这就需要用到孟德尔随机化研究。