
3.7 Q2 | meta | 浙江大学| 白细胞介素 4 基因多态性和结核病风险的荟萃分析

第一段–文章基本信息
文章题目:Interleukin 4 gene polymorphisms and the risk of tuberculosis: A meta-analysis
中文标题:白细胞介素 4 基因多态性和结核病风险的荟萃分析
发表杂志:Cytokine
影响因子:2区,IF=3.7
发表时间:2023年8月
第二段–本文创新点和科研启发
本文创新点和科研启发
研究方法的全面性:本研究通过系统检索多个数据库,全面收集了关于白细胞介素4(IL-4)基因多态性与结核病风险相关的研究。研究团队严格遵循纳入和排除标准,对文献进行多轮筛选,确保纳入的研究具有高质量和高可靠性。
揭示基因多态性与疾病风险的潜在联系:研究聚焦于IL-4基因的特定多态性位点,分析了这些位点在不同人群中与结核病易感性的关系。通过对比病例组和对照组的数据,揭示了某些基因变异可能增加个体患结核病的风险,为理解结核病的遗传易感性提供了新的视角。
对公共卫生和临床实践的潜在影响:结核病是全球公共卫生的重大挑战之一。本研究通过分析基因多态性与结核病风险的关系,为结核病的预防和控制提供了新的思路。了解基因因素在结核病发生中的作用,有助于优化公共卫生策略,提高资源分配的效率。
第三段-Introduction
背景
每年约有1000万人感染并死于结核病(TB),使其成为全球十大传染病中主要的死亡原因之一,尤其在东南亚、非洲和西太平洋地区更为严重。尽管全球约四分之一的人口携带结核分枝杆菌(MTB),但仅5%到10%的感染者会发展为活动性肺结核,这与病原体、宿主和环境因素的相互作用有关。细胞免疫反应在对抗MTB中至关重要,通过激活巨噬细胞并调节Th1与Th2反应之间的平衡来发挥作用。其中,白细胞介素-4(IL-4)作为一种关键的负性调节细胞因子,能够调节巨噬细胞表达、抑制Th1细胞产生干扰素-γ并促进Th2反应,可能导致结核病患者的不良后果,且其水平在晚期结核病患者中升高。IL-4基因位于5号染色体q31-q33上,其转录起始位点上游的589C/T、+4221C>A和-33C/T多态性已被证实可增强依赖IL-4的免疫反应。然而,过去十年中关于这些多态性与结核病发病率关系的研究结果并不一致。因此,本次荟萃分析旨在通过回顾以往相关研究,进一步探讨IL-4基因多态性与结核病风险之间的关系。
第四段-Methods
方法
检索策略
本次荟萃分析通过中国知网(CNKI)和PubMed数据库(最后一次检索更新时间为2023年1月10日)检索相关文章,使用的关键词包括:“tuberculosis or TB”或“interleukin-4 or IL-4”以及“polymorphism or variant”。同时,还对原始研究的参考文献进行了手工检索。
研究纳入和排除标准
研究纳入标准如下:1)在病例对照研究中比较结核病患者与正常受试者;2)评估IL-4多态性(-589C/T、+4221C > A和–33C/T)与结核病风险之间的关系;3)提供了足够的基因分型信息。研究排除标准如下:1)非病例对照研究,未评估IL-4多态性(-589C/T、+4221C > A和–33C/T)与结核病风险之间的关系;2)为信件、病例报告、社论或综述;3)缺乏原始数据或原始数据不足。对于相同研究团队发表的多篇文章,比较其参与者是否存在重叠。在部分重叠的情况下,采用最近发表的研究。
数据收集
两名评审者独立从每篇文章中获取数据,并根据上述标准纳入文章。如有分歧,通过协商解决。获取的数据包括:第一作者、发表日期、国家、病例组和对照组的基因型频率、病例数和对照数,以及对照组的哈迪-温伯格平衡(HWE)证据。
统计分析
使用Stata(版本12.0;StataCorp LP,College Station,TX,USA)进行统计分析,P < 0.05表示具有统计学显著性。为了评估IL-4基因(-589C/T、+4221C > A和–33C/T)多态性与结核病之间的关联强度,计算了A vs. a、AA vs. aa、Aa vs. aa、AA + Aa vs. aa以及AA vs. aa + Aa的比值比(OR)及其95%置信区间(95% CI)。其中,“A”和“a”分别表示主要等位基因和次要等位基因。此外,基于I²统计量计算了异质性程度,I² > 50%表示存在显著异质性。如果存在异质性,则使用随机效应模型计算汇总OR;否则,使用固定效应模型。进行单因素敏感性分析,以评估每项研究对汇总OR的影响。
使用Begg检验通过漏斗图评估发表偏倚。利用HaploReg 4.1(https://pubs.broadinstitute.org/mammals/haploreg/haploreg.php )对IL-4基因多态性进行生物信息学分析,以预测这些多态性的功能。
第五段-Results
结果
符合条件的研究
共识别出501项相关研究,其中14项符合纳入荟萃分析的条件。纳入的文章发表于2006年至2022年之间。图1展示了文章筛选流程图。对照组的基因分型数据通过哈迪-温伯格平衡(HWE)检验进行评估。在纳入的研究中,10项来自欧洲,4项来自亚洲。表1(-589C/T)、表3(-33C/T)和表5(+4221C > A)总结了研究特征和相关信息。
荨萃分析结果
白细胞介素-4(IL-4)589C/T多态性与结核病风险之间的相关性如图2和表2所示。我们的结果显示,IL-4 589C/T多态性与结核病风险之间无显著关联(T vs. C:比值比(OR)=1.12,95%置信区间(CI)=0.89–1.41;TT vs. CC:OR =1.33,95% CI =0.77–2.32;CT vs. CC:OR =1.13,95% CI =0.77–1.65;显性模型:OR =1.16,95% CI =0.77–1.74;隐性模型:OR =1.08,95% CI =0.91–1.27)。基于种族分层的亚组分析显示,IL-4 589C/T多态性与白种人结核病风险增加相关(隐性模型:OR =2.54,95% CI =1.30–4.96)。
在本研究中(见表4),IL-4 -33C/T多态性与结核病风险之间无显著关联(T vs. C:OR =1.26,95% CI =0.46–3.45;TT vs. CC:OR =1.70,95% CI =0.11–27.48;CT vs. CC:OR =1.29,95% CI =0.17–9.74;显性模型:OR =1.57,95% CI =0.12–20.16;隐性模型:OR =1.31,95% CI =0.50–3.40)。此外,IL-4 +4221C > A多态性与结核病风险之间存在关联(见表6,隐性模型:OR =1.40,95% CI =1.07–1.83)。
发表偏倚
Begg检验未发现发表偏倚的证据,表明不存在发表偏倚(见图3)。
功能预测
根据HaploReg数据,589C/T多态性之间存在连锁不平衡以及IL-4基因中的-33C/T和+4221C > A多态性(见图4)。
第六段–结论
结论
本次荟萃分析的结果表明,携带IL-4 589C/T多态性的白种人患结核病的风险增加,且IL-4 +4221C > A多态性与结核病风险相关。然而,未来的研究需要更大的样本量来进行验证。