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文章题目:Novel hypoxia- and lactate metabolism-related molecular subtyping and prognostic signature for colorectal cancer

DOI:10.1186/s12967-024-05391-5

中文标题:新型缺氧和乳酸代谢相关分子分型和大肠癌预后特征

发表杂志:Journal of Translational Medicine

影响因子:1 区,IF= 6.1

发表时间:2024年6月

今天给大家分享一篇2024年6月发表在《Journal of Translational Medicine》(Q1 区,IF= 6.1)的文章

研究的背景:结直肠癌(Colorectal cancer, CRC)是全球严重的健康负担,因其高发病率和死亡率而备受关注。肿瘤微环境(Tumor microenvironment, TME)中的缺氧和大量乳酸产生是 CRC 的标志。然而,缺氧和乳酸代谢对 CRC 的影响尚未完全阐明。

研究的目的:本研究旨在基于与缺氧相关基因(Hypoxia-related genes, HRGs)和乳酸代谢相关基因(Lactate metabolism-related genes, LMRGs)开发一种新的分子亚型,并构建一个用于预测 CRC 患者预后和治疗效果的模型。

研究方法:

1.从 TCGA 和 GEO 数据库下载了 CRC 的 RNA 测序数据和临床数据。

2.利用 R 软件包 DESeq2 进行差异表达分析。

3.通过无监督聚类进行分子亚型分析。

4.使用单变量 Cox 回归、随机森林模型、LASSO 和多变量 Cox 回归分析开发预测模型。

结果:

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结果解读:

1.将 575 例 CRC 患者分为三种分子亚型,并能明确区分它们的预后。

2.C1 亚型表现出高水平的缺氧,CD8 + T 细胞比例低,巨噬细胞比例高。

3.构建了 HLM(Hypoxia and Lactate Metabolism)评分预测模型,有效预测了   CRC 患者的预后和免疫疗法的疗效。

4.HLM 评分在多个数据集中得到验证,高 HLM 评分的患者表现出高水平的 CD8 + 耗竭 T 细胞(Tex)浸润,特别是在免疫微环境中的终末 Tex 和氧化磷酸化(OXPHOS)−Tex。

结论:研究表明,关于袢利尿剂对成人ICU患者液体过载的死亡率和严重不良事件的影响,证据非常不确定。袢利尿剂可能会减少这些结果的发生,但仍需要进行大型随机安慰剂对照试验,以降低偏倚风险。

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