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SEER+临床预测模型🔥我愿称之为王炸组合
今天给大家介绍一篇比较中规中矩的临床预测模型类文章:列线图预测低级别子宫内膜间质肉瘤患者的预后。👇👇
A nomogram for predicting overall survival in patients with low-grade endometrial stromal sarcoma:A population-based analysis
该文章是SEER数据库+临床预测模型的结合文章,无需自己收集数据,纯纯“空手套白狼”。
该文发文虽然有些早,但是文章结构完整、逻辑清晰、使用的方法也很常见。到现在也是一篇不过时的值得借鉴的文章,尤其是对于刚开始学习临床预测模型的同学来说。
作者从SEER数据库获取病例资料,先用一张table展示患者的基本信息。
然后就是划分数据,使用多种方法筛选变量,建立最终的模型。
并且使用多种指标评价模型。
并且与现存的其他模型进行比较,凸显自己模型的优秀之处。
最后是根据列线图计算患者得分,并进行危险分层,做log-rank检验,绘制K-M生存曲线。
患者选择
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从SEER数据库获取1172例患者
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首先是table 1,基线资料表。
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数据划分
按照7:3划分为训练集和外部验证集(注意并不是外部验证哦)。
变量选择
先用逐步回归,基于AIC筛选变量,然后使用先单后多筛选,最终得到7个自变量。用这7个自变量构建COX模型,并绘制列线图。作者还对这7个变量使用方差膨胀因子检查共线性。
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先单因素后多因素的结果
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以表格方式呈现。
模型评价
C-index和ROC曲线下面积评价区分度,校准曲线评价校准度,并和其他模型进行比较,用NRI和IDI评价,发现自己的模型更好,决策曲线也更好。
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根据列线图计算得分并进行风险分层、生存分析
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算出每个患者的得分,然后根据分数分成3层:低风险、中风险、高风险。然后进行logrank检验,画K-M生存曲线。