俺不中嘞，生信当前4大热门思路！！
① 非常空白的热点：棕榈酰化
棕榈酰化（palmitoylation）是一种广泛存在于细胞中的可逆脂质修饰过程，涉及到棕榈酸（palmitic acid）通过酯基转移酶共价附着到蛋白质的半胱氨酸残基上。
这个过程在细胞信号转导、蛋白质定位、膜蛋白的功能，以及免疫反应等方面起着重要作用。
超级混合分析结构框架如下：
- 表达差异
- 生信数据挖掘
- 临床样本测序
- 基础实验
- 功能（表达）
- eQTL、pQTL数据挖掘
- 基础实验
- 作用机制
- 中介分析
- 基础实验
详细思路步骤：
- 搜索整理棕榈酰化基因
- 提取棕榈酰化基因的 eQTL/pQTL 数据
- 棕榈酰化基因批量 eQTL/pQTL 分析
- 使用 SMR 分析进行验证
- 生信分析验证表达量并且锁定目标基因
- 探索目标基因上游的作用机制
- 探索目标基因下游的作用机制
② 老瓶装新酒：肠道菌群联合细胞焦亡
了解的同学大概清楚，传统的肠道菌群联合免疫细胞/代谢物孟德尔随机化分析思路，已经烂大街了，没有抓住机会的朋友也无法再回到23年\24年。
今天如果你还想做肠道菌群方向（因为老板只让做这个）。或许可以这样创新：肠道菌群通过调控分子 A，从而调控细胞焦亡，促进结局 C 的发生发展。
将肠道菌群和细胞焦亡联系起来，彻底走基础方向的路线，可以和生信分析联系起来，有条件的话还可以补基础实验。
- A（诱导因素） ➜ B ➜ 细胞表型（细胞焦亡）
步骤：
- 下载细胞焦亡相关的分子
- 提取细胞焦亡相关的 pQTL 数据
- 筛选与结局相关的肠道菌群
- 筛选与结局相关的细胞焦亡分子
- 筛选与肠道菌群相关的细胞焦亡分子
- 中介分析（确定具体的分子调控轴）
- 补充验证
③ 乳酸化
乳酸化（Lactylation）是一种蛋白质翻译后修饰，它通过乳酸分子与蛋白质上的氨基酸残基发生共价结合。乳酸化是一种相对较新的修饰，研究表明它可能在调节基因表达、细胞代谢和免疫反应中发挥重要作用。
可以看这篇生信文章：乳酸化+机器学习+预后模型+实验
Lactate-related gene signatures as prognostic predictors and comprehensive analysis of immune profiles in nasopharyngeal carcinoma
主要结果：
- 鼻咽癌差异表达基因及其功能分析
- 鼻咽癌相关关键模块基因的鉴定
- 乳酸相关 DEG 的鉴定及功能富集分析
- 一种基于 LR-DEG 的 NPC 签名方案的设计与验证
- 鼻咽癌生物标志物的临床相关性和功能富集分析
- TPPP3、MUC4 和 CLIC6 对鼻咽癌免疫微环境的影响
- 鼻咽癌的监管网络与用药分析
组蛋白修饰热点还有琥珀酰化、巴豆酰化等……
④ m6A
m6A（N6-methyladenosine）是指 RNA 分子中腺苷（Adenosine）的第六位氮原子（N6）发生甲基化形成的表现遗传修饰。
m6A 通过书写（Writers）-擦除（Erasers）-阅读（Readers）三元系统动态调控 mRNA 的命运（稳定性、翻译、剪接），在发育、代谢和疾病中发挥重要作用。
在基础科研中，m6A 基因基本都是充当工具分子，不断探索新的下游分子调控轴机制。
分析步骤：
- 搜索整理 m6A 基因
- 提取 m6A 基因的 eQTL/pQTL 数据
- m6A 基因批量 eQTL/pQTL 分析
- 使用 SMR 分析进行验证
- 生信分析验证表达量并锁定目标基因
- 探索目标基因的分子调控轴机制
通过上述一系列分析后，我们可以得出以下结论：
甲基转移酶 METTL14 调控代谢物/免疫细胞促进 xxx 疾病的发生发展。
