挑战7天光速完成一篇肠道菌群MR,Day 4-5!

进度汇报:数据下载+数据拆分+跑代码

做分析的过程可真不简单,
因为肠道菌群的数据量确实太大了,
还好电脑内存、配置还行,为了转移数据,
搞了个2T的大硬盘,本期挑战沉默成本陡然增加,
不过平时也能用上,把自己一些公开数据库的数据转移了一波,哈哈哈
只要思路对了,无非就是多花时间跑代码就好了~

因为肠道菌群的数据太大了,如果在跑的过程中出现了error,
那也就意味着需要重新跑一遍,
所以把代码进行了一些调整,把暴露的肠道菌群数据进行了拆分
让拆分后的数据和结局跑双样本MR,
然后再把跑出来的结果组合起来
这也算是节省时间了,但还是跑了2天才跑完

归根结底,还只是双样本MR而已,没什么太复杂的,只要懂了基础,无非就是换了数据来源而已,比如有人测了口腔菌群、皮肤菌群的GWAS数据,方法都是一样的,我们之后慢慢挑战,只是跑数据需要大量的时间

这篇文章我觉得基本是挑战成功了
我只要能够跑的出来图片
后面的写作简直易如反掌,
因为我有“框架写作法”指导我进行写作
1-2天写完是绰绰有余的,就是跑代码太烧电脑了

写不出来文章,那就没有意义。同时,我们也要反思,高分SCI其实就是Paper Tiger而已,没什么复杂和困难的,重点是思路,这就是我花了很多的时间进行选题的意义,就是在进行可行性分析,千万不要一来就闷头开跑,睁开眼睛看世界!一起加油呀~
最近有一些师弟师妹们来找我学习和咨询,包括前期的挑战Meta分析也好,我准备了一整套的完整方案,从文献阅读→选题→数据分析→论文框架→论文写作→方法学(双样本MR、药把、中介、多变量、肠道菌菌群、Meta、NAHNES、GBD。。。)

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