挑战7天光速完成一篇肠道菌群MR,Day 2-3!

我的新挑战持续进行中~

第2-3天了:
工作重点都集中在选题和阅读范文上,不管做什么类型的研究、不管做那种类型的MR,我们都需要花大量的时间进行选题评价,所以我用了2天的时间来进行选题确定,就是为了避免出现做完了工作发现已经被别人写了?选题不合适?等情况

说到肠道菌群孟德尔随机化,其实它就是双样本MR的plus pro max版本!就是一个暴露对应一个结局,只不过我们现在的暴露换成了肠道菌群,那我我们进行模仿的时候主要的就是去替换结局,比如别人做的比如别人写了自身免疫性肝炎,我就在想能不能写自身免疫性脑炎呢?
理解起来超简单的,代码也不难掌握。最大的挑战,就是数据处理啦!毕竟这么多细菌,那么他的GWAS数据肯定是非常庞大的,细菌的基因总数比我们人类自身的基因多150倍!
面对这么大量的GWAS数据,我已经做好准备了!代码都备好了,我的目标期刊是Journal of Affective Disorders,所以我选了里面两篇相关的文章来参考,换个角度,换个结局,就是我的新选题啦!

比如别人写了肝癌,我能不能试着写结直肠癌呢?当然这只是个例子啦!但确实在临床上确实有它的意义。然后把别人做过的疾病换个自己领域的疾病,就能写出一篇新文章,同时,我们也可以把肠道菌群看成中介变量,和中介MR联系起来,这样文章就更丰富了!

当然啦,数据量大是我们跑结局的一个限制因素。但只要我们掌握多种MR的方法,并且加强代码和写作能力的练习,相信高分MR就在眼前啦!
好啦,今天的分享就到这里啦!

我的新挑战持续进行中~

第2-3天了:
工作重点都集中在选题和阅读范文上,不管做什么类型的研究、不管做那种类型的MR,我们都需要花大量的时间进行选题评价,所以我用了2天的时间来进行选题确定,就是为了避免出现做完了工作发现已经被别人写了?选题不合适?等情况

说到肠道菌群孟德尔随机化,其实它就是双样本MR的plus pro max版本!就是一个暴露对应一个结局,只不过我们现在的暴露换成了肠道菌群,那我我们进行模仿的时候主要的就是去替换结局,比如别人做的比如别人写了自身免疫性肝炎,我就在想能不能写自身免疫性脑炎呢?
理解起来超简单的,代码也不难掌握。最大的挑战,就是数据处理啦!毕竟这么多细菌,那么他的GWAS数据肯定是非常庞大的,细菌的基因总数比我们人类自身的基因多150倍!
面对这么大量的GWAS数据,我已经做好准备了!代码都备好了,我的目标期刊是Journal of Affective Disorders,所以我选了里面两篇相关的文章来参考,换个角度,换个结局,就是我的新选题啦!

比如别人写了肝癌,我能不能试着写结直肠癌呢?当然这只是个例子啦!但确实在临床上确实有它的意义。然后把别人做过的疾病换个自己领域的疾病,就能写出一篇新文章,同时,我们也可以把肠道菌群看成中介变量,和中介MR联系起来,这样文章就更丰富了!

当然啦,数据量大是我们跑结局的一个限制因素。但只要我们掌握多种MR的方法,并且加强代码和写作能力的练习,相信高分MR就在眼前啦!
好啦,今天的分享就到这里啦!


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