跟着顶刊学做MR，今天分享一篇多中心合作的MR，探究血浆蛋白与 2 型糖尿病和糖尿病并发症之间的关系。结局为糖尿病相关指标（包括2型糖尿病和10中糖尿病并发症）的文章已经非常多了，本文章特别的地方在于暴露为血浆蛋白，并且使用共定位分析。文章意义非凡：在 1,886 种蛋白质中，遗传预测的 47 种血浆蛋白水平与 2 型糖尿病有关。这些蛋白质中有 11 种具有强大的共定位支持。17 种蛋白质与至少一种糖尿病并发症相关。 希望接下来能整理出血浆蛋白的数据，换个结局就是一篇新TOP！ 课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油呀！ 文章题目：Plasma proteins and onset of type 2 diabetes and diabetic…
今天分享一篇来自广西中医药大学的双样本，结果为阴性竟然也发了一区，暴露为吸烟，结局为静脉血栓栓塞，文章提供了吸烟不影响静脉血栓栓塞风险的遗传学证据。Thrombosis and Haemostasis是一本关注静脉血栓的杂志，然后发现期刊出版了类似研究探究暴露（糖尿病、循环细胞因子）与结局（静脉血栓栓塞）的双样本MR、双向MR。So？换个暴露，这就是我的目标期刊。 课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油呀！ 文章题目：No Genetic Causality between Tobacco Smoking and Venous Thromboembolism: A Two-Sample Mendelian Randomization Study DOI：10.1055/s-0044-1781425 中文标题：吸烟与静脉血栓栓塞之间没有遗传因果关系：一项双样本孟德尔随机化研究 发表杂志：Thrombosis and Haemostasis 影响因子：6.7 发表时间：2024年2月…
我的新挑战持续进行中~ 第2-3天了:工作重点都集中在选题和阅读范文上，不管做什么类型的研究、不管做那种类型的MR，我们都需要花大量的时间进行选题评价，所以我用了2天的时间来进行选题确定，就是为了避免出现做完了工作发现已经被别人写了？选题不合适？等情况 说到肠道菌群孟德尔随机化，其实它就是双样本MR的plus pro max版本！就是一个暴露对应一个结局，只不过我们现在的暴露换成了肠道菌群，那我我们进行模仿的时候主要的就是去替换结局，比如别人做的比如别人写了自身免疫性肝炎，我就在想能不能写自身免疫性脑炎呢？理解起来超简单的，代码也不难掌握。最大的挑战，就是数据处理啦！毕竟这么多细菌，那么他的GWAS数据肯定是非常庞大的，细菌的基因总数比我们人类自身的基因多150倍！面对这么大量的GWAS数据，我已经做好准备了！代码都备好了，我的目标期刊是Journal of Affective Disorders，所以我选了里面两篇相关的文章来参考，换个角度，换个结局，就是我的新选题啦！ 比如别人写了肝癌，我能不能试着写结直肠癌呢？当然这只是个例子啦！但确实在临床上确实有它的意义。然后把别人做过的疾病换个自己领域的疾病，就能写出一篇新文章，同时，我们也可以把肠道菌群看成中介变量，和中介MR联系起来，这样文章就更丰富了！ 当然啦，数据量大是我们跑结局的一个限制因素。但只要我们掌握多种MR的方法，并且加强代码和写作能力的练习，相信高分MR就在眼前啦！好啦，今天的分享就到这里啦！ 我的新挑战持续进行中~ 第2-3天了:工作重点都集中在选题和阅读范文上，不管做什么类型的研究、不管做那种类型的MR，我们都需要花大量的时间进行选题评价，所以我用了2天的时间来进行选题确定，就是为了避免出现做完了工作发现已经被别人写了？选题不合适？等情况 说到肠道菌群孟德尔随机化，其实它就是双样本MR的plus pro max版本！就是一个暴露对应一个结局，只不过我们现在的暴露换成了肠道菌群，那我我们进行模仿的时候主要的就是去替换结局，比如别人做的比如别人写了自身免疫性肝炎，我就在想能不能写自身免疫性脑炎呢？理解起来超简单的，代码也不难掌握。最大的挑战，就是数据处理啦！毕竟这么多细菌，那么他的GWAS数据肯定是非常庞大的，细菌的基因总数比我们人类自身的基因多150倍！面对这么大量的GWAS数据，我已经做好准备了！代码都备好了，我的目标期刊是Journal of Affective Disorders，所以我选了里面两篇相关的文章来参考，换个角度，换个结局，就是我的新选题啦！ 比如别人写了肝癌，我能不能试着写结直肠癌呢？当然这只是个例子啦！但确实在临床上确实有它的意义。然后把别人做过的疾病换个自己领域的疾病，就能写出一篇新文章，同时，我们也可以把肠道菌群看成中介变量，和中介MR联系起来，这样文章就更丰富了！ 当然啦，数据量大是我们跑结局的一个限制因素。但只要我们掌握多种MR的方法，并且加强代码和写作能力的练习，相信高分MR就在眼前啦！好啦，今天的分享就到这里啦！
挑战7天完成一篇肠道菌群MR，Day 1!哈喽医学生们！Ready to challenge？这次我们发起7天肠道菌群孟德尔随机化挑战！一起加油呀！ 第一天: 确定目标，初步检索！肠道菌群的MR研究非常火热，搜索“gut microbiota and Mendelian randomization”，发现高分杂志上的文章比比皆是，影响因子不差，不乏有很多一区高影响因子文章，发文数量也蹭蹭蹭，我也来发起挑战！所以我初步检索了肠道菌群，似乎在我的研究领域来说还是一篇蓝海，然后我挑选了一个比较友好的目标期刊，Journal of Affective Disorders，这个杂志是我们的老朋友啦，这可不是水刊哦，一区TOP而且进入杂志官网可以看到他的杂志目前中了61篇MR，妥妥的61篇MR，包括还有一些其他公开数据库的，说明杂志对MR文章还是比较友好的！可以冲锋所以，定下目标，我的目标期刊就是他啦！好啦，让我们一起探索肠道菌群MR，一起冲锋呀
今天分享一篇来自首都医科大学团队的双样本MR，暴露是IL-6极其受体（6个IL-6信号基因和34个sIL-6R受体基因），结局是肺动脉高压。炎症，尤其是白细胞介素-6（IL-6），已被认为是肺动脉高压发病的关键因素。因此，经典的IL-6信号传导可能是PAH颇具前景的治疗靶点。这是这篇文章能发高分的核心原因。我们完全可以进行模仿思路，换个炎症因子或者换个疾病。 课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油呀！ 文章题目：Mendelian randomization study on causal association of IL-6 signaling with pulmonary arterial hypertension DOI： 10.1080/10641963.2023.2183963 中文标题：基于孟德尔随机化探究IL-6信号与肺动脉高压的因果关系 发表杂志：Clin Exp Hypertens 影响因子：12.3 发表时间：2023年12月 论文亮点…
今天分享一篇来自Journal of the American Heart Association的文章。英国格拉斯哥大学健康与福利学院的Shinya Nakada教授团队纳入超过百万人群数据进行双样本MR，提高了对精神分裂症患者早期心脏评估和治疗的认识。 暴露精神分裂症：GWAS数据来自精神病基因组学联盟（PCG）； 结局动脉粥样硬化性卒中和栓塞性卒中：GWAS数据来自MEGASTROKE联盟。一个暴露与一类结局的双样本MR文章的套路操作。 课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油吧！ 文章题目： Schizophrenia and Types of Stroke: A Mendelian Randomization Study DOI： 10.1161/JAHA.123.032011 中文标题：精神分裂症和中风类型：孟德尔随机化研究…
今天分享一篇来自武汉大学人民医院的NHANES联合的文章，通过使用 NHANES 2017-2018 的数据，应用加权多变量调整逻辑回归来评估高血压与 NAFLD 风险之间的关系。随后，使用GWAS 汇总数据进行双样本 MR 研究，以确定高血压、收缩压、舒张压和 NAFLD 之间的因果关系。 这是常规两个数据库联合文章，NHANES数据只涉及一个周期，MR是使用IEU在线数据进行分析，代码实操简单，但是文章中不仅仅是只探究了高血压，分分成了收缩压、舒张压和NAFLD的关系，这是值得学习和借鉴的。 课题思路这不就来了么？万层高楼平底起，一起加油呀！ 文章题目：Hypertension and NAFLD risk: Insights from the NHANES 2017-2018 and Mendelian randomization…