汇报第7日挑战内容:1、AIGC自动添加文献引用(高效率引用添加方案)2、结构化语句添加(伦理、致谢、贡献、利益说明等:复制、粘贴)3、选刊(继续自动匹配杂志)4、根据目标期刊进一步润色 分享肠道菌群孟德尔随机化(GutMR)核心思路:一句话:就是很简单的两样本孟德尔随机化，只是暴露换成肠道菌群或者结局换成肠道菌群，作为暴露(p1值设定=1e-5，mibiogen下载即可)。结局数据可IEU，也可自行下载。论文攥写:精细阅读2-3篇肠道菌群孟德尔随机化范文，提取出写作框架，根据自己的研究填充框架，再精细修改一下，就完成啦！ 总之，掌握核心思路和拿到代码包后，就是非常简单的IF3~5到手，想要更高分的可以去模仿国外研究者写的论文的配图(非常好看，高分值得) ❤️注释:指导的师弟师妹们也完成投稿啦，投稿杂志IF均大于10分，3~4周成稿、润色、投稿~ 欢迎联系我。
汇报今日内容:完成文献引用添加(Endnote20)、结构性语句添加(伦理、致谢、贡献、利益说明)、选刊(根据方式2:AIGC自动匹配选刊,方式1以前介绍过)、根据目标期刊要求进一步润色 分享多变量孟德尔随机化(MVMR)核心思路: 在临床研究和MR研究中，我们习惯性的先研究一个因素（单变量）,然后将多个因素合并（多变量）一起分析，达到一个1+1=2或者1+1>2的效果。 多变量孟德尔随机化并不关注他们的整体效果，而关注他们在整体中各自的效果，谁为整体贡献的效应多，实际上更像一种竞争关系，起到校正作用。 多变量MR的核心依赖于一些基因变异与某些暴露的相关性比与其他暴露的相关性更强(我们的主要结论) 理解上面这段话，拿到代码就可以做多变量孟德尔随机化研究，5分到手。 ❤️注:这阵子用于修稿、审稿的时间花费太多，写这篇多变量孟德尔随机化的时间累计大概率不超过7天。 接下来，朋友们想看我挑战写什么呢，欢迎联系我。
前面一直不停写文章，投文章，除了接收的，现在一堆修回，大修小修齐全了。 前面两轮挑战的:“五天一篇孟德尔随机化”，“七天一篇药物靶向孟德尔随机化”也在投稿中，有消息会通知大家。 这轮的挑战:“7天完成一篇多变量孟德尔随机化”其实毫无难度，但是这些天每天讲课，解决师弟师妹们问题，论文修回也需要时间处理…暂时耽搁了，但我会把挑战做完的，哪怕多些时间。 ❤️注释:本笔记是神奇的Accept页面，大家都Accept！毕业顺利！！升博成功！！！ 联系王师兄
确确实实是我一直在写的领域，会接受审稿。我没给过reject，所以恭喜这位作者啦，起码会收到一个小修或者大修(取决于论文质量) 用行动助力每一个Accept!
今天的写作思路如图所示：先阅读相关文献（黑科技快速阅读) → 了解材料和方法所需数据分析的主要内容 → 精读文献的表格和图片 → 根据上述内容准备代码(如图五所示) 7天完成一篇多变量孟德尔随机化SCI难度不大，因为走的是固定思路，就是找到一个或一类明确的疾病，把阳性暴露筛选出来(我第一轮挑战做过的) 注意一点:多变量孟德尔随机化中的多变量分析等同于回顾性分析中的多因素分析，而只能对同一类的因素做多因素分析，大家多读几篇文献就明白，pubmed检索“Multivariable Mendelian Randomization”，读起来 同一类的，比如体重类(BMI、 手臂体脂率、臀围、腰围等)、生活方式类(久坐、规律运动、早起、抽烟、喝酒)、同类型疾病(比如各种精神疾病)… 这就是多因素孟德尔随机化的关键，也是中介孟德尔随机化的基础。 ❤️注释:最近很忙，希望大家也跟着我的思路学起来，写起来，可以放慢步子，但不能不做。 欢迎大家继续围观！！！ 咨询王师兄
前面顺利完成了两篇孟德尔随机化研究，一篇两样本,一篇药物靶向。都是从选题、改代码、作图、写论文到制作附件和表格。一篇投稿到了二区杂志，一篇今晚投稿，顺利完成了两轮挑战。 本来准备挑战中介孟德尔随机化挑战，但是中介的基础就是多变量孟德尔随机化，挑战应该从易到难，循序渐进，也为了挑战写中介孟德尔随机化研究时能写出更好的文章。 今天开始新的挑战！ 第1天：收集信息，检索关键词：“Multivariable Mendelian Randomization”，发现发表的基本都是二区杂志（IF:5-10分），有International Journal of Cancer（中科院1区，IF：6.4），Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine（中科院2区，IF：5.4)，最新的一篇：Journal of Affective Disorders（中科院2区,IF:6.6）总的文章数1015篇，在孟德尔随机化总体的7600+文献中来讲，占比不高，最重要的是几乎所有单因素/双样本都可以转换成多变量来写，算是一个小蓝海。 除了检索信息，我还下载了近十篇左右的最新文献（pubmed检索时设置sort by：publication date）,先精读，今天挑战算是正式开始啦！ ❤注释：挑战时间为非工作时间，所有步骤都是现想（大家可以模仿我的科研思路，按照我提供的思路来完成SCI创作），非已有课题，主打从0开始！ 欢迎大家围观！！！ 咨询王师兄
先汇报第7天内容:完成机制图(figure1)、引用添加(Endnote20)、结构性语句添加(如伦理、致谢、贡献、利益说明)、论文润色 做一个小分享(认识完整的孟德尔随机化的分析方法) 一篇完整的文章需要有以下统计分析描述结果：➢ 使用TwoSampleMR包进行统计分析➢ 寻找GWAS summary数据库提取SNP以及对应的统计数值作为工具变量➢ 过滤工具变量：Steiger过滤等➢ 剔除混杂因素:phenoscanner➢ 主要使用IVW方法➢ 加权中位数和MR-Egger回归作为敏感性分析➢ 使用Cochran Q评估异质性➢ 使用MR-Egger回归的截距评估多效性和使用MRPRESSO 以上步骤就是孟德尔随机化的基础，大家可以去对照一下我昨天分享的药靶孟德尔随机化的研究思路。 ❤️注:接下来会进行更多的孟德尔相关研究挑战，会适当延长挑战时间（超级忙！！！） 咨询我
其实很多工作在前面几天就已经做了，我有个习惯(分享给大家)，读文献时看到不错的句子或者观点，会粘贴进我的微信对话框，开始写discussion前就回去看一看，有时候改个语序就用啦。至于为啥这么快能写完，因为方法和结果部分一旦跑出结果，我会直接交给我的AI(chatgpt4.0)去完成，只是方法和结果部分哦，具体当然还有很多细节要注意！不要随意模仿！ 整理下药靶孟德尔随机化写作思路:(有两个，我讲我这个的思路)选定疾病(gwasieu是否有相应的Gwasid→有就可以作为备选(建议做肿瘤相关，好写好投)→提取蛋白组全部的Snp→将提取出来的工具变量(蛋白)逐一与结局变量进行MR→提炼出阳性的效应蛋白→到相关网站检索(昨天更新的图五)对应的基因和药物→后续可以补SMR和共定位→论文攥写(非常非常非常复杂，一个循环报错，可能两天就白干啦，建议新手从两样本做起，我教学也是这样循序渐进) ❤️注:明天添加refrence、制作机制图，这篇文章就成稿啦！大家下个星期想看我挑战写啥，欢迎评论区留言！！！ 咨询王师兄
做分析的三天真的是一个头五个大，自从昨天跑了一整天，跑出个error之后，意识到设备不行的问题很大，就果断找了一个有两台3070的地方(酒店)跑代码 这个挑战的成本陡增…不过电脑多也有好处，可以多线程工作，帮学员选题，一时间可以跑多个，然后还可以做做课程海报…电脑没歇过…人就更不能歇了。 药靶孟德尔的挑战基本算是结束啦，跑出效应基因，文章还是八股文，很容易就写出来了，花不了啥时间，归根结底，还是双样本的基础，只是要跑的数据非常非常非常多，然后去网址(见图5)检索效应基因的位置和作用就行了。 要投高分的话，还得补个SMR和共定位，有代码很简单的事情，只是跑出来有需要一些时间…..我现在自己发文章的需求不大，把这篇SCI写完就算挑战成功了，如果后续审稿人有要求，我再补这些…最难的是蛋白筛选…是真的费时间…刷小红薯发现大家魔怔了，都在学孟德尔，到处求资源，但说句实话，大家都在学的时候，你在学就有点迟了，很有可能给了钱，学了一堆课，但还是写不出来文章，这个学习的💰给得就没有意义… 思考一下:你到底想要什么？ 前天我问过，大部分都是求毕业，如果是毕业的话，一定要学孟德尔吗？除了双样本以外，其他的孟德尔随机化都不算简单。 求毕业有文章就够啦，黑猫白猫能抓耗子就是好猫，其实你们需要的是学习SCI写作，说白一点，就是水SCI论文，但是水论文的方式有很多很多种。 还有很多比孟德尔随机化还简单，不要蒙着眼睛走路，有时赞睁开眼睛看看….. 最近很多人来找我学习，我准备给的课表是30天创作一篇SCI(从文献阅读、选题、数据分析、论文框架、论文写作),然后再是方法学:孟德尔随机化(双样本、药靶、中介、多变量、肠道菌群…)、meta分析(RCT)、AIGC、NHANES数据库等等… 其实对于一个想顺利毕业,快速发出文章的人来说,最重要的是学习如何系统化的快速攥写一篇SCI论文，其次才是各种方法学。 今日完成:蛋白提取(4500+个工具蛋白,50000+SNP，完成药靶孟德尔随机化分析，生成森林图) ❤️注:可保存图五，为Gwas提取的网址，整理不易，祝大家早发SCI！ 咨询王师兄