最近因为科室安排需要前往西藏路途中由于过于无聊回望走过的这些年“临床”和“科研”到底哪个重要?我想不出答案只知道:发文章不能停所以我在拉萨写下这次的挑战继上次挑战了meta分析和GBD,收获了非常高的关注度,本次挑战7天完成一篇NHANES数据库SCI! Day 1任务:明确目标期刊+初步检索NHANES数据库中包括了非常多的横断面调查数据包括了人口统计学、饮食数据、体格检查、实验室数据。。。这种基于公开数据库的挖掘的难点在于选题的时效性一定是有了想法就要马上去做只要确定可行性,具体的数据提取和数据分析都是体力活 选题:需要确定目标期刊、深入阅读目标期刊的文献比如Cardiovascular Diabetology杂志就非常喜欢 TyG(Triglyceride-glucose index)这个指标这也是我这次想要挑战的指标我换一个研究人群、换一个关联指标就是一篇新的文章我首先用“NHANES and Triglyceride-glucose index”进行了检索发现目前文章非常多,有132篇,且基本都是为高分文献因为我是心内科,所以就把132篇文章的X和Y分别提取出来发现我关注的Y还没有人写过所以就定下目标期刊为Cardiovascular Diabetology深入了解这个杂志,可不是水刊,最新的影响因子是1区8.5分所以最后就挑战TyG和一个心血管指标Y的相关性下载了几篇类似的文献深入学习目标期刊的风格(DOI: 10.1186/s12933-023-02115-9) 最后欢迎大家围观一起挑战一起写文章!我们明天见
进度汇报:寻找靶基因+跑代码+出图片药物靶向的代码非常的简单也非常的好理解,但是要注意的是要搞清楚整个过程中的思路第1步:明确蛋白与疾病表型存在明显的因果关系或者已知该蛋白能够有效作用于该疾病的治疗。第2步:寻找调节该蛋白表达的一类基因来模拟药物作用第3步:寻找到这个靶基因后获取其工具变量与疾病进行单变量MR分析。 这就是我们的药靶的文章设计思路很重要的一部就是寻找靶基因一般我们通过eQTL的网站无寻找eqtlgen因为基因表达的过程会受到很多的调控所以不仅要关注该基因,还要关注该基因的上下游1兆的基因信息 我的eGTL的数据来源于Genomic atlas of the proteome from brain, CSF and plasma prioritizes proteins implicated in neurological disorders,里面包括了来自人体血浆、CSF等的eQTL数据我对这些下载来的数据进行了预处理实际上本质就是本地数据的数据处理然后再用这些数据进行药靶MR的分析 然后再做一个共定位分析其实就是看暴露X与结局Y的GWAS summary中该区域的所有SNP的位置是不是基本一致的今日图表弄完啦,就要开始写作啦!
由光速发起的《光速科研SCI写作投稿训练营-30天成稿第一篇|光速攥写任意类型Sci系统方法论|GBD数据库挖掘|孟德尔随机化|Nhanes|Meta分析|case report|Letter速成班》第十期还有7天就要开课啦,前9期好评如潮,平均成稿2-3篇~ 适用对象:所有年级(本科、硕士、博士)、所有阶段(医生、护士、基础、预防、公卫医学科研人员)的医学相关人员
第5天,圆满收官!🎉Day 5主要任务:完成写作,拟投稿 我们今天主要完成了introduction、discussion、利益冲突、作者贡献等模板化内容写作,还进行了语言的润色。挑战了这么多次,其实Discussion的部分是最难写的,不过框架写作法的理念让我们可以快速成文,嘿嘿我们还有工具能够快速找到参考文献、高效润色,满满的成就感! 1篇SCI,轻松拿下! 我可以,师弟师妹们,你也可以! 简单回顾一下整篇文章的成文流程:初步检索→确定选题→文献筛选→数据分析与图表制作→框架写作法写作以上步骤基本就是一篇Meta分析的基础流程啦! 有idea的师弟师妹们可以对照着我这几天分享的Meta研究思路,完成一篇自己的meta分析论文哦!只要有好的idea、按照PRISMA checklist一步一步来一定能够顺利完成一篇高质量的Meta分析论文! PROSPERO 的注册一般需要2周左右,等拿到编号就去投稿,顺便还能再修改修改。 学无止境,多多获取信息、并且将其与本行业的研究联系起来,说不定就是一篇顶刊呢 希望大家一起不断学习、不断进步,一起加油!然后好运连连等接收!
Day 4主要任务:根据目标文献提取数据+跑图+材料和方法写作 昨天已经确定了目标文献,从目标文献中提取相关数据。我们做了一个清单,根据结局变量类型的不同提取不同的数据。这里整理好了,后面跑图就是易如反掌,整理好数据后代放入R中分分钟出结果,而且发现异质性、亚组分析结果都很NICE。没有白干,非常有收获,可见我关注的那个环境污染指标确实会对增加AMI、Stroke的再入院率、死亡风险。 经典图片绘制完成了过后,基本没有问题,所以就准备开始写作啦。重在模仿,我把day1中获得的经典文献进行了精读,作为优秀范文进行模仿和学习。Methods的部分是最简单的,依葫芦画瓢,使用框架写作法深度模仿写作,只要我们目标清晰、任务拆分、脚踏实地,一定能顺利写出1篇SCI 的meta分析!只要第一篇成功了,第二篇、第N篇就都不在话下啦! 近期有越来越多的小伙伴想要加入我们的Meta分析学习,大家有意愿的也可以跟着我的更新一起打卡挑战,相信下一篇顺利接收的就是你🫵🏻
Day 3主要任务:完成检索、下载文献、筛选目标文献 Meta分析不复杂,但是检索策略是重中之重,只有检索得全,才不会漏掉重要得相关文献。科室最近事情也很多,多希望能挤出更多时间不断自我成长、学习不能停、挑战不能停、成长不能停。 明确了选题后,根据PICOS原则进行文章拆分:P:研究对象,有我关注得暴露,AMI人群、stroke人群;I:干预措施,对研究人群采用的治疗干预措施或观察指标;C:对照措施,对照比较O:结局指标,如死亡率、再入院率等;S:研究类型,横断面?前瞻性?根据PICOS原则进一步进行问题拆分,明确临床问题然后在常见的三个数据库Pubmed、Cochrane、Embase制定检索策略。 然后根据每个数据库的检索策略下载文献:泛读、精读文献筛选出纳入研究得目标文献,这一步实际上是非常重要得,明确研究主题决定了能不能做,需要多次评估选题的可行性和可操作性,文献检索决定了做得怎么样,因为检索策略是meta分析的核心。继续肝,欢迎大家继续围观,留下你的想法,我们下篇挑战再见👋🏻
Day 2主要任务:明确选题关注我们的朋友都知道,我们给到大家的理念是idea比实操更加重要。因为meta分析的实操和行文都是流程化、模板化的,我们只需要根据PRISMA要求一步一步操作就好啦。整体来说,只要明确了选题,后续就很简单,按照标准流程一步一个脚印,挑战就能成功。 第一步:抢占先机先去PROSPERO上面进行注册,获得注册编号(QS:高分杂志投稿时基本都要提供这个编号,但也不是必须的,肯定有比没有好)主要是完成里面自己研究的一些问题和研究设计,大约在完成后2周左右会收到审核通过的邮件,注册好了就可以放一边安心等待编号,只要一通过审核就可以进行投稿。 第二步:阅读PRISMA行业规范现在包括MR、Meta都需提供相应的checklist,根据条目清单进行写作会更加的规范,中稿的概率也会更高。 我初步检索了发现我关注的空气污染目前有14篇SCI如果再加上我关注的AMI或者stroke,文章就更少了最高分是10分,最低分2分。所以就确定选题啦,非常有希望!! 师弟师妹们可以多花些时间思考高分meta的选题究竟是怎么来的。可以留下你的想法,我们下一篇挑战再见👋🏻