揭秘吸烟与尿道狭窄复发：一项系统评审与元分析的深度解读 今天给大家分享一篇在 2023 年 1月发表在《Int Braz J Urol》（q1，IF= 3.1）的文章,通过系统评审与元分析探究了吸烟与尿道成形术后狭窄复发的关联性。 研究的背景：尿道狭窄是男性常见的泌尿系统疾病，而尿道成形术（urethroplasty）是治疗尿道狭窄的主要方法之一。然而，术后狭窄复发是一个令人担忧的问题，其复发率大约在 6%-28% 不等。除了一些已知的如BMI、狭窄长度、既往尿道成形术史等因素外，吸烟作为可能的风险因素，其对术后狭窄复发的影响尚未得到一致的描述。 研究的目的：本研究的目的是明确吸烟与尿道成形术后狭窄复发之间的关联性。 研究方法： 检索方法： 检索了 Pubmed、Web of Science、Embase 和 Cochrane 数据库，使用关键词包括“urethroplasty”、“smoking”等，截止日期为 2022 年 7…
第5天，圆满收官！ 先来汇报一下今天的成果吧！我今天完成了Introduction部分的写作，添加了规范的引用（用的是Endnote20哦）， 还搞定了模块化部分的写作（包括伦理、致谢、利益冲突声明、作者贡献等）， 最后对整个文章进行了润色。 看着自己的劳动成果，满满的成就感涌上心头！ 回顾一下这次挑战，其实一篇经典的孟德尔分析操作流程可以概括为以下几个步骤： 1 确定选题：这一步非常关键，需要初步检索相关文献，明确相关领域疾病，注意点是必须创新，尚未有人写过，筛选好目标疾病，选好精读的高分近期文章。 2 数据整理与分析：根据我们整理好的资料，跟着讲解视频一步步完成，提供的资料全面，讲解清晰，下载自己的目标疾病，根据提供的小工具进行整理为相应的格式，使用我们的提供的代码进行分析，设备不同网速不同，相应的跑完结果的时间也不同，所以不需要担心，让电脑一步步跑即可。 3阳性蛋白筛选与后续分析：根据要求筛选阳性蛋白，可以把条件严格一些。然后，根据分析结果整理图片，直观地展示研究结果。进一步进行PPI预测、通路富集分析及共定位分析（这步耗时较长） 4文章撰写：最后，就是根据STROBE-MR声明写作指导和范文来完成孟德尔分析的文章撰写了。这一步需要按照一定的结构和格式来组织内容，确保报告的完整性和可读性。 以上步骤就是一篇蛋白组学分析的基础流程啦！大家可以对照着我这几天分享的研究思路去完成自己的论文哦！相信只要按照这个流程来操作，一定能够顺利完成一篇高质量的孟德尔分析论文！ 最后，这次挑战虽然结束了，但科研之路还很长。希望大家都能够保持对知识的热情和好奇心，不断探索和学习新的方法和技能。加油哦
今天给大家分享一篇在 2024年8月发表在《Lipids Health Dis》（2区，IF=3.9）的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查（NHANES）2007–2016年的数据，探讨美国成年人尿酸与高密度脂蛋白胆固醇比率（UHR）与循环 α-klotho 水平之间的关系。 暴露：本研究的暴露变量是尿酸与高密度脂蛋白胆固醇比值（UHR）。UHR是通过将血清尿酸（mg/dL）除以高密度脂蛋白胆固醇（mg/dL）并乘以100得出的一个比例。 结局：研究的主要结局是循环中的α-klotho蛋白水平。α-klotho是一种抗衰老相关的蛋白质，其主要在肾脏中表达，可以通过ELISA方法测量其在血清中的浓度。
今天给大家分享一篇在 2022年12月发表在《Front Endocrinol》（2区，IF=3.9）的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查（NHANES）1999–2014年的数据，探讨总胆固醇/高密度脂蛋白胆固醇 (TC/HDL-C) 比率对普通人群全因死亡率和心血管死亡率的影响。 暴露：本研究的暴露变量是总胆固醇与高密度脂蛋白胆固醇的比值（TC/HDL-C ratio）。这个比率被用来评估血液中的脂质水平对心血管健康的潜在影响。 结局：研究的主要结局是全因死亡率和心血管死亡率。这两种结果都是用来评估心血管健康状态和总体死亡风险的重要指标。
今日任务清单： 1数据出结果：循环代码的好处就是拿个开着电脑让它放着跑就好，其他不需要管，去忙自己的事情，我睡前开着电脑，睡醒代码已过半，今天继续放着跑，跑完有个汇总表格已经整理好了。 2 筛选数据：准备好了数据，接下来就是进一步筛选符合要求的数据，本质上就是进阶版的双样本孟德尔，因此筛选标准大差不差，结果分析都呈现出非常棒的效果，每个蛋白的留一法图、森林图、散点图、漏斗图都已经跑出来了，现在对于数据的要求越来越高，我设定矫正P值需要小于0.05，简直是美滋滋啊！ 3 筛选阳性蛋白进行PPI预测：把筛选的阳性蛋白进行PPI预测，放入网站几分钟出图。 4 功能富集分析：对结果进行通路富集分析，看看有没有合适的通路。假如有实验条件的师弟师妹后面可以把这些作为自己的前期结果，进行湿实验验证一下，干湿结合，高分到手。 5 我还进行了根据自己的阳性蛋白进一步筛选进行了共定位分析，但是结果一般般，就不进行进一步展示了。 6 高分范文模仿：拿出Day 3精读的2篇高分孟德尔分析文献，开始模仿写作。 明天就是最后的冲刺了，我们要一口气完成Introduction的写作，还要进行Abstract、文献引用、模板化写作等一系列收尾工作。然后就可以按照目标期刊的要求，投出我的稿件了。 近期有越来越多的小伙伴想要加入我们的学习大军啦！很高兴一次次的挑战分享能帮到大家，欢迎来一起梳理流程、互相加油！
每个月都有师妹师弟转介绍科室的老师或者同学加入学习，这是最快乐的事情，继续认真服务，认真带科研，和咱们的师妹师弟形成良好的长期关系(持续提供价值)~选题、跑代码（分析）、写作、润色、投稿选刊、返修，全流程，手把手教学~光速科研~每个步骤都会手把手帮助师妹师弟，直到论文接收~
每天留给自己静下心来去阅读文献，跑数据，整理数据，分析数据的时间屈指可数，一份整理好的文件，一个好用的代码是多么弥足珍贵，简直是我科研上的领路人～ 今天的任务还是很重的， 今日任务=获得蛋白组学分析所需要数据=下载数据+整理数据+跑代码。 Step1 使用文件编辑器处理我们的结局数据，将其整理成标准格式表头，需要一模一样（提供了好用的小工具） Step2 运行内置代码→运行循环代码→设置工作路径→修改代码中的结局为我们的研究的结局（听起来是不是有种“傻瓜”操作既视感，跟着课前资料视频讲解一步步来，毫无难度～） 注释：在零基础写孟德尔分析文章之前，建议大家读10篇近期高分孟德尔分析文章，搞清楚整个操作流程，在通过STROBE-MR声明，一定要多次评估是否有人写过，特别是否在同一类型的文章的其中一个很小部分里面被写了。不然等于白干！ 倒计时2天！！！！欢迎大家继续围观
文章的初步检索让我倍感信心，我目前选择的疾病暂时没有人做过相关蛋白组学孟德尔分析（偷笑，嘻嘻），抓紧时间，准备开工！ 工欲善其事、必先利其器，找了2篇顶刊文献进行观摩、学习，思路清晰，操作简单。 文章不规范，拒稿两行泪，STROBE-MR声明是行业规范，必须要读！ STROBE-MR声明包括：“题目和摘要部分（条目1）”、“引言部分（条目2-3）”、“方法部分（条目4-9）”、“结果部分（条目10-13）”、“讨论部分（条目14-17）”和“其它信息（条目18-20）”六大部分。实际上就是指导规范的写文章。 注释：大家一起学起来、动起来，师弟师妹们可以多花些时间思考高分meta，明天我们进行跑代码咯！
今天给大家分享一篇在 2024 年 8 月发表在《The Lancet》的文章（Q1，IF=98，4），通过系统评审和网络元分析探讨了抗流感药物在暴露后预防流感方面的有效性和安全性。 研究的背景：流感是一种急性呼吸道病毒疾病，每年都会因季节性流行和偶尔的不可预测的大流行造成全球范围内的疾病和死亡。尽管疫苗接种是预防流感的主要手段，但疫苗的有效性可能因病毒株、人群和年份而异，且在某些情况下可能不可用或效果不佳。因此，了解抗流感药物在暴露后的预防作用尤为重要。 研究的目的：本研究旨在评估不同类别的抗病毒药物用于流感暴露后预防的疗效和安全性，以支持世界卫生组织（WHO）流感指南的更新。 研究方法： 检索方法：研究者系统检索了包括MEDLINE、Embase、Cochrane Central Register of Controlled Trials等在内的多个数据库，以寻找截至 2023 年 9 月 20 日发表的随机对照试验，这些试验评估了抗病毒药物与另一种抗病毒药物、安慰剂或标准护理相比预防流感的疗效和安全性。 统计方法：研究者使用了网络元分析方法，采用频率学派的随机效应模型来估计所有干预措施的相对效果，并使用GRADE（推荐评估、发展和评价分级）方法评估证据的确定性。 @薯条小助手 @小红书创作助手
之前做了很多孟德尔随机化相关的挑战，很多关注我们，跟着学习的师弟师妹都取得了不小的成绩，发表了属于自己的SCI。 随着孟德尔随机化投稿难度加大，简单的双样本目前除非有强创新性，否则很容易被拒稿，因此我们开始一些进阶版孟德尔挑战！还没有文章的同学可以仔细看一下，有能力跟一跟，希望对你有所帮助。 第1天：收集信息。 检索关键词：“(circulating proteome) AND (mendelian randomization)”,发文量、发表的杂志影响因子和分区都还不错, Journal of the American Society of Nephrology（Q1,10.3）,Communications Biology(Q1,5.2)，Ebiomedicine(Q1,9.7)仔细留意一下，把sort by调整成：publication date，说明循环血浆蛋白发文蓝海，有条件的师弟师妹还能作为实验或者申报课题的前期准备，都冲起来！ 由于临床研究生时间紧迫，我是完全挤出时间阅读了大量文献，但是没有时间去学习和实践新的蓝海发文模块。 除了检索信息，我还下载了10+近期Meta的范文，先精读，今天挑战就算开始啦！ 注释：挑战时间为非工作、考试/原定学习计划时间，所有步骤都是现想（大家可以模仿我的思路），非已有课题主打从0开始！ 第一天的挑战就结束了，欢迎大家留下自己的想法和经验哦，期待明天的进度！