Day 2-3：充分评估选题可行性+代码等方法学评估今日的主要任务是在前面的基础上深入的评估可行性我们之前就一致强调选题的重要性一定要花大量时间去评估，不要是在做无用功主要是根据目标文献中的核心图片和Figure评估如果换了一个数据集过后能不能实现看起来是换了一个数据集，但是叶不要想的过于简单这一步需要十分的谨慎，一定要多看、多检索和我们做MIMIC、PIC、NHANES一样基本是选好了就能做、选不好就凉凉不要做浪费时间的事情方法学的内容是最简单的、也是最容易学会的那从哪里去学习核心的方法学其中对于目标文献的精读就显得尤其重要通过阅读目标文献我们发现主要的分析包括以下方面–描述–Joinpoint–地图–BAPC预测搞清楚了方法学也就知道自己应该重点关注什么也就能够跑出文章中的重要图片和表格也就是核心Rｅｓｕｌｔｓ后面再利用框架写作法进行写作就显得十分的容易和得心应手挑战继续！
今天给大家分享一篇在 2023年9月发表在《Rev Cardiovasc Med》（3区，IF=1.9）的文章。本文这项研究利用了美国国家健康和营养调查（NHANES）1999–2004年的数据，探讨了血清肌酐/胱抑素C比值（Cr/CysC比值）与心血管疾病（CVD）发病率和死亡率之间的关联。暴露：本研究的暴露变量是血清肌酐/胱抑素C比值（Cr/CysC比值），该比值是通过血清肌酐和胱抑素C的测量值计算得出的，作为肌肉质量的替代指标。结局：研究的主要结局是心血管疾病发病率和死亡率。发病率是通过参与者自报的CVD诊断信息来确定的，涵盖了心力衰竭（HF）、冠心病（CHD）、心绞痛、心肌梗死（MI）和中风等疾病。死亡率是通过与国家死亡指数（National Death Index, NDI）匹配数据确定的，涵盖了因心脏病和脑血管疾病导致的死亡。
Day1：寻找目标文献和目标期刊GBD数据库大有可为大家也都比较熟悉了四大刊及其子刊的常客虽然现在有“颓废”之势前期我们挑战成功了数期最近也更新了GBD数据库的第二部分–GBD数据库中的数据分析主要包括的分析内容包括：APC、分解分析、前沿分析ARIMA预测未来、BAPC预测未来、EAPC当然还有其他复杂的分析方法但是这些对于我们发文章已经足够了在我们看文献的过程中发现某个疾病适当的人+适当的描述+上述分析的一种或者几种就是一篇文章那我就再尝试挑战一期 有的师弟师妹很纠结说现在类似于GBD这种公开数据库不好发文章了其实公开数据库的挖掘无止境就好像说以前的SEER数据库一样都过去多少年了，依旧可以发文章MIMIC数据库一更新就涌现了很多文章GBD一样的道理只有不断的思考才会有idea，只有不断的思考才有突破这次挑战的是预测，主要就是使用ARIMA和BAPC进行未来预测这两种预测BAPC又使用更多一些主要的代码前期已经准备好了操作比较简单 第一天的主要任务是确定目标文献和确定目标期刊这就需要敏锐的科研的洞察力这就需要长时间的深度思考我去初略的检索了GBD and Bayesian age-period-cohort发现了很多和我的研究类似的文章最后终于确定给了方向同样的最终选择了一个相对来小众的疾病这样就不容易撞车“XXXX发病率的全球时间趋势和预测：2021 年年龄-时期-队列分析”经过检索和比较，最终将Q1 的Journal of global health杂志作为我的目标期刊选择的文献是 DOI: 10.7189/jogh.14.04105一篇关于HIV和其他性传播疾病的预测文章我们将使用更新后的2021年数据进行分析争取能挑战成功全力以赴，冲锋冲锋！我们下一篇进度汇报见！
今天给大家分享一篇在 2024年8月发表在《JAMA Netw Open》（1区，IF=10.5）的文章。研究背景：AEG患者的脊柱通常较差，目前尚祭术前CRT与重症术前或围手术期化疗相比，哪种治疗方式对整体生存率（OS）及结局更有利。研究目的：本文旨在通过网络荟萃分析，评估这两种术前治疗方法与手术单独治疗相比的治疗效果。研究方法：检索方法：研究团队在多个数据库中进行了文献检索，包括PubMed、Cochrane Library、护理和相关健康文献累积索引（CINAHL）、ClinicalTrials.gov，以及国际临床试验注册平台（ICTRP），检索时间从数据库创立至2023年4月21日。检索策略预先定义，涵盖了所有比较术前化放疗（CRT）联合手术、单纯术前或围手术期化疗联合手术与单独手术的随机对照试验（RCT）。两名研究人员独立筛选文献，首先通过标题和摘要筛选，然后对符合条件的全文进行进一步评估，并由第三方研究者解决筛选过程中产生的任何分歧。最终，共有17项试验符合纳入标准。统计方法：研究采用了两阶段贝叶斯网络荟萃分析方法。第一阶段中，研究者使用Cox比例风险回归模型估算每项试验的相对治疗效果（如生存率的对数危险比），并对性别和年龄进行了调整。在估算二分类结局（如术后并发症率和死亡率）时，采用逻辑回归模型估算对数比值比。第二阶段中，采用贝叶斯随机效应模型将各项研究的效果估计进行汇总，并计算合并后的危险比和比值比及其95%可信区间。此外，研究还进行了网络一致性检查、异质性评估以及治疗方案的排名，通过累积排名曲线下的面积（SUCRA）值来比较各治疗方案的效果。
今天给大家分享一篇2023年5月发表在《Computers in Biology and Medicine》（Q1区，IF= 7）的文章，通过机器学习分析和蛋白互作网络的方法探讨了阿片类药物使用障碍（OUD）的治疗策略。研究的背景：OUD是一个全球性的重大公共卫生挑战和社会问题，随着阿片类药物依赖的人数急剧上升，滥用的可能性也随之增加。尽管已有一些药物被批准用于治疗OUD，但这些药物的疗效需要进一步提高，以提供更安全、更有效的药物和心理社会治疗。研究的目的：利用基于蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络的机器学习方法，系统地评估和重新定位超过120,000种药物候选物，以发现具有理想药效和ADMET（吸收、分布、代谢、排泄和毒性）特性的抑制化合物，为OUD的药物治疗开发提供有价值的工具。研究方法：1.从String v11数据库中获取了与五大阿片类药物受体（MOR、DOR、KOR、NOR和ZOR）相关的PPI网络。2.从ChEMBL数据库收集了与这些蛋白靶标相关的抑制剂数据集，并构建了机器学习模型。3.使用基于自然语言处理的transformer和autoencoder学习模型生成的潜在向量（LV）指纹表示抑制剂化合物。4.将这些潜在向量与梯度提升决策树（GBDT）算法结合，构建了结合亲和力（BA）预测器。
今天给大家分享一篇在 2023 年5月发表在《Journal of Orthopaedic & Sports Physical Therapy》（1区，IF=6.0 ）的文章。研究的背景：慢性腰痛是一个全球性的健康问题，影响着人们的生活质量。传统的生物医学方法治疗慢性腰痛效果有限，因此近年来越来越多地采用生物-心理-社会模式来管理疼痛。认知功能治疗（CFT）作为一种新兴的治疗方法，正在全球范围内逐渐被采纳。CFT 综合了疼痛教育、运动和生活方式指导等多种治疗方式，旨在提供一种全面的临床推理框架，帮助医疗专业人士为患者量身定制管理慢性腰痛的策略。研究的目的：评估认知功能治疗（CFT）对成年慢性腰痛患者的疼痛强度和残疾程度的减少是否有效，并调查其对心理状态、患者满意度和整体改善的影响及安全性。研究方法：检索方法：文献检索涵盖了 CENTRAL、CINAHL、MEDLINE、Embase、clinicaltrials.gov 和 EU 临床试验注册数据库，时间截至 2022 年 3 月。纳入标准为评估成人慢性腰痛的 CFT 的随机对照试验。统计方法：1.使用 Cochrane Risk of Bias…
医学科研挑战5天完成一篇 Nhanes 数据库挖掘，第五天进度汇报，今天是挑战第五天啦！恭喜我这次的挑战成功收官啦！希望对你的写作有所帮助，我们下一次挑战再见！
今天给大家分享一篇在 2023年8月发表在《Lancet Rheumatol》（1区，IF=15.0）的文章。本文这项研究利用了全球疾病、伤害和风险因素负担研究 (GBD) 1990-2020年的数据，估计了不同地理区域、年龄、性别和时间段内手、髋、膝及其他部位骨关节炎的负担，并对其患病率进行了预测，直至2050年。研究方法：在这项全球疾病负担研究的系统分析中，我们利用来自 26 个国家膝关节骨关节炎、23 个国家髋关节骨关节炎、42 个国家手部骨关节炎的人口调查数据，以及美国所有骨关节炎部位（包括其他类型的骨关节炎类别）的保险索赔数据，估算了 1990 年至 2020 年 204 个国家和地区的骨关节炎患病率。参考病例定义是有症状的、经放射学确诊的骨关节炎。使用参考病例定义中的其他定义（例如自我报告的骨关节炎）的研究使用回归模型进行调整。骨关节炎严重程度分布是使用西安大略大学和麦克马斯特大学关节炎指数通过汇总荟萃分析获得的。将最终患病率估计值乘以残疾权重，以计算残疾生活年限 (YLD)。使用混合效应模型预测到 2050 年的患病率。