先汇报第6～7天内容:完成论文剩余部分的攥写（introduction、discussion、abstract)、引用添加(Endnote20)、结构性语句添加(如伦理、致谢、贡献利益说明)、论文润色 今日分享更高维度的多中介孟德尔随机化的分析方法：1️⃣ 使用MVMR：在同一个模型中控制多个中介，精确地评估暴露的直接效应。 2️⃣ 无偏估计：确保所有暴露和中介因素的非重叠SNPs都被包括作为工具变量，让直接效应的估计无偏无误。 3️⃣ MVMR vs Two-step MR：在中介互不影响的理想状态下，MVMR和Two-step MR的间接效应估计是一致的。 4️⃣ 复杂关系下的Two-step MR：当一个中介影响另一个时，Two-step MR能同时捕捉到中介解释的关联量和相关中介-结果的量。 💗注:接下来会进行更多的论文创作相关研究挑战，会适当延长挑战时间(超级忙!!!)，同时咱们的光速科研SCI光速创作训练营也快开班啦！！！欢迎师弟师妹们跟我们一起学习！！！
肠道菌群孟德尔随机化挑战圆满结束！我很高兴地宣布，我的7天肠道菌群孟德尔随机化挑战已经顺利收官。在挑战的最后一天，我完成了以下关键任务： 1. 使用AIGC自动添加文献引用，这是一个高效的引用添加方案。2. 添加结构化语句，包括伦理声明、致谢、作者贡献和利益冲突说明。3. 自动匹配选刊，为论文找到合适的发表杂志。4. 根据目标期刊的要求进一步对论文进行润色。分享一下肠道菌群孟德尔随机化（GutMR）的核心思路：简单来说，它实际上就是一个两样本孟德尔随机化的变体，不同之处在于暴露是肠道菌群，或者以肠道菌群作为研究结局。暴露数据可以从mibiogen下载（设定p1值=1e-5），结局数据可以从IEU获取，也可以自行下载。论文撰写部分，只需精读2-3篇肠道菌群孟德尔随机化的范文，提取写作框架，根据个人研究填充内容，再进行细致修改，就能完成。 总结来说，一旦掌握了核心思路和相关代码，就可以比较轻松地获取IF3~5的成果。如果想要更高的影响因子，可以尝试模仿国外研究者的论文配图，它们通常非常精美，有助于提升论文的分数。❤注：我指导的师弟师妹们也已经完成了投稿，目标杂志的影响因子均超过10分。从撰稿到润色再到投稿，整个过程只用了3到4周的时间。
这两天顺利完成了初步选题的图片制作(2个)和表格制作(3个),最后两天的任务就是完成论文创作了，在跑出图片和表格的同时，我已经通过光速攥写SCI的方案完成了Method、result部分的写作，剩下的introduction、discussion、abstract两天完成绰绰有余～ 中介孟德尔随机化非常简单，看完这篇笔记，你就掌握啦(IF+5)在中介分析中，我们使用单变量MR（孟德尔随机化）来评估一个因素（暴露）对另一个因素（结果）的总影响。为了理解这个影响是如何通过一个或多个中间因素（中介变量）传递的，我们可以使用两种不同的方法：多变量MR（MVMR）和two-step MR。MVMR步骤： 1. 估计直接：首先，我们使用MVMR来估计在控制中介变量的情况下，暴露对结果的直接影响。我们将主要暴露和中介变量的遗传变异都看作是工具变量。2. 进行两阶段回归：在第一阶段，我们分别用暴露和中介的遗传工具预测每个暴露。在第二阶段，我们将结果回归到每个暴露的预测值上。3. 估计间接效应：最后，我们从总效应中减去直接效应，以估计间接效应。 Two-step MR步骤：1. 估计两个MR值：首先，我们计算两个MR估计值——一是暴露对中介的影响，二是中介对结果的影响。2. 计算间接效应：然后，我们将这两个估计值相乘，以估计间接效应。 多中介变量分析：1. 使用MVMR：我们在控制所有中介变量的情况下，使用MVMR评估归因于多个中介的直接效应。2. 估计综合间接效应：然后从总效应中减去这一直接效应，以估计综合的间接效应。3. 使用Two-step MR：接着，我们单独考虑每个中介，并将其效果相加，以获得所有中介的综合间接效应。通过这些步骤，我们可以更好地理解一个因素是如何通过一个或多个中介变量影响另一个因素的，也能够计算相应的中介效应了。 💗注:中介孟德尔的挑战难度在于将内容详尽的传达给师弟师妹们，其实找到一个合适的选题以后，跟着上面的步骤一步步完成就行啦～ 加油！！！
28天内接收，刷新了个人纪录！虽然免除了版面费，但我并不完全满足，因为我还在期待一篇JCR一区杂志的回复。最近，我决定在小红书上更频繁地分享接收（Accept）的喜悦！接下来，我打算开始新一轮挑战——创作发表于一区（影响因子＞10）的论文。如往常一样，我欢迎大家来围观和支持！
这两天的工作和思路关系到选题，一定要认真学习。中介孟德尔随机化主要有两个思路：思路1:批量筛选中介变量和我们在挑战两样本时候一样，用到批量筛选中介的代码即可，参考范文：DOI: 10.1038/s41467-022-33675-1思路2:临床经验选题（根据已发表文章）如文章：DOI: 10.3390/nu14204434（炎症因子作为中介，可以套很多炎症性疾病） 为了能够快速的写出论文，批量筛选对于MAC来说就是折磨，不想再去酒店跑数据了。因此果断选择思路2，从别人的已经选为中介的数据入手，我没选炎症因子，而选了另外一篇文章的中介，用于我自己的研究去验证；我不担心跑出阴性结局，这个工作量加上我的选题临床上确实存在，所以要求低一点能够发出去。 “孟德尔随机化的目的是在暴露与结局之间进行因果推断的分析。暴露可以直接影响结局，也可以通过间接的途径影响结局。如果去除混杂因素的干扰，如何解释暴露对结果产生影响的途径呢？” 这段话就是中介孟德尔随机化的核心思路，理解了这段话，在掌握相关代码和写作能力，基本中介孟德尔随机化的5分到手。 💗注：小红薯的朋友们，新年的科研目标是什么？欢迎朋友们在评论区回答。
第2~3天！7天完成肠道菌群孟德尔随机化 这两天顺利完成了初步选题(3个)和肠道菌群数据下载(图1),初步分析期间电脑崩了一次，遂在线指导师弟分析，20分钟教会肠道菌群孟德尔随机化非常简单，看完这篇笔记，你就掌握啦(IF+5) 第一步、下载肠道菌群数据作为暴露(MiBioGen) 第二步、根据自己研究方向，下载结局数据或使用IEU结局数据(IEU数据加载太慢，我让师弟做的课题使用下载的数据，我继续使用在线数据库) 第三步、数据处理(过滤、协调、合并) 第四步、孟德尔随机化统计分析及结果可视化(森林图、散点图等) 需要注意的是，肠道菌群数据量比较大，常规跑循环时间太久，一报错前面的努力白费！因此建议大家通过分割肠道菌群数据，然后和结局做MR，得出结果。总体来说，肠道菌群难度很小，师弟二十分钟掌握后告诉我，还是我的光速攥写SCI论文有意思。事实也是如此，任何方法都有过时的一天，只要会快速写论文，方法学起来很快的。 ❤️注释:这样的挑战难度系数太低啦，后面让我的师弟师妹们来完成这样的挑战，选定课题，我来指导他们在规定时间内完成一篇SCI论文，你们想看吗？不管如何，这个挑战我会做完，三个选题，让师弟做一个，我自己做两个，哪个数据好看就写哪个~晚安~~
最近大家的孟德尔论文质量提升明显呀。即使是收稿量大的期刊（“水刊”）收到的孟德尔随机化的质量都还不错，工作量也有，唯一的局限性可能来源于研究方法本身。随着孟德尔随机化发表论文的增多，围绕着这种研究方法的争议也越来越多。我始终认为MR分析的价值不可替代~没有孟德尔的时候，你想研究喝酒和Ca，就要同时对每个人都统计喝不喝酒，得不得Ca，恰好没有同时存在这两个变量的公开数据，于是你累死累活的随访几年。 现在用两样本孟德尔就可以用别人统计过的饮酒数据，和另外一群人统计的Ca数据，就可以得出一个初步结论了。 但是未来的趋势也越来越明显，普通的孟德尔随机化研究的投稿难度加大，越来越难以成为医学生的第一篇SCI。 因此我们要做一个系列，教会我们的师妹师弟学会从0到1拥有第一篇SCI，感兴趣的可以关注！ 目前仍旧在更新中介孟德尔挑战~
2023年9月开始在小红书更新挑战，顺利挑战了各个类型的孟德尔随机化论文，也帮助一些师弟师妹完成了第一篇SCI论文，这让我感到充实，2024再接再厉。速度快是因为掌握了光速攥写SCI的能力，只需要MR跑出结果，就可以快速(光速)写出论文。2024开始新的挑战第1天:收集信息，检索关键词:“Mediating Mendelian Randomization”，发表的杂志影响因子在普降的情况下还不错，比如Aging Cell(lF:7.8,Q1)、Hypertension(lF:8.3,Q1)，后者投稿类型选的是meta-analysis,不是很懂，一篇没有用到meta分析方法的文章去选这个类型，关注我的师弟师妹投稿的时候一定要选择Original Research/Article.总文章1006篇，比起孟德尔随机化的近万篇，发挥空间还有不少，尤其细分到具体领域。同时还可以“摸着已经发表的文章过河”，快速的产出论文（IF较低，三四区）。除了检索信息，我还下载了10+近期中介孟德尔文献(pubmed检索后设置为publication date)，先精读，今天挑战就算开始啦！❤注:挑战时间为非工作时间，所有步骤都是现想(大家可以模仿我的科研思路，去年模仿我思路的师弟师妹很多也有文章了)，非已有课题，主打从0开始。欢迎大家围观！！！
新挑战启动：7天速成肠道菌群孟德尔随机化SCI论文第一天在小红书成功挑战并完成三篇孟德尔随机化论文后——涵盖了双样本、药物靶向和多变量——我已经证明了自己掌握了快速攥写SCI论文的能力。一旦MR分析完成，我就能迅速将成果转化为论文。今天，我迎来了新的挑战！**第1天：**我开始了信息收集工作。通过检索关键词“gut microbiota and Mendelian randomization”，我发现了多篇相关论文，发表在不同影响因子的期刊上，其中包括BMC Med（IF:9.3）、J Transl Med（IF:7.4），以及一些较低影响因子的期刊如Front Immunol（IF:7.3）。总共发现了123篇相关论文，相对于孟德尔随机化近万篇文献和多变量孟德尔随机化的1000+文献来说，肠道菌群孟德尔随机化的研究领域还是较少竞争的蓝海。此外，我还下载了10多篇近期的肠道菌群孟德尔随机化文献（在PubMed上设置按发布日期排序），准备精读。挑战正式开始！ ❤️注释：此次挑战将在非工作时间进行，所有步骤都是即兴发想（欢迎大家借鉴我的科研方法），从头开始，主打原创。期待大家的关注和支持，让我们一起见证这7天的科研旅程！
收到了一篇JAMA子刊的审稿任务，首先要恭喜作者！这篇论文正好是我所专长的领域，我很高兴接受这次审稿。我从不轻易给出拒绝，所以作者你可以先放宽心——至少可以期待一个小修或大修的机会（具体取决于论文的质量）。我将通过实际行动支持和鼓励小红书上每一个论文的Accept！