今日分享的这篇孟德尔随机化，是由中国学者发表在J Endocrinol Invest 上的关于糖网与三大常见的Psychiatric disorders 的因果关系的探讨。 我们由浅入深来探讨一下这篇文章 首先不难看出，这是一篇简单的两样本孟德尔随机化，暴露为糖网，数据来自FinnGen R9； 结局为MDD、anxiety ，以及BD (可细分为BD I以及BD II)。结果表明糖网可增BD，尤其是BD I的风险。接着进行敏感性分析，探讨结果是否稳固。至此呢，文章已经接近尾声，没有在进行深入剖析。 那如果是你来做这个题，该怎么设计呢？或者说，假如你是审稿人，这样的题，存在什么样的缺陷呢？ 菜菜子在这里简单分析一下。首先作为暴露，糖网这样的表型缺乏一定的纯粹性，因此呢从选题开始就注定存在争议了。到底是糖网中的糖引起的风险，还是糖网中的网引起的风险呢？对于这样一个题，这是我们需要去重点关注的一个点，因为审稿人可能会在这里跟你过不去。那作为研究者，我们在选择数据的时候，是否要去关注GWAS是否做了糖的矫正？做没做矫正对数据会带来什么bias，基于这样的前提去选择数据，才能体现我们对问题看的是否透彻，文章才能具备一定的严谨性。其次，为了区分是糖还是网所带来风险，我们应该怎么去设计这样一个研究？或者在研究之初，是否可以看透此缺陷并且备好对策来反驳审稿人的意见呢？ 课题设计的精妙之处就在于此。当然了，发表为王，文章都会存在一定缺陷的。只不过是，在设计之初，应当尽量减少给自己埋雷，这样投稿的过程将会顺利很多，这也是我在答疑过程中反复给初学的学员灌输的思想，不要急于求快，不然文章烂在手里是分分钟的事情。 觉得有用的欢迎点赞收藏转发。更多高质量学习欢迎报名加入。 欢迎联系我。
今日分享的是今年7月份发表在JAMA Network Open上的一篇孟德尔随机化，一作是老外本科生 (太卷啦太卷啦) 回到文章，文章标题在图一已经展示，这里不多做介绍，就简单讲一下做到我心坎上的几个点 1、文章撰写。无论是在框架上的布置安排，还是整体行文流畅度，都是值得我们好好学习的。这一点我是比较有感触的，前前后后也审了很多稿子，现在的要求只会是越来越高，在文章呈现上一点马虎不得。 2、多重数据验证的处理方式，跟我的一篇文章极为相似。 3、在最后的中介分析上，作者做了非常详细的阐述，让人一目了然。 4、也是最重要的一点，整篇文章从头到尾展示的，都是极具设计感的。孟德尔随机化发展到目前这个状况，之所以让人产生审美疲劳，有很大一个原因就是大多数文章毫无设计，以至于很多杂志在看到这类文章都直接劝退，我相信有很多投稿以后直接desk rejection的例子。 欢迎联系我。
这两天顺利完成了初步选题(3个)和肠道菌群数据下载(图1),初步分析期间电脑崩了一次，遂在线指导师弟分析，20分钟教会 肠道菌群孟德尔随机化非常简单，看完这篇笔记，你就掌握啦(IF+5) 第一步、下载肠道菌群数据作为暴露(MiBioGen) 第二步、根据自己研究方向，下载结局数据或使用IEU结局数据(IEU数据加载太慢，我让师弟做的课题使用下载的数据，我继续使用在线数据库)第三步、数据处理(过滤、协调、合并)第四步、孟德尔随机化统计分析及结果可视化(森林图、散点图等) 需要注意的是，肠道菌群数据量比较大，常规跑循环时间太久，一报错前面的努力白费！因此建议大家通过分割肠道菌群数据，然后和结局做MR，得出结果。 总体来说，肠道菌群难度很小，师弟二十分钟掌握后告诉我，还是我的光速攥写SCI论文有意思。事实也是如此，任何方法都有过时的一天，只要会快速写论文，方法学起来很快的。 ❤️注释:这样的挑战难度系数太低啦，后面让我的师弟师妹们来完成这样的挑战，选定课题，我来指导他们在规定时间内完成一篇SCI论文，你们想看吗？ 不管如何，这个挑战我会做完，三个选题，让师弟做一个，我自己做两个，哪个数据好看就写哪个~ 晚安~~ 欢迎联系我。
不要版面费，也没有很快乐，因为在等一篇JCR一区杂志的信息。最近决定多到小红书接Accept了！ 同时下一轮开始挑战创作一区(＞10)的论文啦，照旧欢迎围观！ 欢迎联系我。
汇报第7日挑战内容:1、AIGC自动添加文献引用(高效率引用添加方案)2、结构化语句添加(伦理、致谢、贡献、利益说明等:复制、粘贴)3、选刊(继续自动匹配杂志)4、根据目标期刊进一步润色 分享肠道菌群孟德尔随机化(GutMR)核心思路:一句话:就是很简单的两样本孟德尔随机化，只是暴露换成肠道菌群或者结局换成肠道菌群，作为暴露(p1值设定=1e-5，mibiogen下载即可)。结局数据可IEU，也可自行下载。论文攥写:精细阅读2-3篇肠道菌群孟德尔随机化范文，提取出写作框架，根据自己的研究填充框架，再精细修改一下，就完成啦！ 总之，掌握核心思路和拿到代码包后，就是非常简单的IF3~5到手，想要更高分的可以去模仿国外研究者写的论文的配图(非常好看，高分值得) ❤️注释:指导的师弟师妹们也完成投稿啦，投稿杂志IF均大于10分，3~4周成稿、润色、投稿~ 欢迎联系我。
不要版面费，也没有很快乐，因为在等一篇JCR一区杂志的信息。最近决定多到小红书接Accept了！ 同时下一轮开始挑战创作一区(＞10)的论文啦，照旧欢迎围观！
汇报第7日挑战内容:1、AIGC自动添加文献引用(高效率引用添加方案)2、结构化语句添加(伦理、致谢、贡献、利益说明等:复制、粘贴)3、选刊(继续自动匹配杂志)4、根据目标期刊进一步润色 分享肠道菌群孟德尔随机化(GutMR)核心思路:一句话:就是很简单的两样本孟德尔随机化，只是暴露换成肠道菌群或者结局换成肠道菌群，作为暴露(p1值设定=1e-5，mibiogen下载即可)。结局数据可IEU，也可自行下载。论文攥写:精细阅读2-3篇肠道菌群孟德尔随机化范文，提取出写作框架，根据自己的研究填充框架，再精细修改一下，就完成啦！ 总之，掌握核心思路和拿到代码包后，就是非常简单的IF3~5到手，想要更高分的可以去模仿国外研究者写的论文的配图(非常好看，高分值得) ❤️注释:指导的师弟师妹们也完成投稿啦，投稿杂志IF均大于10分，3~4周成稿、润色、投稿~
汇报今日内容:完成文献引用添加(Endnote20)、结构性语句添加(伦理、致谢、贡献、利益说明)、选刊(根据方式2:AIGC自动匹配选刊,方式1以前介绍过)、根据目标期刊要求进一步润色 分享多变量孟德尔随机化(MVMR)核心思路: 在临床研究和MR研究中，我们习惯性的先研究一个因素（单变量）,然后将多个因素合并（多变量）一起分析，达到一个1+1=2或者1+1>2的效果。 多变量孟德尔随机化并不关注他们的整体效果，而关注他们在整体中各自的效果，谁为整体贡献的效应多，实际上更像一种竞争关系，起到校正作用。 多变量MR的核心依赖于一些基因变异与某些暴露的相关性比与其他暴露的相关性更强(我们的主要结论) 理解上面这段话，拿到代码就可以做多变量孟德尔随机化研究，5分到手。 ❤️注:这阵子用于修稿、审稿的时间花费太多，写这篇多变量孟德尔随机化的时间累计大概率不超过7天。 接下来，朋友们想看我挑战写什么呢，欢迎联系我。
这两天顺利完成了初步选题(3个)和肠道菌群数据下载(图1),初步分析期间电脑崩了一次，遂在线指导师弟分析，20分钟教会 肠道菌群孟德尔随机化非常简单，看完这篇笔记，你就掌握啦(IF+5) 第一步、下载肠道菌群数据作为暴露(MiBioGen) 第二步、根据自己研究方向，下载结局数据或使用IEU结局数据(IEU数据加载太慢，我让师弟做的课题使用下载的数据，我继续使用在线数据库)第三步、数据处理(过滤、协调、合并)第四步、孟德尔随机化统计分析及结果可视化(森林图、散点图等) 需要注意的是，肠道菌群数据量比较大，常规跑循环时间太久，一报错前面的努力白费！因此建议大家通过分割肠道菌群数据，然后和结局做MR，得出结果。 总体来说，肠道菌群难度很小，师弟二十分钟掌握后告诉我，还是我的光速攥写SCI论文有意思。事实也是如此，任何方法都有过时的一天，只要会快速写论文，方法学起来很快的。 ❤️注释:这样的挑战难度系数太低啦，后面让我的师弟师妹们来完成这样的挑战，选定课题，我来指导他们在规定时间内完成一篇SCI论文，你们想看吗？ 不管如何，这个挑战我会做完，三个选题，让师弟做一个，我自己做两个，哪个数据好看就写哪个~ 晚安~~
1. 起始阶段：主题选择与文献查找• Google Scholar/百度学术：作为查找相关文献的强大工具，可以帮助你了解你研究主题的现有研究状况。• ResearchGate：在这里，你可以与其他研究者互动并获取他们的论文或数据。2. 组织和管理参考文献• Zotero/EndNote：这些引用管理工具可以帮助你整理和格式化你的参考文献。• Mendeley：除了参考文献管理，Mendeley也提供了社交网络特性，方便学术交流。3. 写作阶段• Grammarly：这个在线工具可以帮你检查语法和拼写错误，并提供改进建议。• Hemingway Editor：一个用于提高文本可读性的工具，它将突出显示过于复杂的句子和常用错误。4. 合作和共享• Google Docs：允许多人实时协作，同时也方便对版本的管理和追踪。• Overleaf：一个在线LaTeX编辑器，允许多人协作，并提供了大量模板。5. 数据分析和可视化• R/RStudio：使用R进行数据分析，并利用ggplot2包创建优雅的数据可视化。• Python/Jupyter Notebooks：为数据分析和机器学习提供强大的支持，且能创建包含代码、图形和文本的动态文档。6. 提交和发表• Journal/Author Name Estimator (JANE)：基于你的标题或摘要，JANE可以帮你找到可能感兴趣的期刊。•…